当前蛋白身份：K4FW35
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6UXK Structure of serine hydroxymethyltransferase 8 from Glycine max cultivar Forrest complexed with PLP 提交 2019-11-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–471（471 aa）
链 B
1–471（471 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.21 M trimethylamine N-oxide, 0.1 M tris pH 8.5, 20% (w/v) PEG MME 2000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.225 |
| 6UXL Structure of serine hydroxymethyltransferase 8 from Glycine max cultivar Forrest complexed with PLP-Glycine 提交 2019-11-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–471（471 aa）
链 B
1–471（471 aa）
|
未记录 | PLG N-GLYCINE-[3-HYDROXY-2-METHYL-5-PHOSPHONOOXYMETHYL-PYRIDIN-4-YL-METHANE] × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.18 M trimethylamine N-oxide, 0.1 M Tris pH 8.5, 22.5% PEG MME 2000
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.242 |
| 9CG8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE P285S VARIANT OF SERINE HYDROXYMETHYLTRANSFERASE 8 FROM SOYBEAN CULTIVAR FORREST 提交 2024-06-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–471（471 aa）
链 B
1–471（471 aa）
链 C
1–471（471 aa）
链 D
1–471（471 aa）
|
突变：P285S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：P285S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：P285S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：P285S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2 % v/v tacsimate
0.1 M Hepes, pH 7.5
20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.266 |
| 9CG8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE P285S VARIANT OF SERINE HYDROXYMETHYLTRANSFERASE 8 FROM SOYBEAN CULTIVAR FORREST 提交 2024-06-28 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–471（471 aa）
链 F
1–471（471 aa）
|
突变：P285S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：P285S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2 % v/v tacsimate
0.1 M Hepes, pH 7.5
20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.266 |
| 9Y6D CRYSTAL STRUCTURE OF THE A149T VARIANT OF SERINE HYDROXYMETHYLTRANSFERASE 8 FROM SOYBEAN CULTIVAR FORREST IN COMPLEX WITH PLP-GLYCINE 提交 2025-09-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–471（471 aa）
链 B
1–471（471 aa）
链 C
1–471（471 aa）
链 D
1–471（471 aa）
|
突变：A149T 突变：A149T 突变：A149T 突变：A149T | PLG N-GLYCINE-[3-HYDROXY-2-METHYL-5-PHOSPHONOOXYMETHYL-PYRIDIN-4-YL-METHANE] × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Ammonium tartrate dibasic pH 7.0
12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.311 |
| 9Y7G CRYSTAL STRUCTURE OF THE A149T VARIANT OF SERINE HYDROXYMETHYLTRANSFERASE 8 FROM SOYBEAN CULTIVAR FORREST IN COMPLEX WITH PLP 提交 2025-09-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–471（471 aa）
链 B
1–471（471 aa）
链 C
1–471（471 aa）
链 D
1–471（471 aa）
|
突变：A149T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：A149T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：A149T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：A149T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 7.0
12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.252 |
| 9Y7G CRYSTAL STRUCTURE OF THE A149T VARIANT OF SERINE HYDROXYMETHYLTRANSFERASE 8 FROM SOYBEAN CULTIVAR FORREST IN COMPLEX WITH PLP 提交 2025-09-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–471（471 aa）
链 F
1–471（471 aa）
|
突变：A149T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：A149T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 7.0
12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.252 |