当前蛋白身份：O68601
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BQ5 NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES XYLOSOXIDANS GIFU 1051 提交 1998-08-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
19–360（342 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.226 |
| 1GS6 Crystal structure of M144A mutant of Alcaligenes xylosoxidans Nitrite Reductase 提交 2002-01-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 X
25–360（336 aa）
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；30% PEG 4000, 0.1M MGCL2, 0.1M TRIS-HCL PH8.5, TEMP GRADIENT 4-32 DEGREES C, pH 8.50
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.181 |
| 1GS7 Crystal structure of H254F mutant of Alcaligenes xylosoxidans Nitrite Reductase 提交 2002-01-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；40-50% PEG-MME 550, 10MM ZNSO4, 0.1M MES PH6.5, pH 6.50
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.194 |
| 1GS8 Crystal structure of mutant D92N Alcaligenes xylosoxidans Nitrite Reductase 提交 2002-01-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9.5；40-50% PEG-MME 550, 10MM ZNSO4, 0.1M MES PH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.207 |
| 1HAU X-RAY STRUCTURE OF A BLUE COPPER NITRITE REDUCTASE AT HIGH PH AND IN COPPER FREE FORM AT 1.9 A RESOLUTION 提交 2001-04-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；30% PEG 4K, 0.1M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1M TRIS-HCL PH8.5, pH 8.50
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.190 |
| 1HAW X-RAY STRUCTURE OF A BLUE COPPER NITRITE REDUCTASE AT HIGH PH AND IN COPPER FREE FORM AT 1.9 A RESOLUTION 提交 2001-04-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；30% PEG 4K, 0.1M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1M TRIS-HCL PH8.5, pH 8.50
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.199 |
| 1NDT NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES XYLOSOXIDANS 提交 1998-10-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
26–359（334 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6；pH 4.60
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
| 1OE1 Atomic Resolution Structure of the Wildtype Native Nitrite Reductase from Alcaligenes xylosoxidans 提交 2003-03-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；40-50% PEG-MME 550, 0.1M MES PH 6.5, 10MM CUSO4
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.142 |
| 1OE2 Atomic Resolution Structure of D92E Mutant of Alcaligenes xylosoxidans Nitrite Reductase 提交 2003-03-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；0.1M MES PH6.5 40-50% PEG-MME 550, 10MM CUSO4,, pH 6.50
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.179 |
| 1OE3 Atomic resolution structure of 'Half Apo' NiR 提交 2003-03-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；40% PEG MME 550, 0.1M MES PH 6.5, 10MM ZNSO4
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.148 |
| 1WA0 Crystal Structure Of W138H Mutant Of Alcaligenes Xylosoxidans Nitrite Reductase 提交 2004-10-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 X
25–360（336 aa）
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 6 SO4 SULFATE ION × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；CRYSTALS OF TRP138HIS NIR WERE GROWN BY THE HANGING-DROP VAPOUR DIFFUSION METHOD AT 21OC. 2ML OF 6-8 MG ML-1 PROTEIN IN 10 MM TRIS-HCL PH 7.1 WAS MIXED WITH AN EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION CONSISTING OF 25% PEG-MME 550, 10 MM ZINC SULPHATE, 0.1M MES PH 6.5 AND SUSPENDED OVER A 500 ML RESERVOIR. CRYSTALS WERE AN INTENSE BLUE COLOUR AND GREW WITHIN TWO DAYS TO APPROXIMATE DIMENSIONS 0.9 X 0.6 X 0.1 MM IN A RHOMBOHEDRAL MORPHOLOGY.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.192 |
| 1WA1 Crystal Structure Of H313Q Mutant Of Alcaligenes Xylosoxidans Nitrite Reductase 提交 2004-10-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 X
25–360（336 aa）
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；CRYSTALS OF HIS313GLN NIR WERE GROWN BY THE HANGING-DROP VAPOUR DIFFUSION METHOD AT 21OC. 2ML OF 6-8 MG ML-1 PROTEIN IN 10 MM TRIS-HCL PH 7.1 WAS MIXED WITH AN EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION CONSISTING OF 25% PEG-MME 550, 10 MM ZINC SULPHATE, 0.1M MES PH 6.5 AND SUSPENDED OVER A 500 ML RESERVOIR. CRYSTALS OF BOTH MUTANTS WERE AN INTENSE BLUE COLOUR AND GREW WITHIN TWO DAYS TO APPROXIMATE DIMENSIONS 0.9 X 0.6 X 0.1 MM IN A RHOMBOHEDRAL MORPHOLOGY.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.191 |
| 1WA2 Crystal Structure Of H313Q Mutant Of Alcaligenes Xylosoxidans Nitrite Reductase with nitrite bound 提交 2004-10-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 X
25–360（336 aa）
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；CRYSTALS OF HIS313GLN NIR WERE GROWN BY THE HANGING-DROP VAPOUR DIFFUSION METHOD AT 21OC. 2ML OF 6-8 MG ML-1 PROTEIN IN 10 MM TRIS-HCL PH 7.1 WAS MIXED WITH AN EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION CONSISTING OF 25% PEG-MME 550, 10 MM ZINC SULPHATE, 0.1M MES PH 6.5 AND SUSPENDED OVER A 500 ML RESERVOIR. CRYSTALS OF BOTH MUTANTS WERE AN INTENSE BLUE COLOUR AND GREW WITHIN TWO DAYS TO APPROXIMATE DIMENSIONS 0.9 X 0.6 X 0.1 MM IN A RHOMBOHEDRAL MORPHOLOGY. FOR HIS313GLN_NO2.-, 10MM SODIUM NITRITE WAS ADDED TO THE RESERVOIR SOLUTION PRIOR TO CRYSTALLISATION.
