当前蛋白身份:O75351
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1WR0 Structural characterization of the MIT domain from human Vps4b 提交 2004-10-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–77(77 aa)
片段:MIT DOMAIN
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)NaCl 50mM;压力 1
NMR样品组成
1mM protein U-15N; 20mM Tris buffer; 50mM NaCl; 95% H2O, 5% D2O; 1mM DTT | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1mM protein U-15N,13C; 20mM Tris buffer; 50mM NaCl; 95% H2O, 5% D2O; 1mM DTT | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 1XWI Crystal Structure of VPS4B 提交 2004-11-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
123–444(322 aa)
片段:residues 123-444
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5;300 K;Ammonium Sulfate, HEPES, NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K, pH 7.50
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分辨率 2.80 Å R-free 0.260 |
| 2CPT Solution structure of MIT domain from human SKD1 提交 2005-05-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–104(104 aa)
片段:MIT domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成
1.11mM 13C, 15N-labeled protein; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d10-DTT; 0.02% NaN3 | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2JQH VPS4B MIT 提交 2007-06-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–86(86 aa)
片段:MIT domain, residues 1-86
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.65;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 ambient
NMR样品组成
1.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] VPS4B MIT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2JQK VPS4B MIT-CHMP2B Complex 提交 2007-06-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–86(86 aa)
片段:MIT domain, residues 1-86
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.65;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 ambient
NMR样品组成
0.48 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] VPS4B MIT, 4.8 mM CHMP2B(195-213), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2.84 mM VPS4B MIT, 0.26 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CHMP2B(195-213), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 4U7Y Structure of the complex of VPS4B MIT and IST1 MIM 提交 2014-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
片段:MIT domain (UNP residues 1-89)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;299 K;2.58 M Na-malonate
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分辨率 2.50 Å R-free 0.271 |
| 7L9X Structure of VPS4B in complex with an allele-specific covalent inhibitor 提交 2021-01-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–444(444 aa)
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未记录 | XQV N-{3-[(8-phenyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyridin-2-yl)amino]phenyl}propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;291.15 K;100 mM NH4SO4, 100 mM Hepes pH 7.5, 10% PEG 4000
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分辨率 2.81 Å R-free 0.267 |