当前蛋白身份:G1U0Y5 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 LL 1–149(149 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 LL 1–149(149 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 34 PDB 声明:37-meric(37) 与全部聚合物一致
链 L 1–149(149 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:51-meric(51) 与全部聚合物一致
链 M 1–149(149 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 34 PDB 声明:36-meric(36) 与全部聚合物一致
链 L 1–149(149 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å