当前蛋白身份：H8XX12
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5H6V Structure of Zika virus protease in complex with a dipeptide inhibitor 提交 2016-11-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1411–1462（52 aa）
片段：UNP residues 1411-1462
链 B
1497–1673（177 aa）
片段：UNP residues 1497-1673
|
突变：R29K | 7HS (S)-2-acetamido-6-amino-N-((S)-5-guanidino-1-oxopentan-2-yl)hexanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；2M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium acetate trihydrate PH4.6
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.244 |
| 5ZMQ Crystal structure of Zika NS3 protease with phenylacetyl-Lys-Lys-Arg-COOH inhibitor 提交 2018-04-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1497–1673（177 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.201 |
| 5ZMQ Crystal structure of Zika NS3 protease with phenylacetyl-Lys-Lys-Arg-COOH inhibitor 提交 2018-04-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
1497–1673（177 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.201 |
| 5ZMQ Crystal structure of Zika NS3 protease with phenylacetyl-Lys-Lys-Arg-COOH inhibitor 提交 2018-04-05 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
1497–1673（177 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.201 |
| 5ZMQ Crystal structure of Zika NS3 protease with phenylacetyl-Lys-Lys-Arg-COOH inhibitor 提交 2018-04-05 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
1497–1673（177 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.201 |
| 5ZMS Crystal structure of Zika NS3 protease in complex with 4-guanidinomethyl-phenylacetyl-Lys-Lys-Arg-H 提交 2018-04-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1497–1673（177 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.252 |
| 5ZMS Crystal structure of Zika NS3 protease in complex with 4-guanidinomethyl-phenylacetyl-Lys-Lys-Arg-H 提交 2018-04-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
1497–1673（177 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.252 |
| 5ZMS Crystal structure of Zika NS3 protease in complex with 4-guanidinomethyl-phenylacetyl-Lys-Lys-Arg-H 提交 2018-04-05 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1497–1673（177 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.252 |
| 5ZMS Crystal structure of Zika NS3 protease in complex with 4-guanidinomethyl-phenylacetyl-Lys-Lys-Arg-H 提交 2018-04-05 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
1497–1673（177 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.252 |
| 5ZMS Crystal structure of Zika NS3 protease in complex with 4-guanidinomethyl-phenylacetyl-Lys-Lys-Arg-H 提交 2018-04-05 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1497–1673（177 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.252 |
| 5ZMS Crystal structure of Zika NS3 protease in complex with 4-guanidinomethyl-phenylacetyl-Lys-Lys-Arg-H 提交 2018-04-05 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1497–1673（177 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.252 |
| 5ZMS Crystal structure of Zika NS3 protease in complex with 4-guanidinomethyl-phenylacetyl-Lys-Lys-Arg-H 提交 2018-04-05 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1497–1673（177 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.252 |
| 5ZMS Crystal structure of Zika NS3 protease in complex with 4-guanidinomethyl-phenylacetyl-Lys-Lys-Arg-H 提交 2018-04-05 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
1497–1673（177 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.252 |
| 6L4Z Crystal structure of Zika NS2B-NS3 protease with compound 6 提交 2019-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1512–1666（155 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6, 30% PEG2000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.226 |
| 6L4Z Crystal structure of Zika NS2B-NS3 protease with compound 6 提交 2019-10-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1514–1666（153 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6, 30% PEG2000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.226 |
| 6L4Z Crystal structure of Zika NS2B-NS3 protease with compound 6 提交 2019-10-21 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
1515–1666（152 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6, 30% PEG2000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.226 |
| 6L4Z Crystal structure of Zika NS2B-NS3 protease with compound 6 提交 2019-10-21 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1508–1666（159 aa）
|
未记录 | E5X 4-(hydroxymethyl)benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6, 30% PEG2000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.226 |
| 6Y3B Crystal Structure of Unlinked NS2B-NS3 Protease from Zika Virus in Complex with Inhibitor MI-2110 提交 2020-02-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1411–1462（52 aa）
链 B
1497–1673（177 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 O7N 1-[(8~{R},15~{S},18~{S})-15,18-bis(4-azanylbutyl)-4,7,14,17,20-pentakis(oxidanylidene)-3,6,13,16,19-pentazabicyclo[20.3.1]hexacosa-1(25),22(26),23-trien-8-yl]guanidine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；0.1 M sodium acetate
2.0 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.188 |
| 7DOC Crystal structure of Zika NS2B-NS3 protease with compound 5 提交 2020-12-14 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1514–1666（153 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.2M Ammonium Sulfate, 0.1M Sodium Acetate Trihydrate pH 4.6, 30% Peg 2000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.229 |
| 7O2M Crystal Structure of Unlinked NS2B-NS3 Protease from Zika Virus in Complex with Inhibitor MI-2289 提交 2021-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1411–1462（52 aa）
链 B
1497–1673（177 aa）
|
未记录 | UZZ 1-[(3~{S},6~{S},9~{S},19~{R})-3,6-bis(4-azanylbutyl)-2,5,8,12,15,18-hexakis(oxidanylidene)-9-(phenylmethyl)-1,4,7,11,14,17-hexazacyclotricos-19-yl]guanidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；0.1 M sodium acetate
0.2 M ammonium sulfate
18 % PEG2000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.251 |
| 7VXX Zika virus NS2B/NS3 protease bZipro(C143S) in complex with 4-amino benzamidine 提交 2021-11-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1411–1462（52 aa）
链 B
1497–1673（177 aa）
|
突变：C143S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.2M ammonium sulfate, 30% polyethylene glycol monomethyl ether 2000, 0.1M sodium acetate trihydrate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.240 |
| 7VXX Zika virus NS2B/NS3 protease bZipro(C143S) in complex with 4-amino benzamidine 提交 2021-11-13 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1411–1462（52 aa）
链 D
1497–1673（177 aa）
|
突变：C143S | PBZ P-AMINO BENZAMIDINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.2M ammonium sulfate, 30% polyethylene glycol monomethyl ether 2000, 0.1M sodium acetate trihydrate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.240 |
| 7VXY Zika virus NS2B/NS3 protease bZipro(C143S) in complex with D-RKOR 提交 2021-11-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1411–1462（52 aa）
链 B
1497–1673（177 aa）
|
突变：C143S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.2M ammonium sulfate, 30% polyethylene glycol monomethyl ether 2000, 0.1M sodium acetate trihydrate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.251 |
| 7VXY Zika virus NS2B/NS3 protease bZipro(C143S) in complex with D-RKOR 提交 2021-11-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1411–1462（52 aa）
链 D
1497–1673（177 aa）
|
突变：C143S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.2M ammonium sulfate, 30% polyethylene glycol monomethyl ether 2000, 0.1M sodium acetate trihydrate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.251 |
| 8Y9V ZIKV NS2B/NS3 protease 提交 2024-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1411–1462（52 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；PEG 20% 2000, ammonium sulfate 0.2 M, sodium acetate trihydrate 0.1 M
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.248 |
| 8Y9V ZIKV NS2B/NS3 protease 提交 2024-02-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1411–1462（52 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；PEG 20% 2000, ammonium sulfate 0.2 M, sodium acetate trihydrate 0.1 M
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.248 |