当前蛋白身份：O00198
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2L58 Solution structure of the cytosolic fragment 22-53 of Bcl-2 member Harakiri 提交 2010-10-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–53（32 aa）
片段：UNP residues 22-53
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
1.0-1.5 mM Hrk-22_53, 0.1 mM sodium azide, 20 mM sodium phosphate, 35% v/v d3 TFE, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1.0-1.5 mM Hrk-22_53, 0.1 mM sodium azide, 20 mM sodium phosphate, 35% v/v d2 TFE, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2L5B Solution structure of the transmembrane domain of Bcl-2 member Harakiri in micelles 提交 2010-10-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
61–91（31 aa）
片段：UNP Residues 61-91
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 3.2；323 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2；压力 ambient
NMR样品组成
1.0-1.5 mM Hrk-TM, 200 mM D25 SDS, 5 mM D15 TCEP, 0.1 mM sodium azide, 35% v/v D3 methanol, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1.0-1.5 mM Hrk-TM, 200 mM D25 SDS, 0.1 mM sodium azide, 5 mM D15 TCEP, 35% v/v D4 methanol, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 6XY4 Structural insight into sheep-pox virus mediated inhibition of apoptosis 提交 2020-01-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
26–51（26 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane pH 6.5, 20% w/vPEG 3350
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.234 |
| 7P0U ORF virus encoded Bcl-2 homolog ORFV125 in complex with Puma BH3 peptide 提交 2021-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
26–51（26 aa）
链 U
26–51（26 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane pH 8.5, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.274 |
| 7P0U ORF virus encoded Bcl-2 homolog ORFV125 in complex with Puma BH3 peptide 提交 2021-06-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
26–51（26 aa）
链 G
26–51（26 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane pH 8.5, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.274 |
| 9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
27–50（24 aa）
链 F
27–50（24 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.303 |
| 9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
27–50（24 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.303 |
| 9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
27–50（24 aa）
链 H
27–50（24 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.303 |
| 9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
27–50（24 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.303 |
| 9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
27–50（24 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.303 |
| 9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
27–50（24 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.303 |
| 9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 L
27–50（24 aa）
链 M
27–50（24 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.303 |
| 9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
27–50（24 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.303 |
| 9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 | Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 M
27–50（24 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.303 |
| 9LI8 Crystal structure of Bcl-xL in complex with HRK BH3 peptide 提交 2025-01-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
27–51（25 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
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分辨率 2.32 Å R-free 0.264 |
| 9UGP Crystal structure of MCL-1 in complex with HRK BH3 提交 2025-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
27–51（25 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 25%(w/v) polyethylene glycol monomethyl ether 2000
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分辨率 1.39 Å R-free 0.197 |