当前蛋白身份：O19707
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4Z7U S13 complex 提交 2015-04-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–192（192 aa）
片段：UNP residues 1-192
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；140 mM Na-acetate, 0.1 M Bis-Tris-Propane pH 7.5, 15% PEG8000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.220 |
| 4Z7U S13 complex 提交 2015-04-08 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
1–192（192 aa）
片段：UNP residues 1-192
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；140 mM Na-acetate, 0.1 M Bis-Tris-Propane pH 7.5, 15% PEG8000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.220 |
| 4Z7V L3-12 complex 提交 2015-04-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–192（192 aa）
片段：UNP residues 1-192
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；80 mM Na-acetate, 0.1 M Bis-Tris-Propane pH 6.5, 16% PEG8000
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.226 |
| 4Z7V L3-12 complex 提交 2015-04-08 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
1–192（192 aa）
片段：UNP residues 1-192
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；80 mM Na-acetate, 0.1 M Bis-Tris-Propane pH 6.5, 16% PEG8000
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.226 |
| 4Z7W T316 complex 提交 2015-04-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–192（192 aa）
片段：UNP residues 1-192
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.32 M (NH4)2SO4, 0.1 M HEPES pH 7.8, 20% PEG3350
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.247 |
| 4Z7W T316 complex 提交 2015-04-08 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
1–192（192 aa）
片段：UNP residues 1-192
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.32 M (NH4)2SO4, 0.1 M HEPES pH 7.8, 20% PEG3350
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.247 |
| 5KSA Bel602-DQ8.5-glia-gamma1 complex 提交 2016-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–192（192 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M Ca-Acetate, 21 % PEG3350, Tris pH 8.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.206 |
| 5KSB T15-DQ8.5-glia-gamma1 complex 提交 2016-07-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–192（192 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；8% Tacsimate pH 7.5, 20% PEG3350
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.254 |
| 5KSB T15-DQ8.5-glia-gamma1 complex 提交 2016-07-08 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
1–192（192 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；8% Tacsimate pH 7.5, 20% PEG3350
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.254 |
| 5UJT Crystal structure of human HLA-DQ8 in complex with insulin mimotope binding in register 3 提交 2017-01-18 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
3–191（189 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；278 K；15% PEG3350, 100mM Tacsimate
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.238 |
| 5UJT Crystal structure of human HLA-DQ8 in complex with insulin mimotope binding in register 3 提交 2017-01-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
3–191（189 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；278 K；15% PEG3350, 100mM Tacsimate
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.238 |
| 5UJT Crystal structure of human HLA-DQ8 in complex with insulin mimotope binding in register 3 提交 2017-01-18 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
3–191（189 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；278 K；15% PEG3350, 100mM Tacsimate
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.238 |
| 6XCO Immune receptor complex 提交 2020-06-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–192（192 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 GOL GLYCEROL × 6 CAC CACODYLATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；0.1 M calcium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 13% polyethylene glycol (PEG) 20,000
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.247 |
| 6XCP Immune receptor complex 提交 2020-06-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–192（192 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GOL GLYCEROL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；13% PEG 8000, 0.2M Potassium dihydrogen phosphate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.268 |
| 8VCX Human TCR A2.13 in complex with DQ8-InsCpep 提交 2023-12-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–192（192 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；0.2 M Potassium sodium tartrate, 24% PEG 3350
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.238 |
| 8VCY Human TCR A2.13 in complex with DQ8-InsC8-15NPY 提交 2023-12-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–192（192 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GOL GLYCEROL × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；0.2 M Potassium sodium tartrate, 14% PEG 20,000 with seeding C8 silver bullet (Hampton Research)
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.225 |
| 8VD0 Human TCR ET650-4 in complex with DQ8-InsC8-15-IAPP2 提交 2023-12-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–192（192 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GOL GLYCEROL × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；0.2 M K Na tartrate, 15% w/v PEG 20,000 with seeding and additive C8 silver bullet
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.220 |
| 8VD0 Human TCR ET650-4 in complex with DQ8-InsC8-15-IAPP2 提交 2023-12-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 H
1–192（192 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 GOL GLYCEROL × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；0.2 M K Na tartrate, 15% w/v PEG 20,000 with seeding and additive C8 silver bullet
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.220 |
| 8VD2 Human TCR ET650-4 in complex with DQ8-InsC8-15-IAPP1 提交 2023-12-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–192（192 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；0.2 M potassium dihydrogen phosphate (KH2PO4), 15% w/v PEG 20,000 with seeding and additive 30 mM MnCl2
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.259 |
| 8VDD Crystal structure of Proinsulin C-peptide bound to HLA-DQ8 提交 2023-12-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–192（192 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；0.2 M K Na tartrate, 14% w/v PEG 20,000 with seeding and additive C8 silver bullet
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.280 |
| 8VDU Crystal structure of hybrid insulin peptide (InsC8-15-IAPP74-80) bound to HLA-DQ8 提交 2023-12-17 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 B
1–192（192 aa）
链 E
1–192（192 aa）
链 H
1–192（192 aa）
链 K
1–192（192 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；0.2 M Monopotassium phosphate, 17% PEG 8K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.246 |