当前蛋白身份:G0S5S6
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4GMN Structural basis of Rpl5 recognition by Syo1 提交 2012-08-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–676(676 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.1 M succinic acid pH 7.0, 20% (v/v) PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.95 Å R-free 0.259 |
| 4GMO Crystal structure of Syo1 提交 2012-08-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–676(676 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.7;291 K;0.2 M potassium acetate, 20% (v/v) PEG 3350, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.10 Å R-free 0.256 |
| 5AFF Symportin 1 chaperones 5S RNP assembly during ribosome biogenesis by occupying an essential rRNA binding site 提交 2015-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
24–676(653 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.1 M SODIUM ACETATE, 8% (V/V) PEG 4000
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分辨率 3.40 Å R-free 0.300 |
| 7OZS Structure of the hexameric 5S RNP from C. thermophilum 提交 2021-06-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:heptameric(7) 与全部聚合物一致 |
链 F
1–676(676 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.50 Å |