当前蛋白身份:G0S4Z9
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 46 PDB 声明:49-meric(49) 与全部聚合物一致 |
链 Lq
1–217(217 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8I9T Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-1 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 Lq
1–217(217 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致 |
链 Lq
1–217(217 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:52-meric(52) 与全部聚合物一致 |
链 Lq
1–217(217 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:60-meric(60) 与全部聚合物一致 |
链 Lq
1–217(217 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 57 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致 |
链 Lq
1–217(217 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:60-meric(60) 与全部聚合物一致 |
链 Lq
1–217(217 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 62 PDB 声明:64-meric(64) 与全部聚合物一致 |
链 Lq
1–217(217 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 62 PDB 声明:66-meric(66) 与全部聚合物一致 |
链 Lr
1–217(217 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:64-meric(64) 与全部聚合物一致 |
链 Lr
1–217(217 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 57 PDB 声明:60-meric(60) 与全部聚合物一致 |
链 Lt
1–217(217 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.91 Å |
| 8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:60-meric(60) 与全部聚合物一致 |
链 Lr
1–217(217 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.55 Å |