当前蛋白身份：D0EPS0
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3J35 Cryo-EM reconstruction of Dengue virus at 37 C 提交 2013-02-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric（180） 与蛋白数一致 |
链 A
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
链 B
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
链 C
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
NTE；pH 7.3；NTE
cryo-EM玻璃化条件
100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane using a homemade plunger.
|
分辨率 35.00 Å |
| 3J35 Cryo-EM reconstruction of Dengue virus at 37 C 提交 2013-02-24 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
链 B
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
链 C
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
NTE；pH 7.3；NTE
cryo-EM玻璃化条件
100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane using a homemade plunger.
|
分辨率 35.00 Å |
| 3J35 Cryo-EM reconstruction of Dengue virus at 37 C 提交 2013-02-24 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 A
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
链 B
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
链 C
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
NTE；pH 7.3；NTE
cryo-EM玻璃化条件
100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane using a homemade plunger.
|
分辨率 35.00 Å |
| 3J35 Cryo-EM reconstruction of Dengue virus at 37 C 提交 2013-02-24 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
链 B
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
链 C
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
NTE；pH 7.3；NTE
cryo-EM玻璃化条件
100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane using a homemade plunger.
|
分辨率 35.00 Å |
| 3J35 Cryo-EM reconstruction of Dengue virus at 37 C 提交 2013-02-24 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
链 B
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
链 C
281–675（395 aa）
片段：UNP residues 281-675
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
NTE；pH 7.3；NTE
cryo-EM玻璃化条件
100 K；冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane using a homemade plunger.
|
分辨率 35.00 Å |
| 6WER DENV2 NS1 in complex with neutralizing 2B7 Fab fragment 提交 2020-04-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
775–1127（353 aa）
链 B
775–1127（353 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；293 K；23% PEG 3350, 0.25 M MgCl2, 0.1 M sodium acetate pH 5.2
|
分辨率 3.96 Å R-free 0.311 |
| 6WY1 Crystal structure of an engineered thermostable dengue virus 2 envelope protein dimer 提交 2020-05-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
281–677（397 aa）
|
突变：G106D, A259W, T262R, F279W, T280P | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；296 K；15% PEG 3350 pH 4.4, 0.1M Sodium Acetate Trihydrate + 0.1M Sodium Iodide
|
分辨率 3.42 Å R-free 0.337 |
| 6ZQU Cryo-EM structure of mature Dengue virus 2 at 3.1 angstrom resolution 提交 2020-07-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric（360） 与蛋白数一致 |
链 A
281–775（495 aa）
链 C
281–775（495 aa）
链 E
281–775（495 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 360 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7K93 DENV2 NS1 in complex with neutralizing 2B7 single chain Fab variable region (scFv) 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
775–1127（353 aa）
链 B
775–1127（353 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；50 mM Tris pH 8.5, 50 mM (NH4)2SO4, 10% (v/v) glycerol
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.269 |
| 7K93 DENV2 NS1 in complex with neutralizing 2B7 single chain Fab variable region (scFv) 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
775–1127（353 aa）
链 D
775–1127（353 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；50 mM Tris pH 8.5, 50 mM (NH4)2SO4, 10% (v/v) glycerol
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.269 |