当前蛋白身份：O15460
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6EVL Crystal structure of an unlignaded peptide-substrate-binding domain of human type II collagen prolyl 4-hydroxylase 提交 2017-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
163–257（95 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GLY GLYCINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；2.45 M ammonium sulphate, 10% DMSO, 100 mM MOPS, pH 6.5
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分辨率 1.87 Å R-free 0.224 |
| 6EVM Crystal structure of a Pro-9 complexed peptide-substrate-binding domain of human type II collagen prolyl 4-hydroxylase 提交 2017-11-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
163–257（95 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；2.45 M ammonium sulphate, 10% DMSO, 2.5 mM Pro-9, 4% hexenediol, 100 mM MOPS
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分辨率 2.00 Å R-free 0.219 |
| 6EVN Crystal structure of peptide-substrate-binding domain of human type II collagen prolyl 4-hydroxylase complex with Pro-Pro-Gly-Pro-Ala-Gly-Pro-Pro-Gly. 提交 2017-11-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
163–257（95 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；2.45 M ammonium sulphate, 10% DMSO, 5 mM PPGPAGPPG, 5% D-galactose, 100 mM MOPS, pH 6.5
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分辨率 1.48 Å R-free 0.179 |
| 6EVO Crystal structure the peptide-substrate-binding domain of human type II collagen prolyl 4-hydroxylase complexed with Pro-Pro-Gly-Pro-Arg-Gly-Pro-Pro-Gly. 提交 2017-11-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
163–257（95 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；2.45 M ammonium sulphate, 10% DMSO, 5 mM PPGPRGPPG, 10 mM EDTA, 100 mM MOPS
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分辨率 1.55 Å R-free 0.180 |
| 6EVP Crystal structure the peptide-substrate-binding domain of human type II collagen prolyl 4-hydroxylase complexed with Pro-Pro-Gly-Pro-Glu-Gly-Pro-Pro-Gly. 提交 2017-11-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
163–257（95 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；2.45 M ammonium sulphate, 10% DMSO, 100 mM MOPS, 5 mM PPGPEGPPG, 5% PEG 400, 100 mM MOPS.
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分辨率 1.68 Å R-free 0.215 |
| 7ZSC Crystal structure of the heterodimeric human C-P4H-II with truncated alpha subunit (C-P4H-II delta281) 提交 2022-05-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
282–535（254 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；20% (w/v) PEG4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M MES, 3% methanol
|
分辨率 3.85 Å R-free 0.278 |
| 7ZSC Crystal structure of the heterodimeric human C-P4H-II with truncated alpha subunit (C-P4H-II delta281) 提交 2022-05-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
282–535（254 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；20% (w/v) PEG4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M MES, 3% methanol
|
分辨率 3.85 Å R-free 0.278 |
| 9HTD Peptide-substrate-binding (PSB) domain of human type II collagen prolyl 4-hydroxylase complexed with Pro-Hyp-Gly-Pro-Ala-Gly-Pro-Hyp-Gly. 提交 2024-12-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
163–257（95 aa）
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未记录 | GLY GLYCINE × 4 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；278 K；2M ammonium sulphate, 10% dioxane, 100 mM MES, 2 mM Pro-Hyp-Gly-Pro-Ala-Gly-Pro-Hyp-Gly.
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分辨率 1.75 Å R-free 0.195 |