当前蛋白身份:G0S5L1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5JPQ Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome 提交 2016-05-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致 |
链 G
1–1802(1802 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.30 Å |
| 5OQL Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome from Chaetomium thermophilum 提交 2017-08-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 G
1–1802(1802 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 5WY3 Crystal structure of Chaetomium thermophilum Utp10 middle domain 提交 2017-01-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
472–872(401 aa)
片段:UNP residues 472-872
链 B
472–872(401 aa)
片段:UNP residues 472-872
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Hepes-Na, 2.0 M ammonium sulfate
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分辨率 3.20 Å R-free 0.266 |
| 5WY4 Crystal structure of Chaetomium thermophilum Utp10 N-terminal domain 提交 2017-01-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–471(471 aa)
片段:N-terminal domain, UNP residues 1-471
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293 K;0.1 M sodium citrate, 1.0 M ammonium dihydrogen phosphate
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分辨率 2.50 Å R-free 0.264 |
| 5WYL Crystal structure of Chaetomium thermophilum Utp10 N-terminal domain in complex with Utp17 C-terminal helices 提交 2017-01-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–471(471 aa)
片段:N-terminal domain, UNP residues 1-471
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M Hepes-Na, 20% w/v PEG 8000
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.267 |
| 5WYL Crystal structure of Chaetomium thermophilum Utp10 N-terminal domain in complex with Utp17 C-terminal helices 提交 2017-01-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
1–471(471 aa)
片段:N-terminal domain, UNP residues 1-471
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M Hepes-Na, 20% w/v PEG 8000
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.267 |
| 6RXT Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state A 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 55 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致 |
链 UJ
1–1802(1802 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6RXU Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state B1 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 64 PDB 声明:66-meric(66) 与全部聚合物一致 |
链 UJ
1–1802(1802 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6RXV Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state B2 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 66 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致 |
链 UJ
1–1802(1802 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6RXX Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state C, Poly-Ala 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 66 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致 |
链 UJ
1–1802(1802 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 6RXY Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state a 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 57 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致 |
链 UJ
1–1802(1802 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.70 Å |
| 6RXZ Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state b 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 66 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致 |
链 UJ
1–1802(1802 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |