当前蛋白身份:G0S5L1 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5JPQ Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome 提交 2016-05-04 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致
链 G 1–1802(1802 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
5OQL Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome from Chaetomium thermophilum 提交 2017-08-12 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致
链 G 1–1802(1802 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
5WY3 Crystal structure of Chaetomium thermophilum Utp10 middle domain 提交 2017-01-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 472–872(401 aa) 片段:UNP residues 472-872
链 B 472–872(401 aa) 片段:UNP residues 472-872
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Hepes-Na, 2.0 M ammonium sulfate
分辨率 3.20 Å R-free 0.266
5WY4 Crystal structure of Chaetomium thermophilum Utp10 N-terminal domain 提交 2017-01-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–471(471 aa) 片段:N-terminal domain, UNP residues 1-471
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293 K;0.1 M sodium citrate, 1.0 M ammonium dihydrogen phosphate
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
5WYL Crystal structure of Chaetomium thermophilum Utp10 N-terminal domain in complex with Utp17 C-terminal helices 提交 2017-01-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–471(471 aa) 片段:N-terminal domain, UNP residues 1-471
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M Hepes-Na, 20% w/v PEG 8000
分辨率 2.64 Å R-free 0.267
5WYL Crystal structure of Chaetomium thermophilum Utp10 N-terminal domain in complex with Utp17 C-terminal helices 提交 2017-01-13 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–471(471 aa) 片段:N-terminal domain, UNP residues 1-471
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M Hepes-Na, 20% w/v PEG 8000
分辨率 2.64 Å R-free 0.267
6RXT Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state A 提交 2019-06-10 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 55 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致
链 UJ 1–1802(1802 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6RXU Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state B1 提交 2019-06-10 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 64 PDB 声明:66-meric(66) 与全部聚合物一致
链 UJ 1–1802(1802 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RXV Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state B2 提交 2019-06-10 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 66 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致
链 UJ 1–1802(1802 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6RXX Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state C, Poly-Ala 提交 2019-06-10 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 66 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致
链 UJ 1–1802(1802 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
6RXY Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state a 提交 2019-06-10 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 57 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致
链 UJ 1–1802(1802 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6RXZ Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state b 提交 2019-06-10 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 66 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致
链 UJ 1–1802(1802 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å