当前蛋白身份:O14686
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3UVK Crystal structure of WDR5 in complex with the WDR5-interacting motif of MLL2 提交 2011-11-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
5337–5347(11 aa)
片段:WDR5-interacting motif (UNP residues 5337-5347)
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未记录 | BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;323 K;0.1 M ammonium sulfate, 24% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 323K
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分辨率 1.40 Å R-free 0.192 |
| 4ERQ X-ray structure of WDR5-MLL2 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
5333–5346(14 aa)
片段:UNP residues 5333-5346
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop;pH 7.3;294 K;PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.3, hanging drop, temperature 294K
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分辨率 1.91 Å R-free 0.200 |
| 4ERQ X-ray structure of WDR5-MLL2 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
5333–5346(14 aa)
片段:UNP residues 5333-5346
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop;pH 7.3;294 K;PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.3, hanging drop, temperature 294K
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.200 |
| 4ERQ X-ray structure of WDR5-MLL2 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-20 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 F
5333–5346(14 aa)
片段:UNP residues 5333-5346
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop;pH 7.3;294 K;PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.3, hanging drop, temperature 294K
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分辨率 1.91 Å R-free 0.200 |
| 4Z4P Structure of the MLL4 SET Domain 提交 2015-04-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
5385–5539(155 aa)
片段:UNP residues 5385-5539
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;295 K;100 mM Tris-HCl
20 % Ethanol
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分辨率 2.20 Å R-free 0.242 |
| 6O7G Solution structure of MLL4 PHD6 domain in complex with histone H4K16ac peptide 提交 2019-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1503–1562(60 aa)
片段:residues 1503-1562
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 1
NMR样品组成
2.5 mM [U-13C; U-15N] MLL4 PHD6, 7.5 mM histone H4K16ac (11-21) peptide, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
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分辨率未提供 |
| 8U2Y Solution structure of the PHD6 finger of MLL4 bound to TET3 提交 2023-09-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1503–1562(60 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)150;压力 1
NMR样品组成
2.0 mM [U-13C; U-15N] Protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 9ATN NMR structure of the MLL4 PHD2/3 fingers in complex with ASXL2 提交 2024-02-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
227–322(96 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)150;压力 1
NMR样品组成
1.5 mM 13C, 15N MLL4 PHD2,3, 25 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 3 mM DTT, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
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分辨率未提供 |
| 9YL3 State 1 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:17-meric(17) 与全部聚合物一致 |
链 K
4507–5537(1031 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.50 Å |
| 9YLE State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:17-meric(17) 与全部聚合物一致 |
链 K
4507–5537(1031 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.63 Å |
| 9YLY MLL4FC bound to a nucleosome with p53 RE 提交 2025-10-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物一致 |
链 K
4507–5537(1031 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.77 Å |
| 9YM8 State 2 focused on PHD FYR of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:18-meric(18) 与全部聚合物一致 |
链 K
4507–5537(1031 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.43 Å |
| 9YMF State 2 focused on H3 N terminal tail of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:18-meric(18) 与全部聚合物一致 |
链 K
4507–5537(1031 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.45 Å |