当前蛋白身份：G0S4M2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6EMF Crystal structure of Rrp1 from Chaetomium thermophilum in space group C2 提交 2017-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–282（282 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；200 mM Proline
100 mM HEPES pH 7.5
10% PEG3350
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.232 |
| 6EMF Crystal structure of Rrp1 from Chaetomium thermophilum in space group C2 提交 2017-10-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–282（282 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PRO PROLINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；200 mM Proline
100 mM HEPES pH 7.5
10% PEG3350
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.232 |
| 6EMG Crystal structure of Rrp1 from Chaetomium thermophilum in space group P6322 提交 2017-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–282（282 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.8M K-H2PO4
0.8M Na-H2PO4
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.207 |
| 6EMG Crystal structure of Rrp1 from Chaetomium thermophilum in space group P6322 提交 2017-10-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–282（282 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.8M K-H2PO4
0.8M Na-H2PO4
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.207 |
| 8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物一致 |
链 Cc
1–282（282 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric（49） 与全部聚合物一致 |
链 Cc
1–282（282 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8I9T Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-1 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 Cc
1–282（282 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 Cc
1–282（282 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |