当前蛋白身份：G3V9C5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5VII Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, 4-(3-fluoropropyl)phenyl-ACEPC 提交 2017-04-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
504–645（142 aa）
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未记录 | GLY GLYCINE × 1 5DY 5-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-1-[4-(3-fluoropropyl)phenyl]-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonia Acetate, PEG 4000
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分辨率 1.95 Å R-free 0.259 |
| 6ODL Crystal structure of GluN2A agonist binding domain with 4-butyl-(S)-CCG-IV 提交 2019-03-26 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
504–644（141 aa）
链 B
504–644（141 aa）
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未记录 | M7V (1S,2R)-2-[(S)-amino(carboxy)methyl]-1-butylcyclopropane-1-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M AMMONIUM SULFATE AND 16-22% PEG 4000
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分辨率 2.30 Å R-free 0.283 |
| 7YFI Structure of the Rat tri-heteromeric GluN1-GluN2A-GluN2C NMDA receptor in complex with glycine and glutamate 提交 2022-07-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 GLY GLYCINE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.30 Å |
| 9GIB NMDA bound to compound 380 提交 2024-08-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
401–539（139 aa）
链 A
661–802（142 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 A1ILP (2~{R})-2-azanyl-3-[[3-(5-ethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-fluoranyl-phenyl]carbonylamino]propanoic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；282.15 K；10-15% PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.0, 1 mM sodium azide, 1% tryptone
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分辨率 1.95 Å R-free 0.256 |
| 9GIG NMDA bound to compound 387 提交 2024-08-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
401–539（139 aa）
链 A
661–802（142 aa）
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未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 1 A1ILO (2~{R})-2-azanyl-3-[[3-(5-ethyl-3-methyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-fluoranyl-phenyl]carbonylamino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；282.15 K；10-15% PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.0, 1 mM sodium azide, 1% tryptone
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分辨率 2.09 Å R-free 0.257 |
| 9GJ1 NMDA bound to compound 339 提交 2024-08-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
401–539（139 aa）
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未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 A1IME (2~{R})-2-azanyl-3-[(7-methylthieno[3,2-b]pyridin-2-yl)carbonylamino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；282.15 K；10-15% PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.0, 1 mM sodium azide, 1% tryptone
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分辨率 1.62 Å R-free 0.230 |