当前蛋白身份：O43464
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1LCY Crystal Structure of the Mitochondrial Serine Protease HtrA2 提交 2002-04-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
134–458（325 aa）
|
突变：S173A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；295 K；lithium sulfate, sodium chloride, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.274 |
| 1LCY Crystal Structure of the Mitochondrial Serine Protease HtrA2 提交 2002-04-07 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
134–458（325 aa）
|
突变：S173A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；295 K；lithium sulfate, sodium chloride, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.274 |
| 2PZD Crystal Structure of the HtrA2/Omi PDZ Domain Bound to a Phage-Derived Ligand (WTMFWV) 提交 2007-05-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
359–458（100 aa）
链 B
359–458（100 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；292 K；0.1 M sodium citrate, 1.0 M monoammonium dihydrogen phosphate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.254 |
| 5FHT HtrA2 protease mutant V226K 提交 2015-12-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
134–458（325 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MES, NaCl, KH2PO4, NaH2PO4
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.228 |
| 5M3N HTRA2 wild-type structure 提交 2016-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
134–458（325 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；Crystals were grown using the sitting drop vapor-diffusion method by mixing equal volumes of protein (10-15 mg/mL) and reservoir solution containing 0.1 M MES pH 6.0, 1 M LiCl, and 15-20% (w/v) PEG-6000
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.175 |
| 5M3O HTRA2 A141S mutant structure 提交 2016-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
134–458（325 aa）
|
突变：Mutation A141S | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 1 M LiCl, and 15-20% (w/v) PEG-6000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.200 |
| 5TNY HTRA2 G399S mutant 提交 2016-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
134–458（325 aa）
|
突变：G399S | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 1 M LiCl, and 15-20% (w/v) PEG-6000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.187 |
| 5TNZ HtrA2 S142D mutant 提交 2016-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
134–458（325 aa）
片段：UNP residues 134-458
|
突变：S142D | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 1 M LiCl, and 15-20% (w/v) PEG-6000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.172 |
| 5TO0 HTRA2 S276C mutant 提交 2016-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
134–458（325 aa）
|
突变：Mutation S276C | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 1 M LiCl, and 15-20% (w/v) PEG-6000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.177 |
| 5TO1 HtrA2 exposed (L266R, F303A) mutant 提交 2016-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
134–458（325 aa）
|
突变：L266R and F303A | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 CL CHLORIDE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 1 M LiCl, and 15-20% (w/v) PEG-6000
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.198 |
| 5WYN HtrA2 Pathogenic Mutant 提交 2017-01-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
134–458（325 aa）
|
突变：S143C,Y295W | CL CHLORIDE ION × 18 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；Sodium phosphate monobasic monohydrate
Potassium phosphate monobasic
Sodium chloride
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.185 |
| 7VGE Structure of the PDZ deleted variant of HtrA2 protease (S306A) 提交 2021-09-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
140–342（203 aa）
链 B
140–342（203 aa）
链 C
140–342（203 aa）
|
突变：S306A 突变：S306A 突变：S306A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；290 K；0.5 M Sodium acetate trihydrate pH 6.0, 2.0 M Sodium formate, 3% glycerol
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.336 |
| 7VGE Structure of the PDZ deleted variant of HtrA2 protease (S306A) 提交 2021-09-15 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
140–341（202 aa）
链 E
140–340（201 aa）
链 F
140–341（202 aa）
|
突变：S306A 突变：S306A 突变：S306A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；290 K；0.5 M Sodium acetate trihydrate pH 6.0, 2.0 M Sodium formate, 3% glycerol
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.336 |
| 8AUK Cryo-EM structure of human BIRC6 in complex with HTRA2. 提交 2022-08-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
134–458（325 aa）
链 D
134–458（325 aa）
链 E
134–458（325 aa）
|
突变：S306A 突变：S306A 突变：S306A | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.20 Å |
| 8E2K Cryo-EM structure of BIRC6/HtrA2-S306A 提交 2022-08-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 X
134–458（325 aa）
链 Y
134–458（325 aa）
链 Z
134–458（325 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.21 Å |