当前蛋白身份:O60934 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5WQD Crystal structure of TRF2 TRFH in complex with an NBS1 peptide 提交 2016-11-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 H 423–438(16 aa) 片段:UNP residues 423-438
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M MES, 20% PEG8000, 2mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.284
5WQD Crystal structure of TRF2 TRFH in complex with an NBS1 peptide 提交 2016-11-26 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 I 423–438(16 aa) 片段:UNP residues 423-438
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M MES, 20% PEG8000, 2mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.284
5WQD Crystal structure of TRF2 TRFH in complex with an NBS1 peptide 提交 2016-11-26 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 J 423–438(16 aa) 片段:UNP residues 423-438
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M MES, 20% PEG8000, 2mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.284
5WQD Crystal structure of TRF2 TRFH in complex with an NBS1 peptide 提交 2016-11-26 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 K 423–438(16 aa) 片段:UNP residues 423-438
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M MES, 20% PEG8000, 2mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.284
5WQD Crystal structure of TRF2 TRFH in complex with an NBS1 peptide 提交 2016-11-26 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 L 423–438(16 aa) 片段:UNP residues 423-438
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M MES, 20% PEG8000, 2mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.284
5WQD Crystal structure of TRF2 TRFH in complex with an NBS1 peptide 提交 2016-11-26 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 M 423–438(16 aa) 片段:UNP residues 423-438
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M MES, 20% PEG8000, 2mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.284
5WQD Crystal structure of TRF2 TRFH in complex with an NBS1 peptide 提交 2016-11-26 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 N 423–438(16 aa) 片段:UNP residues 423-438
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M MES, 20% PEG8000, 2mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.284
7SID Human ATM Dimer Bound to Nbs1 提交 2021-10-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 727–754(28 aa)
链 D 727–754(28 aa)
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.53 Å
8BAH Human Mre11-Nbs1 complex 提交 2022-10-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 1–754(754 aa)
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7;20 mM HEPES (pH 7.0), 140 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 1 mM MnCl2, 0.020 mM ZnCl2, 0.2 mM TCEP, 2 mM ATPgS, plus 0.05 percent beta-OG
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
9Q9I Cryo-EM structure of human Mre11-Rad50-Nbs1 complex bound to DNA 提交 2025-02-26 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:heptameric(7) 与全部聚合物一致
链 F 1–754(754 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;25mM Hepes-NaOH, pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 1 mM ATP, 1mM BeF3, 5 mM MgCl2, 1 mM MnCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
9Q9J Cryo-EM structure of human Mre11-Rad50-Nbs1 (MRN) complex bound to DNA and telomeric factor TRF2 fragment (438-542) 提交 2025-02-26 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:octameric(8) 与全部聚合物一致
链 F 1–754(754 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;25mM Hepes-NaOH, pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 1 mM ATP, 1mM BeF3, 5 mM MgCl2, 1 mM MnCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.71 Å
9Q9M Cryo-EM structure of human Mre11-Rad50-Nbs1 (MRN) complex bound to DNA and telomeric factor TRF2 提交 2025-02-26 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:octameric(8) 与全部聚合物一致
链 F 1–754(754 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;25mM Hepes-NaOH, pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 1 mM ATP, 1mM BeF3, 5 mM MgCl2, 1 mM MnCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
9ULO Cryo-EM structure of Human Mre11-Nbs1 complex 提交 2025-04-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 1–754(754 aa)
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å