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.210 |
| 1WAE Crystal structure of H129V Mutant of Alcaligenes Xylosoxidans Nitrite Reductase 提交 2004-10-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；100MM MES BUFFER PH 6.5 200MM ZNSO4, 40-50% PEG550 MME
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.226 |
| 2BO0 Crystal structure of the C130A mutant of nitrite reductase from Alcaligenes xylosoxidans 提交 2005-04-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 9 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；PEG 550 MME, ZNSO4, MES PH 6.5
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.113 |
| 2BP0 M144L mutant of nitrite reductase from Alcaligenes xylosoxidans 提交 2005-04-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 18 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å R-free 0.196 |
| 2BP0 M144L mutant of nitrite reductase from Alcaligenes xylosoxidans 提交 2005-04-17 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
25–360（336 aa）
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 15 SO4 SULFATE ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å R-free 0.196 |
| 2BP8 M144Q Structure of nitrite reductase from Alcaligenes xylosoxidans 提交 2005-04-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 15 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å R-free 0.189 |
| 2BP8 M144Q Structure of nitrite reductase from Alcaligenes xylosoxidans 提交 2005-04-18 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
25–360（336 aa）
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 15 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å R-free 0.189 |
| 2JFC M144L mutant of Nitrite Reductase from Alcaligenes xylosoxidans in space group P212121 提交 2007-01-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
链 D
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
链 E
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.2；pH 4.20
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.193 |
| 2JFC M144L mutant of Nitrite Reductase from Alcaligenes xylosoxidans in space group P212121 提交 2007-01-31 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
链 C
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
链 F
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.2；pH 4.20
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.193 |
| 2VM3 Structure of Alcaligenes xylosoxidans in space group R3 - 1 of 2 提交 2008-01-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
片段：RESIDUES 25-360
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.210 |
| 2VM4 Structure of Alcaligenes xylosoxidans nitrite reductase in space group R3 - 2 of 2 提交 2008-01-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
片段：RESIDUES 25-360
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.214 |
| 2VMJ Type 1 Copper-Binding Loop of Nitrite Reductase mutant: 130- CAPEGMVPWHVVSGM-144 to 130-CTPHPFM-136 提交 2008-01-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–154（130 aa）
片段：RESIDUES 25-154,168-360
链 A
168–360（193 aa）
片段：RESIDUES 25-154,168-360
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；50 MM HEPES PH 7.0, 5 MM ZNCL2 AND 10 % PEG 6000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.232 |
| 2VN3 Nitrite Reductase from Alcaligenes xylosoxidans 提交 2008-01-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
片段：RESIDUES 25-360
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；100 MM MES PH 6.5, 10 MM ZNSO4 AND 25 % PEG-MME 550
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.215 |
| 2VW4 NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES XYLOSOXIDANS - 2 OF 3 提交 2008-06-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
片段：RESIDUES 25-360
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.197 |
| 2VW4 NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES XYLOSOXIDANS - 2 OF 3 提交 2008-06-16 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
25–360（336 aa）
片段：RESIDUES 25-360
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.197 |
| 2VW6 NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES XYLOSOXIDANS - 3 OF 3 提交 2008-06-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
片段：RESIDUES 25-360
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.194 |
| 2VW6 NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES XYLOSOXIDANS - 3 OF 3 提交 2008-06-16 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
25–360（336 aa）
片段：RESIDUES 25-360
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.194 |
| 2VW7 Nitrite reductase from Alcaligenes xylosoxidans - 1 of 3 提交 2008-06-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
片段：RESIDUES 25-360
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 2VW7 Nitrite reductase from Alcaligenes xylosoxidans - 1 of 3 提交 2008-06-16 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
25–360（336 aa）
片段：RESIDUES 25-360
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 2XWZ STRUCTURE OF THE RECOMBINANT NATIVE NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES XYLOSOXIDANS complexed with nitrite 提交 2010-11-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
链 D
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
链 E
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 23 ACT ACETATE ION × 6 NO NITRIC OXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.25；1.8 M LITHIUM SULFATE, 100MM ACETATE BUFFER PH 4.25
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.199 |
| 2XWZ STRUCTURE OF THE RECOMBINANT NATIVE NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES XYLOSOXIDANS complexed with nitrite 提交 2010-11-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
链 C
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
链 F
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 21 ACT ACETATE ION × 5 NO NITRIC OXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.25；1.8 M LITHIUM SULFATE, 100MM ACETATE BUFFER PH 4.25
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.199 |
| 2XX0 STRUCTURE OF THE N90S-H254F MUTANT OF NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES XYLOSOXIDANS 提交 2010-11-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 9 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；ZNSO4, PEG 550 MME, MES PH 6.5
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.151 |
