当前蛋白身份：O15169
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1DK8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE RGS-HOMOLOGOUS DOMAIN OF AXIN 提交 1999-12-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
111–257（147 aa）
片段：RGS-HOMOLOGOUS DOMAIN
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 12 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 GOL GLYCEROL × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.25；277 K；sodium acetate, ammonium sulfate, glycerol, dithiothreitol, pH 4.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.198 |
| 1EMU STRUCTURE OF THE AXIN RGS-HOMOLOGOUS DOMAIN IN COMPLEX WITH A SAMP REPEAT FROM APC 提交 2000-03-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
117–248（132 aa）
片段：RGS-HOMOLOGOUS DOMAIN
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；MES, PEG 400, glycerol, DTT, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.221 |
| 1O9U GLYCOGEN SYNTHASE KINASE 3 BETA COMPLEXED WITH AXIN PEPTIDE 提交 2002-12-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
383–400（18 aa）
片段：RESIDUES 383-400
|
未记录 | ADZ 9-METHYL-9H-PURIN-6-AMINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；CRYSTAL WERE GROWN BY THE HANGING DROP METHOD. 1UL OF PROTEIN SOLUTION (6MG/ML GSK3B AND 0.37MG/ML AXIN PEPTIDE) IN 25MM HEPES-NAOH, 250MM NACL, 1MM DTT, PH 7.0) WAS MIXED WITH 1UL PRECIPITANT (18% PEG4000, 150MM MGCL2, 100MM TRIS- HCL, PH 7.5)
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 3ZDI Glycogen Synthase Kinase 3 Beta complexed with Axin Peptide and Inhibitor 7d 提交 2012-11-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
383–400（18 aa）
片段：RESIDUES 383-400
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 UGJ 3,6-Diamino-4-(2-chlorophenyl)thieno[2,3-b]pyridine-2,5-dicarbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.1 M 2-(N-MORPHOLINO)ETHANESULFONIC ACID (MES), PH 6.5, 12% (W/V) PEG 20000
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.242 |
| 4B7T Glycogen Synthase Kinase 3 Beta complexed with Axin Peptide and Leucettine L4 提交 2012-08-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
383–400（18 aa）
片段：RESIDUES 383-400
|
未记录 | CWT (5Z)-5-(1,3-benzodioxol-5-ylmethylidene)-3-methyl-2-(propan-2-ylamino)imidazol-4-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.1 M TRIS-HCL, PH 8.0, 0.15 M MGCL2, 15% (W/V) PEG 4000
|
分辨率 2.77 Å R-free 0.235 |
| 4NM0 Crystal structure of peptide inhibitor-free GSK-3/Axin complex 提交 2013-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
383–402（20 aa）
片段：Residues 383-402
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS；pH 7.5；277 K；10% PEG 35,000, 20mM Tris 7.5, 300mM NaCl, 5% glycerol, 20mM MgCl2, 400uM ATP, and 5mM DTT, MICRODIALYSIS, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.239 |
| 4NM3 Crystal structure of GSK-3/Axin complex bound to phosphorylated N-terminal auto-inhibitory pS9 peptide 提交 2013-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
383–402（20 aa）
片段：Residues 383-402
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS；pH 7.5；277 K；10% PEG 35,000, 20mM Tris 7.5, 300mM NaCl, 5% glycerol, 10mM MgCl2, 200uM ATP, and 5mM DTT, MICRODIALYSIS, temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.242 |
| 4NM5 Crystal structure of GSK-3/Axin complex bound to phosphorylated Wnt receptor LRP6 c-motif 提交 2013-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
383–402（20 aa）
片段：Residues 383-402
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS；pH 7.5；277 K；10% PEG 35,000, 20mM Tris 7.5, 300mM NaCl, 5% glycerol, 10mM MgCl2, 200uM ATP, and 5mM DTT, MICRODIALYSIS, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.232 |
| 4NM5 Crystal structure of GSK-3/Axin complex bound to phosphorylated Wnt receptor LRP6 c-motif 提交 2013-11-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
383–402（20 aa）
片段：Residues 383-402
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 8 MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS；pH 7.5；277 K；10% PEG 35,000, 20mM Tris 7.5, 300mM NaCl, 5% glycerol, 10mM MgCl2, 200uM ATP, and 5mM DTT, MICRODIALYSIS, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.232 |
| 4NM7 Crystal structure of GSK-3/Axin complex bound to phosphorylated Wnt receptor LRP6 e-motif 提交 2013-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
383–402（20 aa）
片段：Residues 383-402
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；277 K；10% PEG 35,000, 20mM Tris 7.5, 300mM NaCl, 5% glycerol, 10mM MgCl2, 200uM ATP, and 5mM DTT, MICRODIALYSIS, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.234 |
| 4NU1 Crystal structure of a transition state mimic of the GSK-3/Axin complex bound to phosphorylated N-terminal auto-inhibitory pS9 peptide 提交 2013-12-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
383–402（20 aa）
片段：Residues 383-402
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 NO3 NITRATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS；pH 7.5；277 K；10% PEG 35,000, 20mM Tris pH7.5, 300mM NaCl, 5% glycerol, 10mM MgCl2, 200uM ATP, and 5mM DTT, MICRODIALYSIS, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.245 |
