当前蛋白身份：K7N5N2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3PQY Crystal Structure of 6218 TCR in complex with the H2Db-PA224 提交 2010-11-28 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
115–201（87 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；10-14% PEG 3350, 0.2M KCN, 0.1M Bis Tris Propane pH 6.8, 5% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
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分辨率 3.19 Å R-free 0.316 |
| 3PQY Crystal Structure of 6218 TCR in complex with the H2Db-PA224 提交 2010-11-28 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
115–201（87 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；10-14% PEG 3350, 0.2M KCN, 0.1M Bis Tris Propane pH 6.8, 5% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
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分辨率 3.19 Å R-free 0.316 |
| 3PQY Crystal Structure of 6218 TCR in complex with the H2Db-PA224 提交 2010-11-28 | Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 N
115–201（87 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；10-14% PEG 3350, 0.2M KCN, 0.1M Bis Tris Propane pH 6.8, 5% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
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分辨率 3.19 Å R-free 0.316 |
| 3PQY Crystal Structure of 6218 TCR in complex with the H2Db-PA224 提交 2010-11-28 | Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 S
115–201（87 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；10-14% PEG 3350, 0.2M KCN, 0.1M Bis Tris Propane pH 6.8, 5% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
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分辨率 3.19 Å R-free 0.316 |
| 5NHT human 199.54-16 TCR in complex with Melan-A/MART-1 (26-35) peptide and HLA-A2 提交 2017-03-22 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
96–205（110 aa）
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突变：T158C,T158C | SCN THIOCYANATE ION × 1 K POTASSIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG3350 8 %, K Thiocyanate 0.1 M, Bis-Tris propane pH 6.5 0.1 M, protein concentration 3.5 mg/ml
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分辨率 3.20 Å R-free 0.299 |
| 5WKF D30 TCR in complex with HLA-A*11:01-GTS1 提交 2017-07-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
115–203（89 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；17%PEG8000, 2% Ethylen glycol, 0.1M HEPES pH7.5
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分辨率 2.95 Å R-free 0.253 |
| 5WKF D30 TCR in complex with HLA-A*11:01-GTS1 提交 2017-07-25 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
115–203（89 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；17%PEG8000, 2% Ethylen glycol, 0.1M HEPES pH7.5
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分辨率 2.95 Å R-free 0.253 |
| 5WKH D30 TCR in complex with HLA-A*11:01-GTS3 提交 2017-07-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
115–203（89 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；17%PEG8000, 2% Ethylen glycol, 0.1M HEPES pH7.5
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分辨率 3.20 Å R-free 0.246 |
| 5WKH D30 TCR in complex with HLA-A*11:01-GTS3 提交 2017-07-25 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
115–203（89 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；17%PEG8000, 2% Ethylen glycol, 0.1M HEPES pH7.5
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分辨率 3.20 Å R-free 0.246 |
| 6AT6 Crystal structure of the KFJ5 TCR 提交 2017-08-28 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
115–207（93 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M Tris-HCl pH 8.5 and 25 % PEG3350
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分辨率 1.42 Å R-free 0.218 |
| 6PY2 HLA-TCR complex 提交 2019-07-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
115–207（93 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M MES, pH 6.5, 5% v/v MPD, 15% w/v PEG6000
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分辨率 2.83 Å R-free 0.244 |
| 6Q3S Engineered Human HLA_A2 MHC Class I molecule in complex with TCR and SV9 peptide 提交 2018-12-04 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
115–207（93 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M ammonium acetate; 0.1 M bis-tris pH 5.5, 17 %(w/v) PEG 10.000
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分辨率 2.50 Å R-free 0.273 |
| 7M72 MHC-like protein complex structure 提交 2021-03-26 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
115–207（93 aa）
片段：murine variable domain,human constant domain
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未记录 | QOD (3R)-N-[(2S,3R)-1-(alpha-D-galactopyranosyloxy)-3-hydroxy-15-methylhexadecan-2-yl]-3-hydroxyheptadecanamide × 1 HP6 HEPTANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；18-20% PEG 3350, 8% Tacsimate pH 5.0
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分辨率 2.40 Å R-free 0.227 |
| 7N4K 6218 TCR in complex with H2-Db PA 224 提交 2021-06-04 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
115–204（90 aa）
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未记录 | NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG3350, 0.2 M NaF, 0.05 M NaForm, 1% 1,5-Diaminopentane dihydrochloride
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分辨率 1.85 Å R-free 0.214 |
| 7N5C 6218 TCR in complex with H2Db PA with an engineered TCR-pMHC disulfide bond 提交 2021-06-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
115–207（93 aa）
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突变：S110C | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG3350, 0.2M NaF, 0.05M NaForm, 1% 1,5-Diaminopentane dihydrochloride
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分辨率 1.87 Å R-free 0.233 |
| 7N5P 6218 TCR in complex with H2-Db PA224-233 with a cysteine mutant 提交 2021-06-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
115–207（93 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG3350, 0.2M NaF, 0.05M NaForm, 1% 1,5-Diaminopentane dihydrochloride
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分辨率 2.09 Å R-free 0.236 |