当前蛋白身份：O15123
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1Z3S Angiopoietin-2 Receptor Binding Domain 提交 2005-03-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
281–496（216 aa）
片段：Receptor binding domain (residues 281-496)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；PEG-4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.287 |
| 1Z3S Angiopoietin-2 Receptor Binding Domain 提交 2005-03-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
281–496（216 aa）
片段：Receptor binding domain (residues 281-496)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；PEG-4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.287 |
| 1Z3U Structure of the Angiopoietin-2 Recptor Binding Domain and Identification of Surfaces Involved in Tie2 Recognition 提交 2005-03-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
281–496（216 aa）
片段：Receptor binding domain (residues 281-496)
|
突变：F469A, Y475A, Y476A | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；Ammonium Sulfate and PEG-4000, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.278 |
| 1Z3U Structure of the Angiopoietin-2 Recptor Binding Domain and Identification of Surfaces Involved in Tie2 Recognition 提交 2005-03-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
281–496（216 aa）
片段：Receptor binding domain (residues 281-496)
|
突变：F469A, Y475A, Y476A | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；Ammonium Sulfate and PEG-4000, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.278 |
| 1Z3U Structure of the Angiopoietin-2 Recptor Binding Domain and Identification of Surfaces Involved in Tie2 Recognition 提交 2005-03-14 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
281–496（216 aa）
片段：Receptor binding domain (residues 281-496)
|
突变：F469A, Y475A, Y476A | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；Ammonium Sulfate and PEG-4000, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.278 |
| 1Z3U Structure of the Angiopoietin-2 Recptor Binding Domain and Identification of Surfaces Involved in Tie2 Recognition 提交 2005-03-14 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
281–496（216 aa）
片段：Receptor binding domain (residues 281-496)
|
突变：F469A, Y475A, Y476A | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；Ammonium Sulfate and PEG-4000, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.278 |
| 2GY7 Angiopoietin-2/Tie2 Complex Crystal Structure 提交 2006-05-09 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
281–495（215 aa）
片段：Angiopoietin-2 Receptor binding domain (residues 281-495)
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；2.2 M Ammonium Sulfate, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.70 Å R-free 0.317 |
| 4JZC Angiopoietin-2 fibrinogen domain TAG mutant 提交 2013-04-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–496（218 aa）
片段：fibrinogen-like receptor-binding domain
|
突变：P183T, Q184A, R185G | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.0 M Na/K-tartate, 0.1 M Tris, 0.2 M LiSO4, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.248 |
| 4JZC Angiopoietin-2 fibrinogen domain TAG mutant 提交 2013-04-02 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
279–496（218 aa）
片段：fibrinogen-like receptor-binding domain
|
突变：P183T, Q184A, R185G | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.0 M Na/K-tartate, 0.1 M Tris, 0.2 M LiSO4, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.248 |
| 4ZFG Dual-specificity Fab 5A12 in complex with Angiopoietin 2 提交 2015-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
225–444（220 aa）
片段：Receptor binding domain, UNP residues 225-444
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M lithium sulfate, 25% PEG 3350, 3% D(+)-sucrose
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分辨率 2.27 Å R-free 0.223 |
| 8VGP CryoEM structure of Angiopoietin-2 in complex with engineered conformationally rigid Fab 5A12.6DS 提交 2023-12-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
225–444（220 aa）
片段：Receptor binding domain, UNP residues 225-444
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.70 Å |
| 9HMI Crystal structure of the Calf domains of Integrin Alpha5 in complex with angiopoietin2 peptide 提交 2024-12-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
359–366（8 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M ammonium formate; 20% polyethylene glycol 3350 (wt/vol)
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分辨率 2.78 Å R-free 0.306 |