当前蛋白身份:O60493 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2MXC Solution structure of the full length sorting nexin 3 提交 2014-12-20 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–162(161 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.100;压力 1.000
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] SNX3FL, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2YPS Crystal structure of the PX domain of human sorting nexin 3 提交 2012-10-31 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 24–155(132 aa) 片段:PX DOMAIN, RESIDUES 24-155
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 3.5M FORMATE
分辨率 2.60 Å R-free 0.255
2YPS Crystal structure of the PX domain of human sorting nexin 3 提交 2012-10-31 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 24–155(132 aa) 片段:PX DOMAIN, RESIDUES 24-155
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 3.5M FORMATE
分辨率 2.60 Å R-free 0.255
2YPS Crystal structure of the PX domain of human sorting nexin 3 提交 2012-10-31 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 24–155(132 aa) 片段:PX DOMAIN, RESIDUES 24-155
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 3.5M FORMATE
分辨率 2.60 Å R-free 0.255
2YPS Crystal structure of the PX domain of human sorting nexin 3 提交 2012-10-31 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 24–155(132 aa) 片段:PX DOMAIN, RESIDUES 24-155
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 3.5M FORMATE
分辨率 2.60 Å R-free 0.255
5F0J Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 提交 2015-11-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 1–162(162 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 24 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;0.9 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.70 Å R-free 0.246
5F0L Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 and DMT1 提交 2015-11-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–162(162 aa) 片段:Residues 14-470
未记录 SO4 SULFATE ION × 10 GOL GLYCEROL × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;0.75 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0, 15% Glycerol
分辨率 3.20 Å R-free 0.259
5F0M Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 and DMT1 (SeMet labeled) 提交 2015-11-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–162(162 aa) 片段:Residues 14-470
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;0.8 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0, 5% Glycerol
分辨率 3.10 Å R-free 0.254
5F0P Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 and DMT1(L557M) (SeMet labeled) 提交 2015-11-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–162(162 aa) 片段:Residues 1-162
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;0.8 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0, 10% Glycerol
分辨率 2.78 Å R-free 0.261