| 5WZZ The SIAH E3 ubiquitin ligases promote Wnt/ beta-catenin signaling through mediating Wnt-induced Axin degradation 提交 2017-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
375–394（20 aa）
片段：UNP residues 375-394
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；25% (w/v) PEG3350, 200 mM MgCl2, 100 mM Tris-Hcl
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
| 5WZZ The SIAH E3 ubiquitin ligases promote Wnt/ beta-catenin signaling through mediating Wnt-induced Axin degradation 提交 2017-01-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
375–394（20 aa）
片段：UNP residues 375-394
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；25% (w/v) PEG3350, 200 mM MgCl2, 100 mM Tris-Hcl
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
| 5WZZ The SIAH E3 ubiquitin ligases promote Wnt/ beta-catenin signaling through mediating Wnt-induced Axin degradation 提交 2017-01-19 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
375–394（20 aa）
片段：UNP residues 375-394
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；25% (w/v) PEG3350, 200 mM MgCl2, 100 mM Tris-Hcl
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
| 5WZZ The SIAH E3 ubiquitin ligases promote Wnt/ beta-catenin signaling through mediating Wnt-induced Axin degradation 提交 2017-01-19 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
375–394（20 aa）
片段：UNP residues 375-394
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；25% (w/v) PEG3350, 200 mM MgCl2, 100 mM Tris-Hcl
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
| 6JCK Complex structure of Axin-DIX and Dvl2-DIX 提交 2019-01-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
745–826（82 aa）
|
突变：Y760D | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；25% (w/v) PEG1500, 0.1 M Malonate-Imidazole-Borate buffer pH 7.0
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.290 |
| 7Y1P CRYSTAL STRUCTURE OF THE RGS-HOMOLOGOUS DOMAIN OF AXIN IN COMPLEX WITH LZ-22Na 提交 2022-06-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
74–220（147 aa）
片段：RGS-homologous domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；2.4 M sodium malonate pH 7.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.228 |
| 7Y1P CRYSTAL STRUCTURE OF THE RGS-HOMOLOGOUS DOMAIN OF AXIN IN COMPLEX WITH LZ-22Na 提交 2022-06-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
74–220（147 aa）
片段：RGS-homologous domain
|
未记录 | I5L (2~{Z},4~{Z})-2-methyl-5-(8-oxidanyldibenzofuran-4-yl)penta-2,4-dienal × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；2.4 M sodium malonate pH 7.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.228 |
| 7Y1P CRYSTAL STRUCTURE OF THE RGS-HOMOLOGOUS DOMAIN OF AXIN IN COMPLEX WITH LZ-22Na 提交 2022-06-08 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
74–220（147 aa）
片段：RGS-homologous domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；2.4 M sodium malonate pH 7.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.228 |
| 7Y1P CRYSTAL STRUCTURE OF THE RGS-HOMOLOGOUS DOMAIN OF AXIN IN COMPLEX WITH LZ-22Na 提交 2022-06-08 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
74–220（147 aa）
片段：RGS-homologous domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；2.4 M sodium malonate pH 7.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.228 |
| 8RU3 Crystal structure of beta-catenin in complex with alpha-helical peptide inhibitor 提交 2024-01-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
468–479（12 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；300 K；Crystals grown in 100 mM NaKPO4, 2M NaCl.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.232 |
| 8RU4 Crystal structure of Human Catenin Beta-1 in complex with stitched peptide inhibitor 提交 2024-01-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
469–479（11 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GLC alpha-D-glucopyranose × 3 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；100 mM TRIS pH 8.75, 2%(w/v) PEG-6000, cryoprotected in 30% (w/v) Glucose.
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.240 |
| 8VMG Crystal structure of GSK-3 26-383 bound to Axin 383-435 提交 2024-01-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
383–435（53 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20 NO3 NITRATE ION × 8 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM MES, pH 5.5, 1.9 M ammonium sulfate, 200 mM sodium chloride, cryoprotectant: 25% ethylene glycol
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.230 |
| 8VMG Crystal structure of GSK-3 26-383 bound to Axin 383-435 提交 2024-01-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
383–435（53 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 8 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM MES, pH 5.5, 1.9 M ammonium sulfate, 200 mM sodium chloride, cryoprotectant: 25% ethylene glycol
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.230 |