当前蛋白身份:O75531 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1CI4 THE CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR (BAF) 提交 1999-04-07 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;DIALYSIS OF PROTEIN AT 8.3 MG/ML IN 20MM TRIS HCL AT PH7.0, 10%(W/V) GLYCEROL, 150MM NACL, 10MM DTT, AND 0.1MM EDTA AGAINST 20MM IMIDAZOLE AT PH 6.5, 80MM NACL, AND 10MM DTT. DIALYSIS DONE AT ROOM TEMPERATURE.(ALL CONCENTRATIONS ARE IN MILLI-MOLAR)
分辨率 1.90 Å R-free 0.262
1QCK SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR BAF, NMR, REGULARIZED MEAN STRUCTURE PLUS 20 INDIVIDUAL SIMULATED ANNEALING STRUCTURES 提交 1999-05-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;313 K
分辨率未提供
2BZF Structural basis for DNA bridging by barrier-to-autointegration factor (BAF) 提交 2005-08-16 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致
链 A 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.4;pH 7.40
分辨率 2.87 Å R-free 0.268
2EZX SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR BAF, NMR, REGULARIZED MEAN STRUCTURE 提交 1998-07-26 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;313 K
分辨率未提供
2EZY SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR BAF, NMR, ENSEMBLE OF 20 SIMULATED ANNEALING STRUCTURES 提交 1998-07-26 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;313 K
分辨率未提供
2EZZ SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR BAF NMR, ENSEMBLE OF 20 SIMULATED ANNEALING STRUCTURES 提交 1998-07-26 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;313 K
分辨率未提供
2ODG Complex of barrier-to-autointegration factor and LEM-domain of emerin 提交 2006-12-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa) 片段:RESIDUES 1-89
链 B 1–89(89 aa) 片段:RESIDUES 1-89
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;303 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM POTASSIUM PHOSPHATE 200 mM NACL
分辨率未提供
6GHD Structural analysis of the ternary complex between lamin A/C, BAF and emerin identifies an interface disrupted in autosomal recessive progeroid diseases 提交 2018-05-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D 2–89(88 aa)
链 E 2–89(88 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;25% PEG3.350, 20mM Tris-BispH5.5, 30mM NaCl, 0.2M NH4SO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.247
6GHD Structural analysis of the ternary complex between lamin A/C, BAF and emerin identifies an interface disrupted in autosomal recessive progeroid diseases 提交 2018-05-07 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 2–89(88 aa)
链 C 2–89(88 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;25% PEG3.350, 20mM Tris-BispH5.5, 30mM NaCl, 0.2M NH4SO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.247
6UNT Barrier-to-autointegration factor soaked in DMSO: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.75 Å R-free 0.223
6URE Barrier-to-autointegration factor Aqueous: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.202
6URJ Barrier-to-autointegration factor soaked in Acetone: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.192
6URK Barrier-to-autointegration factor soaked in Glycerol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.86 Å R-free 0.226
6URL Barrier-to-autointegration factor soaked in isopropanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.72 Å R-free 0.201
6URN Barrier-to-autointegration factor t-butanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.68 Å R-free 0.204
6URR Barrier-to-autointegration factor soaked in Dioxane: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.80 Å R-free 0.230
6URZ Barrier-to-autointegration factor soaked in methanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 EOH ETHANOL × 2 MOH METHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.201
6US0 Barrier-to-autointegration factor soaked in R,S,R-bisfuranol (RSR): 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.201
6US1 Barrier-to-autointegration factor soaked in isobutanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.199
6US7 Barrier-to-autointegration factor soaked in TMAO: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.198
6USB Barrier-to-autointegration factor soaked in urea: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-25 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.68 Å R-free 0.210
6USD Barrier-to-autointegration factor soaked in ethanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-25 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 EOH ETHANOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.202
6USI Barrier-to-autointegration factor soaked in 1,6-hexanediol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-26 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–89(89 aa)
链 B 1–89(89 aa)
未记录 EOH ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
分辨率 1.65 Å R-free 0.208
7ABM X-ray structure of phosphorylated Barrier-to-autointegration factor (BAF) 提交 2020-09-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 3–88(86 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CS CESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;pBAF was crystallized by the hanging drop method against 0.2 M sodium fluoride, 20% w/v PEG 3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
7NDY Di-phosphorylated Barrier-to-Autointegration Factor (BAF) in complex with LEM domain of Emerin 提交 2021-02-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 2–89(88 aa)
链 B 2–89(88 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;Hepes Sodium salt 0.1 M pH 7.5 PEG 600 25% W/V
分辨率 1.44 Å R-free 0.225
7Z21 BAF A12T bound to the lamin A/C Ig-fold domain 提交 2022-02-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 2–89(88 aa)
链 C 2–89(88 aa)
突变:A12T 突变:A12T CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;3 M ammonium sulfate 0.1 M bicine pH 9
分辨率 1.63 Å R-free 0.300
7Z21 BAF A12T bound to the lamin A/C Ig-fold domain 提交 2022-02-25 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 2–89(88 aa)
链 D 2–89(88 aa)
突变:A12T 突变:A12T CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;3 M ammonium sulfate 0.1 M bicine pH 9
分辨率 1.63 Å R-free 0.300
9J8M Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (High mobility complex) 提交 2024-08-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致
链 K 1–89(89 aa)
链 L 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
9J8N Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (Low mobility complex) 提交 2024-08-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物一致
链 K 1–89(89 aa)
链 L 1–89(89 aa)
链 N 1–89(89 aa)
链 O 1–89(89 aa)
链 k 1–89(89 aa)
链 l 1–89(89 aa)
链 n 1–89(89 aa)
链 o 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.14 Å
9J8O Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-H1-nucleosome complex 提交 2024-08-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致
链 K 1–89(89 aa)
链 L 1–89(89 aa)
链 k 1–89(89 aa)
链 l 1–89(89 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.05 Å