当前蛋白身份:O60493
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2MXC Solution structure of the full length sorting nexin 3 提交 2014-12-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
2–162(161 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.100;压力 1.000
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] SNX3FL, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2YPS Crystal structure of the PX domain of human sorting nexin 3 提交 2012-10-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
24–155(132 aa)
片段:PX DOMAIN, RESIDUES 24-155
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
3.5M FORMATE
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.255 |
| 2YPS Crystal structure of the PX domain of human sorting nexin 3 提交 2012-10-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
24–155(132 aa)
片段:PX DOMAIN, RESIDUES 24-155
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
3.5M FORMATE
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.255 |
| 2YPS Crystal structure of the PX domain of human sorting nexin 3 提交 2012-10-31 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
24–155(132 aa)
片段:PX DOMAIN, RESIDUES 24-155
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
3.5M FORMATE
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.255 |
| 2YPS Crystal structure of the PX domain of human sorting nexin 3 提交 2012-10-31 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 D
24–155(132 aa)
片段:PX DOMAIN, RESIDUES 24-155
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
3.5M FORMATE
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.255 |
| 5F0J Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 提交 2015-11-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
1–162(162 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;0.9 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.246 |
| 5F0L Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 and DMT1 提交 2015-11-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
1–162(162 aa)
片段:Residues 14-470
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 10 GOL GLYCEROL × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;0.75 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0, 15% Glycerol
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.259 |
| 5F0M Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 and DMT1 (SeMet labeled) 提交 2015-11-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
1–162(162 aa)
片段:Residues 14-470
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;0.8 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0, 5% Glycerol
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分辨率 3.10 Å R-free 0.254 |
| 5F0P Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 and DMT1(L557M) (SeMet labeled) 提交 2015-11-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
1–162(162 aa)
片段:Residues 1-162
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;0.8 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0, 10% Glycerol
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分辨率 2.78 Å R-free 0.261 |