当前蛋白身份:O08838 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2VJ0 Crystal structure of the alpha-adaptin appendage domain, from the AP2 adaptor complex, in complex with an FXDNF peptide from amphiphysin1 and a WVXF peptide from synaptojanin P170 提交 2007-12-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 Q 324–330(7 aa) 片段:PEPTIDE CONTAINING FXDNF MOTIF, RESIDUES 324-330
未记录 BEN BENZAMIDINE × 1 DTD DITHIANE DIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;1.2M AMMONIUM SULPHATE, 3% ISOPROPANOL AND 0.05M SODIUM CITRATE PH 6.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.208
5M5T Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to a non-natural clathrin-box motif peptide (Amph4T1) 提交 2016-10-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 E 349–358(10 aa) 片段:UNP residues 349-358
链 G 349–358(10 aa) 片段:UNP residues 349-358
链 I 349–358(10 aa) 片段:UNP residues 349-358
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;1 uL protein:peptide mix (14 mg/mL NTD and 3.4 mM peptide) plus 1 uL reservoir equilibrated against a 200 uL reservoir of 1.1 M sodium malonate pH 8.0
分辨率 1.70 Å R-free 0.185
5M5T Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to a non-natural clathrin-box motif peptide (Amph4T1) 提交 2016-10-22 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 F 349–358(10 aa) 片段:UNP residues 349-358
链 H 349–358(10 aa) 片段:UNP residues 349-358
链 J 349–358(10 aa) 片段:UNP residues 349-358
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;1 uL protein:peptide mix (14 mg/mL NTD and 3.4 mM peptide) plus 1 uL reservoir equilibrated against a 200 uL reservoir of 1.1 M sodium malonate pH 8.0
分辨率 1.70 Å R-free 0.185