当前蛋白身份：O43719
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6N3D Structure of HIV Tat-specific factor 1 U2AF Homology Motif (APO-State) 提交 2018-11-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
260–353（94 aa）
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；15% PEG 8000, 0.4 M MgCl2, 0.1 M TRIS
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分辨率 1.13 Å R-free 0.160 |
| 6N3E Structure of HIV Tat-specific factor 1 U2AF Homology Motif bound to U2AF ligand motif 4 提交 2018-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
260–353（94 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 FMT FORMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2 M Magnesium formate dihydrate, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.198 |
| 6N3F Structure of HIV Tat-specific factor 1 U2AF Homology Motif bound to SF3b1 ULM5 提交 2018-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
260–353（94 aa）
链 C
260–353（94 aa）
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未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris
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分辨率 2.10 Å R-free 0.219 |
| 6NSX Yeast Hsh155 Ligand bound to Human Tat-SF1 Motif 提交 2019-01-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
260–353（94 aa）
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；0.1 M HEPES, 10% PEG 6000
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分辨率 2.00 Å R-free 0.194 |
| 6Y50 5'domain of human 17S U2 snRNP 提交 2020-02-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 q
1–755（755 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.10 Å |
| 6Y53 human 17S U2 snRNP low resolution part 提交 2020-02-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：nonadecameric（19） 与全部聚合物一致 |
链 q
1–755（755 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 6Y5Q human 17S U2 snRNP 提交 2020-02-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 q
1–755（755 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7EVO The cryo-EM structure of the human 17S U2 snRNP 提交 2021-05-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–755（755 aa）
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未记录 | 9B0 [(2~{S},3~{S},4~{E},6~{S},7~{R},10~{R})-3,7-dimethyl-2-[(2~{E},4~{E},6~{R})-6-methyl-6-oxidanyl-7-[(2~{R},3~{R})-3-[(2~{R},3~{S})-3-oxidanylpentan-2-yl]oxiran-2-yl]hepta-2,4-dien-2-yl]-7,10-bis(oxidanyl)-12-oxidanylidene-1-oxacyclododec-4-en-6-yl] 4-cycloheptylpiperazine-1-carboxylate × 1 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.50 Å |
| 7Q3L Human 17S U2 snRNP 5' domain 提交 2021-10-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 q
2–755（754 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9；Sample after desalting may have also contained up to 5% glycerol.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.21 Å |
| 8HK1 The cryo-EM structure of human pre-17S U2 snRNP 提交 2022-11-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–755（755 aa）
|
未记录 | 9B0 [(2~{S},3~{S},4~{E},6~{S},7~{R},10~{R})-3,7-dimethyl-2-[(2~{E},4~{E},6~{R})-6-methyl-6-oxidanyl-7-[(2~{R},3~{R})-3-[(2~{R},3~{S})-3-oxidanylpentan-2-yl]oxiran-2-yl]hepta-2,4-dien-2-yl]-7,10-bis(oxidanyl)-12-oxidanylidene-1-oxacyclododec-4-en-6-yl] 4-cycloheptylpiperazine-1-carboxylate × 1 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.70 Å |