当前蛋白身份：D3XFN5
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6KDJ HIV-1 reverse transcriptase with Q151M/Y115F/F116Y:DNA:lamivudine 5'-triphosphate ternary complex 提交 2019-07-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 待复核 |
链 A
100–654（555 aa）
|
突变：Y214F, F215Y, Q250M, C261S, C379S | 1RZ Lamivudine Triphosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BIS-TRIS-HCL, DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, MGCL2, PEG 6000, SUCROSE, GLYCEROL
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.230 |
| 6KDJ HIV-1 reverse transcriptase with Q151M/Y115F/F116Y:DNA:lamivudine 5'-triphosphate ternary complex 提交 2019-07-02 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
100–654（555 aa）
|
突变：Y214F, F215Y, Q250M, C261S, C379S | 1RZ Lamivudine Triphosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BIS-TRIS-HCL, DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, MGCL2, PEG 6000, SUCROSE, GLYCEROL
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.230 |
| 6KDK HIV-1 reverse transcriptase with Q151M/Y115F/F116Y:DNA:dCTP ternary complex 提交 2019-07-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 待复核 |
链 A
100–654（555 aa）
|
突变：Q214M, Y215F, F250Y, C261S, C379S | DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BIS-TRIS-HCL, DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, MGCL2, PEG 6000, SUCROSE, GLYCEROL
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.234 |
| 6KDK HIV-1 reverse transcriptase with Q151M/Y115F/F116Y:DNA:dCTP ternary complex 提交 2019-07-02 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
100–654（555 aa）
|
突变：Q214M, Y215F, F250Y, C261S, C379S | DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BIS-TRIS-HCL, DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, MGCL2, PEG 6000, SUCROSE, GLYCEROL
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.234 |
| 6KDM HIV-1 reverse transcriptase with Q151M/Y115F/F116Y:DNA:entecavir 5'-triphosphate ternary complex 提交 2019-07-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
100–654（555 aa）
|
突变：Y214F, F215Y, Q250M, C261S, C379S | GOL GLYCEROL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ET9 [[(1R,3S,5S)-3-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3H-purin-9-yl)-2-methylidene-5-oxidanyl-cyclopentyl]methoxy-oxidanyl-phosphory l] phosphono hydrogen phosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BIS-TRIS-HCL, DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, MGCL2, PEG 6000, SUCROSE, GLYCEROL
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.223 |
| 6KDM HIV-1 reverse transcriptase with Q151M/Y115F/F116Y:DNA:entecavir 5'-triphosphate ternary complex 提交 2019-07-02 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
100–654（555 aa）
|
突变：Y214F, F215Y, Q250M, C261S, C379S | GOL GLYCEROL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ET9 [[(1R,3S,5S)-3-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3H-purin-9-yl)-2-methylidene-5-oxidanyl-cyclopentyl]methoxy-oxidanyl-phosphory l] phosphono hydrogen phosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BIS-TRIS-HCL, DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, MGCL2, PEG 6000, SUCROSE, GLYCEROL
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.223 |
| 6KDN HIV-1 reverse transcriptase with Q151M/Y115F/F116Y:DNA:dGTP ternary complex 提交 2019-07-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
100–654（555 aa）
|
突变：Y214F, F215Y, Q250M, C261S, C379S | MG MAGNESIUM ION × 1 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BIS-TRIS-HCL, DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, MGCL2, PEG 6000, SUCROSE, GLYCEROL
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 6KDN HIV-1 reverse transcriptase with Q151M/Y115F/F116Y:DNA:dGTP ternary complex 提交 2019-07-02 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
100–654（555 aa）
|
突变：Y214F, F215Y, Q250M, C261S, C379S | MG MAGNESIUM ION × 1 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BIS-TRIS-HCL, DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, MGCL2, PEG 6000, SUCROSE, GLYCEROL
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 6KDO HIV-1 reverse transcriptase with Q151M/Y115F/F116Y/M184V/F160M:DNA:lamivudine 5'-triphosphate ternary complex 提交 2019-07-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 待复核 |
链 A
100–654（555 aa）
|
突变：Y214F, F215Y, Q250M, F259M, C261S, M283V, C379S | GOL GLYCEROL × 2 1RZ Lamivudine Triphosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BIS-TRIS-HCL, DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, MGCL2, PEG 6000, SUCROSE, GLYCEROL
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.230 |
| 6KDO HIV-1 reverse transcriptase with Q151M/Y115F/F116Y/M184V/F160M:DNA:lamivudine 5'-triphosphate ternary complex 提交 2019-07-02 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
100–654（555 aa）
|
突变：Y214F, F215Y, Q250M, F259M, C261S, M283V, C379S | GOL GLYCEROL × 2 1RZ Lamivudine Triphosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BIS-TRIS-HCL, DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, MGCL2, PEG 6000, SUCROSE, GLYCEROL
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.230 |
| 7DBM HIV-1 reverse transcriptase mutant Q151M/Y115F/F116Y/M184V:DNA:dGTP ternary complex 提交 2020-10-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
