当前蛋白身份:O14686 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3UVK Crystal structure of WDR5 in complex with the WDR5-interacting motif of MLL2 提交 2011-11-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 5337–5347(11 aa) 片段:WDR5-interacting motif (UNP residues 5337-5347)
未记录 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;323 K;0.1 M ammonium sulfate, 24% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 323K
分辨率 1.40 Å R-free 0.192
4ERQ X-ray structure of WDR5-MLL2 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 5333–5346(14 aa) 片段:UNP residues 5333-5346
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop;pH 7.3;294 K;PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.3, hanging drop, temperature 294K
分辨率 1.91 Å R-free 0.200
4ERQ X-ray structure of WDR5-MLL2 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-20 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 5333–5346(14 aa) 片段:UNP residues 5333-5346
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop;pH 7.3;294 K;PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.3, hanging drop, temperature 294K
分辨率 1.91 Å R-free 0.200
4ERQ X-ray structure of WDR5-MLL2 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-20 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 F 5333–5346(14 aa) 片段:UNP residues 5333-5346
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop;pH 7.3;294 K;PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.3, hanging drop, temperature 294K
分辨率 1.91 Å R-free 0.200
4Z4P Structure of the MLL4 SET Domain 提交 2015-04-02 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 5385–5539(155 aa) 片段:UNP residues 5385-5539
未记录 ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;295 K;100 mM Tris-HCl 20 % Ethanol
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
6O7G Solution structure of MLL4 PHD6 domain in complex with histone H4K16ac peptide 提交 2019-03-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1503–1562(60 aa) 片段:residues 1503-1562
未记录 ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 1
NMR样品组成 2.5 mM [U-13C; U-15N] MLL4 PHD6, 7.5 mM histone H4K16ac (11-21) peptide, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
8U2Y Solution structure of the PHD6 finger of MLL4 bound to TET3 提交 2023-09-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1503–1562(60 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)150;压力 1
NMR样品组成 2.0 mM [U-13C; U-15N] Protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
9ATN NMR structure of the MLL4 PHD2/3 fingers in complex with ASXL2 提交 2024-02-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 227–322(96 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)150;压力 1
NMR样品组成 1.5 mM 13C, 15N MLL4 PHD2,3, 25 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 3 mM DTT, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
9YL3 State 1 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:17-meric(17) 与全部聚合物一致
链 K 4507–5537(1031 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.50 Å
9YLE State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:17-meric(17) 与全部聚合物一致
链 K 4507–5537(1031 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.63 Å
9YLY MLL4FC bound to a nucleosome with p53 RE 提交 2025-10-09 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物一致
链 K 4507–5537(1031 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.77 Å
9YM8 State 2 focused on PHD FYR of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:18-meric(18) 与全部聚合物一致
链 K 4507–5537(1031 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.43 Å
9YMF State 2 focused on H3 N terminal tail of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:18-meric(18) 与全部聚合物一致
链 K 4507–5537(1031 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.45 Å