当前蛋白身份：O30124
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1MA3 Structure of a Sir2 enzyme bound to an acetylated p53 peptide 提交 2002-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–253（253 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；PEG 8000, PEG 1000 and Sodium Chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.254 |
| 1S7G Structural Basis for the Mechanism and Regulation of Sir2 Enzymes 提交 2004-01-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–253（253 aa）
链 B
1–253（253 aa）
链 C
1–253（253 aa）
链 D
1–253（253 aa）
链 E
1–253（253 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 SO4 SULFATE ION × 12 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 3 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；ammonium sulfate, PEG400, hepes, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.249 |
| 1YC2 Sir2Af2-NAD-ADPribose-nicotinamide 提交 2004-12-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–253（253 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 NCA NICOTINAMIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, nicotinamide, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 1YC2 Sir2Af2-NAD-ADPribose-nicotinamide 提交 2004-12-21 | Assembly 10 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–253（253 aa）
链 D
1–253（253 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 NCA NICOTINAMIDE × 1 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, nicotinamide, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 1YC2 Sir2Af2-NAD-ADPribose-nicotinamide 提交 2004-12-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–253（253 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 NCA NICOTINAMIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, nicotinamide, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 1YC2 Sir2Af2-NAD-ADPribose-nicotinamide 提交 2004-12-21 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–253（253 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, nicotinamide, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 1YC2 Sir2Af2-NAD-ADPribose-nicotinamide 提交 2004-12-21 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–253（253 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 NCA NICOTINAMIDE × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, nicotinamide, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 1YC2 Sir2Af2-NAD-ADPribose-nicotinamide 提交 2004-12-21 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1–253（253 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 NCA NICOTINAMIDE × 2 APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, nicotinamide, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 1YC2 Sir2Af2-NAD-ADPribose-nicotinamide 提交 2004-12-21 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–253（253 aa）
链 B
1–253（253 aa）
链 C
1–253（253 aa）
链 D
1–253（253 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 10 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 NCA NICOTINAMIDE × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, nicotinamide, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 1YC2 Sir2Af2-NAD-ADPribose-nicotinamide 提交 2004-12-21 | Assembly 7 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–253（253 aa）
链 C
1–253（253 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 5 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 NCA NICOTINAMIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, nicotinamide, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 1YC2 Sir2Af2-NAD-ADPribose-nicotinamide 提交 2004-12-21 | Assembly 8 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–253（253 aa）
链 D
1–253（253 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 5 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 NCA NICOTINAMIDE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, nicotinamide, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 1YC2 Sir2Af2-NAD-ADPribose-nicotinamide 提交 2004-12-21 | Assembly 9 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–253（253 aa）
链 B
1–253（253 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 6 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 NCA NICOTINAMIDE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, nicotinamide, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 4TWJ The structure of Sir2Af2 bound to a myristoylated histone peptide 提交 2014-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–253（253 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ACT ACETATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；293 K；0.1 M Na-acetate pH 4.8, 14-18% (v/v) 2-propanol, and 14-15% (w/v) PEG 6,000
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分辨率 1.65 Å R-free 0.205 |