100–654（555 aa）
|
突变：Q250M,Y214F,F215Y,M283V,C261S,C379S | DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BIS-TRIS-HCL, DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, MGCL2, PEG 6000, SUCROSE, GLYCEROL
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.224 |
| 7DBM HIV-1 reverse transcriptase mutant Q151M/Y115F/F116Y/M184V:DNA:dGTP ternary complex 提交 2020-10-21 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
100–654（555 aa）
|
突变：Q250M,Y214F,F215Y,M283V,C261S,C379S | DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BIS-TRIS-HCL, DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, MGCL2, PEG 6000, SUCROSE, GLYCEROL
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.224 |
| 7DBN HIV-1 reverse transcriptase mutant Q151M/Y115F/F116Y/M184V/F160M:DNA:dCTP ternary complex 提交 2020-10-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
100–654（555 aa）
|
未记录 | DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BIS-TRIS-HCL, DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, MGCL2, PEG 6000, SUCROSE, GLYCEROL
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.225 |
| 7DBN HIV-1 reverse transcriptase mutant Q151M/Y115F/F116Y/M184V/F160M:DNA:dCTP ternary complex 提交 2020-10-21 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
100–654（555 aa）
|
未记录 | DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；BIS-TRIS-HCL, DI-AMMONIUM HYDROGEN CITRATE, MGCL2, PEG 6000, SUCROSE, GLYCEROL
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.225 |
| 8X1Z HIV-1 reverse transcriptase mutant Q151M/Y115F/F116Y:DNA:E-CFCP-TP ternary complex 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
100–654（555 aa）
|
突变：Y115F, F116Y, Q151M, C162S, C280S | GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 XTE E-CFCP-triphosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；bis-tris-HCl, di-ammonium hydrogen citrate, MgCl2, PEG6000, sucrose, glycerol
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.223 |
| 8X1Z HIV-1 reverse transcriptase mutant Q151M/Y115F/F116Y:DNA:E-CFCP-TP ternary complex 提交 2023-11-09 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
100–654（555 aa）
|
突变：Y115F, F116Y, Q151M, C162S, C280S | GOL GLYCEROL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 XTE E-CFCP-triphosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；bis-tris-HCl, di-ammonium hydrogen citrate, MgCl2, PEG6000, sucrose, glycerol
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.223 |
| 8X20 HIV-1 reverse transcriptase mutant Q151M/Y115F/F116Y/L74V:DNA:E-CFCP-TP ternary complex 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
100–654（555 aa）
|
突变：L74V, Y115F, F116Y, Q151M, C162S, C280S | XTE E-CFCP-triphosphate × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；bis-tris-HCl, di-ammonium hydrogen citrate, MgCl2, PEG6000, sucrose, glycerol
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.231 |
| 8X20 HIV-1 reverse transcriptase mutant Q151M/Y115F/F116Y/L74V:DNA:E-CFCP-TP ternary complex 提交 2023-11-09 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
100–654（555 aa）
|
突变：L74V, Y115F, F116Y, Q151M, C162S, C280S | XTE E-CFCP-triphosphate × 1 GOL GLYCEROL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；bis-tris-HCl, di-ammonium hydrogen citrate, MgCl2, PEG6000, sucrose, glycerol
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.231 |
| 8X21 HIV-1 reverse transcriptase mutant Q151M/Y115F/F116Y/L74V:DNA:ETV-TP ternary complex 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
100–654（555 aa）
|
突变：L74V, Y115F, F116Y, Q151M, C162S, C280S | ET9 [[(1R,3S,5S)-3-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3H-purin-9-yl)-2-methylidene-5-oxidanyl-cyclopentyl]methoxy-oxidanyl-phosphory l] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；bis-tris-HCl, di-ammonium hydrogen citrate, MgCl2, PEG6000, sucrose, glycerol
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.218 |
| 8X21 HIV-1 reverse transcriptase mutant Q151M/Y115F/F116Y/L74V:DNA:ETV-TP ternary complex 提交 2023-11-09 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
100–654（555 aa）
|
突变：L74V, Y115F, F116Y, Q151M, C162S, C280S | ET9 [[(1R,3S,5S)-3-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3H-purin-9-yl)-2-methylidene-5-oxidanyl-cyclopentyl]methoxy-oxidanyl-phosphory l] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；bis-tris-HCl, di-ammonium hydrogen citrate, MgCl2, PEG6000, sucrose, glycerol
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.218 |
| 8X22 HIV-1 reverse transcriptase mutant Q151M/Y115F/F116Y/L74V:DNA:dGTP ternary complex 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
100–654（555 aa）
|
突变：L74V, Y115F, F116Y, Q151M, C162S, C280S | DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；bis-tris-HCl, di-ammonium hydrogen citrate, MgCl2, PEG6000, sucrose, glycerol
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.219 |
| 8X22 HIV-1 reverse transcriptase mutant Q151M/Y115F/F116Y/L74V:DNA:dGTP ternary complex 提交 2023-11-09 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
100–654（555 aa）
|
突变：L74V, Y115F, F116Y, Q151M, C162S, C280S | DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；bis-tris-HCl, di-ammonium hydrogen citrate, MgCl2, PEG6000, sucrose, glycerol
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.219 |