当前蛋白身份：O43543
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8FAZ Cryo-EM structure of the human BCDX2 complex 提交 2022-11-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 X
1–280（280 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 8GBJ Cryo-EM structure of a human BCDX2/ssDNA complex 提交 2023-02-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–280（280 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 8OUY Human RAD51B-RAD51C-RAD51D-XRCC2 (BCDX2) complex, 3.4 A resolution 提交 2023-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
1–280（280 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 2.5 mM MgCl2, 0.5 mM ADP.BeFx (0.5 mM ADP, 0.5 mM BeSO4, 10 mM NaF), 0.25 mM TCEP, 0.0005% Tween20
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8OUZ Human RAD51B-RAD51C-RAD51D-XRCC2 (BCDX2) complex, 2.2 A resolution 提交 2023-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
2–280（279 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 2.5 mM MgCl2, 0.5 mM ADP.AlFx (0.5 mM ADP, 0.5 mM AlCl3, 10 mM NaF), 0.25 mM TCEP, 0.00075% Tween20, 0.075 mM CHAPSO
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å |
| 9OMZ Cryo-EM structure of a pentameric RAD51-XRCC3-RAD51C-RAD51D-XRCC2 (51-X3CDX2) complex. 提交 2025-05-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 X
1–280（280 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å |
| 9ON2 Cryo-EM structure of a tetrameric XRCC3-RAD51C-RAD51D-XRCC2 complex 提交 2025-05-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 X
1–280（280 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 9Q23 DX2-CX3-RAD51 structure in the intermediate state 提交 2025-08-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–280（280 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å |
| 9Q25 DX2-CX3-RAD51 in the closed state 提交 2025-08-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–280（280 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.24 Å |
| 9Q28 DX2-CX3-RAD51 in the active state 提交 2025-08-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–280（280 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å |
| 9Q29 DX2-CX3 structure capping RAD51 filament 提交 2025-08-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–280（280 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 13 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.61 Å |
| 9Q2A BCDX2-CX3-RAD51-RAD51-ssDNA supercomplex 提交 2025-08-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–280（280 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.67 Å |
| 9Q2B DX2-CX3-RAD51 bound to DNA bubble 提交 2025-08-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–280（280 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9SVX XRCC3-RAD51C-RAD51D-XRCC2 (XRCC3 complex) capping a RAD51 filament on single stranded DNA 提交 2025-10-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–280（280 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 CA CALCIUM ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25 mM HEPES-NaOH pH 7.5, 100 mM NaCl, 2.5 mM MgCl2, 2.5 mM CaCl2, 1 mM ATP, 0.25 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 9SVY XRCC3-RAD51C-RAD51D-XRCC2 (XRCC3 complex) capping a RAD51 filament on partially duplex DNA 提交 2025-10-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric（13） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–280（280 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25 mM HEPES-NaOH pH 7.5, 100 mM NaCl, 2.5 mM MgCl2, 2.5 mM CaCl2, 1 mM ATP, 0.25 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9SW0 XRCC3-RAD51C-RAD51D-XRCC2 (XRCC3 complex) capping a RAD51 filament on a D-loop intermediate 提交 2025-10-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–280（280 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25 mM HEPES-NaOH pH 7.5, 100 mM NaCl, 2.5 mM MgCl2, 2.5 mM CaCl2, 1 mM ATP, 0.25 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9ZZR Cryo-EM Structure of a RAD51 filament bound by ssDNA and the XRCC3-RAD51C-RAD51D-XRCC2 paralog complex 提交 2026-01-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 X
21–280（260 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 11 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |