当前蛋白身份:G0S5S6 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4GMN Structural basis of Rpl5 recognition by Syo1 提交 2012-08-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–676(676 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.1 M succinic acid pH 7.0, 20% (v/v) PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.95 Å R-free 0.259
4GMO Crystal structure of Syo1 提交 2012-08-16 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–676(676 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.7;291 K;0.2 M potassium acetate, 20% (v/v) PEG 3350, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.10 Å R-free 0.256
5AFF Symportin 1 chaperones 5S RNP assembly during ribosome biogenesis by occupying an essential rRNA binding site 提交 2015-01-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 24–676(653 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SODIUM ACETATE, 8% (V/V) PEG 4000
分辨率 3.40 Å R-free 0.300
7OZS Structure of the hexameric 5S RNP from C. thermophilum 提交 2021-06-28 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:heptameric(7) 与全部聚合物一致
链 F 1–676(676 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å