| 2XX0 STRUCTURE OF THE N90S-H254F MUTANT OF NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES XYLOSOXIDANS 提交 2010-11-07 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 9 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；ZNSO4, PEG 550 MME, MES PH 6.5
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分辨率 1.46 Å R-free 0.151 |
| 2XX1 STRUCTURE OF THE N90S MUTANT OF NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES XYLOSOXIDANS complexed with nitrite 提交 2010-11-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
链 D
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
链 E
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6；1.8 M AMMONIUM SULPHATE IN CITRATE BUFFER, PH 4.6
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.221 |
| 2XX1 STRUCTURE OF THE N90S MUTANT OF NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES XYLOSOXIDANS complexed with nitrite 提交 2010-11-07 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
链 C
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
链 F
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6；1.8 M AMMONIUM SULPHATE IN CITRATE BUFFER, PH 4.6
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.221 |
| 2XXF Cu metallated H254F mutant of nitrite reductase 提交 2010-11-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
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突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 9 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；PEG 550 MME, ZNSO4, MES PH 6.5
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.176 |
| 2XXF Cu metallated H254F mutant of nitrite reductase 提交 2010-11-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
26–360（335 aa）
片段：RESIDUES 26-360
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突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 9 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 12 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；PEG 550 MME, ZNSO4, MES PH 6.5
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.176 |
| 2XXG STRUCTURE OF THE N90S MUTANT OF NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES XYLOSOXIDANS 提交 2010-11-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
26–360（335 aa）
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突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；PEG 550 MME, ZNSO4, MES PH 6.5.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.211 |
| 2XXG STRUCTURE OF THE N90S MUTANT OF NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES XYLOSOXIDANS 提交 2010-11-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
26–360（335 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；PEG 550 MME, ZNSO4, MES PH 6.5.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.211 |
| 2ZON Crystal structure of electron transfer complex of nitrite reductase with cytochrome c 提交 2008-05-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
片段：UNP residues 25-360
链 B
25–360（336 aa）
片段：UNP residues 25-360
链 C
25–360（336 aa）
片段：UNP residues 25-360
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未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；PEG 3350, Magnesium acetate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.195 |
| 4CSP Structure of the F306C mutant of nitrite reductase from Achromobacter xylosoxidans 提交 2014-03-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
26–360（335 aa）
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 12 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
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分辨率 1.70 Å R-free 0.215 |
| 4CSP Structure of the F306C mutant of nitrite reductase from Achromobacter xylosoxidans 提交 2014-03-09 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
26–360（335 aa）
|
突变：YES | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 9 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
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分辨率 1.70 Å R-free 0.215 |
| 4CSZ STRUCTURE OF F306C MUTANT OF NITRITE REDUCTASE FROM Achromobacter XYLOSOXIDANS WITH NITRITE BOUND 提交 2014-03-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
26–360（335 aa）
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突变：YES | ZN ZINC ION × 21 CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；15% PEG550 MME, 50 MM ZNSO4, AND 50 MM MES BUFFER, pH 6.5
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分辨率 1.75 Å R-free 0.210 |
| 5B1J Crystal structure of the electron-transfer complex of copper nitrite reductase with a cupredoxin 提交 2015-12-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
片段：UNP residues 25-360
链 B
25–360（336 aa）
片段：UNP residues 25-360
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未记录 | CU COPPER (II) ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 3350, potassium chloride
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分辨率 3.00 Å R-free 0.233 |
| 5B1K Crystal structure of the chloride-bound form of blue copper nitrite reductase 提交 2015-12-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–360（336 aa）
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未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIQUID DIFFUSION；293 K；PEG 3350, Sodium Chloride, Magnesium Chloride
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分辨率 1.35 Å R-free 0.173 |
| 5ONX Resting state copper nitrite reductase determined by serial femtosecond rotation crystallography 提交 2017-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
26–360（335 aa）
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未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 3 OXY OXYGEN MOLECULE × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；10% w/v PEG 550 MME, 10 mM ZnSO4, 100 mM MES buffer pH 6.5
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分辨率 1.60 Å R-free 0.226 |
| 5ONY As-isolated resting state copper nitrite reductase from Achromobacter xylosoxidans 提交 2017-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
26–360（335 aa）
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未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；10% w/v PEG 550 MME, 10 mM ZnSO4, 100 mM MES buffer, pH 6.5
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分辨率 1.60 Å R-free 0.223 |