当前蛋白身份:O75351 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1WR0 Structural characterization of the MIT domain from human Vps4b 提交 2004-10-07 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–77(77 aa) 片段:MIT DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)NaCl 50mM;压力 1
NMR样品组成 1mM protein U-15N; 20mM Tris buffer; 50mM NaCl; 95% H2O, 5% D2O; 1mM DTT | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1mM protein U-15N,13C; 20mM Tris buffer; 50mM NaCl; 95% H2O, 5% D2O; 1mM DTT | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
1XWI Crystal Structure of VPS4B 提交 2004-11-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 123–444(322 aa) 片段:residues 123-444
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;300 K;Ammonium Sulfate, HEPES, NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K, pH 7.50
分辨率 2.80 Å R-free 0.260
2CPT Solution structure of MIT domain from human SKD1 提交 2005-05-19 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–104(104 aa) 片段:MIT domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成 1.11mM 13C, 15N-labeled protein; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d10-DTT; 0.02% NaN3 | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2JQH VPS4B MIT 提交 2007-06-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–86(86 aa) 片段:MIT domain, residues 1-86
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.65;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 ambient
NMR样品组成 1.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] VPS4B MIT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2JQK VPS4B MIT-CHMP2B Complex 提交 2007-06-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–86(86 aa) 片段:MIT domain, residues 1-86
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.65;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 ambient
NMR样品组成 0.48 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] VPS4B MIT, 4.8 mM CHMP2B(195-213), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 2.84 mM VPS4B MIT, 0.26 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CHMP2B(195-213), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
4U7Y Structure of the complex of VPS4B MIT and IST1 MIM 提交 2014-07-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa) 片段:MIT domain (UNP residues 1-89)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;299 K;2.58 M Na-malonate
分辨率 2.50 Å R-free 0.271
7L9X Structure of VPS4B in complex with an allele-specific covalent inhibitor 提交 2021-01-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–444(444 aa)
未记录 XQV N-{3-[(8-phenyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyridin-2-yl)amino]phenyl}propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;291.15 K;100 mM NH4SO4, 100 mM Hepes pH 7.5, 10% PEG 4000
分辨率 2.81 Å R-free 0.267