当前蛋白身份：G0S387
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5IC8 Structure of UTP6 提交 2016-02-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
81–414（334 aa）
片段：UNP residues 81-414
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES sodium, 10% 2-proponal, 20% PEG 4000, 0.05M sodium fluoride
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.255 |
| 5IC8 Structure of UTP6 提交 2016-02-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
81–414（334 aa）
片段：UNP residues 81-414
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES sodium, 10% 2-proponal, 20% PEG 4000, 0.05M sodium fluoride
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.255 |
| 5IC8 Structure of UTP6 提交 2016-02-23 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
81–414（334 aa）
片段：UNP residues 81-414
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES sodium, 10% 2-proponal, 20% PEG 4000, 0.05M sodium fluoride
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.255 |
| 5IC8 Structure of UTP6 提交 2016-02-23 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
81–414（334 aa）
片段：UNP residues 81-414
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES sodium, 10% 2-proponal, 20% PEG 4000, 0.05M sodium fluoride
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.255 |
| 5IC8 Structure of UTP6 提交 2016-02-23 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
81–414（334 aa）
片段：UNP residues 81-414
链 D
81–414（334 aa）
片段：UNP residues 81-414
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES sodium, 10% 2-proponal, 20% PEG 4000, 0.05M sodium fluoride
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.255 |
| 5IC8 Structure of UTP6 提交 2016-02-23 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
81–414（334 aa）
片段：UNP residues 81-414
链 C
81–414（334 aa）
片段：UNP residues 81-414
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES sodium, 10% 2-proponal, 20% PEG 4000, 0.05M sodium fluoride
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.255 |
| 5OQL Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome from Chaetomium thermophilum 提交 2017-08-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6RXT Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state A 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 UF
1–414（414 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6RXU Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state B1 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：66-meric（66） 与全部聚合物一致 |
链 UF
1–414（414 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6RXV Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state B2 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致 |
链 UF
1–414（414 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6RXX Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state C, Poly-Ala 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致 |
链 UF
1–414（414 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 6RXY Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state a 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 UF
1–414（414 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 6RXZ Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state b 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致 |
链 UF
1–414（414 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |