当前蛋白身份：G3I8R9
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5O4P Crystal structure of AMPylated GRP78 提交 2017-05-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–549（522 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；1.5M Lithium Sulfate, 0.1M HEPES pH7.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.212 |
| 5O4P Crystal structure of AMPylated GRP78 提交 2017-05-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
28–549（522 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；1.5M Lithium Sulfate, 0.1M HEPES pH7.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.212 |
| 6EOB Crystal structure of AMPylated GRP78 in apo form (Crystal form 1) 提交 2017-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–549（522 aa）
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG1000, 0.1M NaKHPO4, PH6.2, 0.1M NaCl
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.280 |
| 6EOC Crystal structure of AMPylated GRP78 in apo form (Crystal form 2) 提交 2017-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–549（522 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；293 K；5% PEG1000, 0.1M Na2HPO4-Citrate, ph4.2, 0.2M LI2SO4
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分辨率 1.67 Å R-free 0.249 |
| 6EOE Crystal structure of AMPylated GRP78 with nucleotide 提交 2017-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–549（522 aa）
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未记录 | FLC CITRATE ANION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；5%PEG1000, 0.1M Na2HPO4-Citrate, PH4.2, 0.2M Li2SO4
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分辨率 1.71 Å R-free 0.246 |
| 6EOF Crystal structure of AMPylated GRP78 in ADP state 提交 2017-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–549（522 aa）
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.4；293 K；9% PEG1000, 0.1M Na2HPO4-Citrate, ph4.4, 0.2M Li2SO4
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分辨率 1.59 Å R-free 0.225 |
| 6H9U Crystal structure of the BiP NBD and MANF SAP complex 提交 2018-08-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–413（386 aa）
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未记录 | MLT D-MALATE × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.92 M sodium malonate
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分辨率 1.57 Å R-free 0.204 |
| 6HA7 Crystal structure of the BiP NBD and MANF complex 提交 2018-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–413（386 aa）
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；7% PEG6000, 0.1 M Tris-HCl pH7.5
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分辨率 2.49 Å R-free 0.256 |
| 6HA7 Crystal structure of the BiP NBD and MANF complex 提交 2018-08-07 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
28–413（386 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；7% PEG6000, 0.1 M Tris-HCl pH7.5
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.256 |
| 6HAB Crystal structure of BiP V461F (apo) 提交 2018-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–549（522 aa）
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突变：V461F | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；8% PEG1000, 0.1M Tris-HCl pH8.5
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分辨率 2.08 Å R-free 0.271 |
| 6ZYH Crystal structure of GRP78 (70kDa heat shock protein 5 / BiP) ATPase domain in complex with ADP and calcium 提交 2020-08-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–406（379 aa）
链 B
28–406（379 aa）
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；26% PEG6000, 0.2M CaCl2, 0.1MNaOAc Ph5
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分辨率 1.88 Å R-free 0.225 |
| 7A4U Crystal structure of lid-truncated apo BiP in an oligomeric state 提交 2020-08-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–549（522 aa）
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突变：T229A, V461F | GOL GLYCEROL × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.5, 0.2 M trisodium citrate dihydrate, 20% PEG 3350
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分辨率 1.77 Å R-free 0.217 |
| 7A4V Crystal structure of lid-truncated ADP-bound BiP in an oligomeric state 提交 2020-08-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–549（522 aa）
|
突变：T229A, V461F | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 4 K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.2 M potassium citrate tribasic monohydrate, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.226 |
| 7B7Z DeAMPylation complex of monomeric FICD and AMPylated BiP (state 1) 提交 2020-12-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
28–549（522 aa）
|
突变：T229A, V461F | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES pH 6.5
10% PEG 4000
0.2 M NaCl
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.221 |
| 7B80 DeAMPylation complex of monomeric FICD and AMPylated BiP (state 2) 提交 2020-12-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
28–549（522 aa）
|
突变：T229A, V461F | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 K POTASSIUM ION × 3 P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.1 M Tris pH 8.0
25% PEG 400
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.228 |