当前蛋白身份:O75531
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CI4 THE CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR (BAF) 提交 1999-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5;DIALYSIS OF PROTEIN AT 8.3 MG/ML IN 20MM TRIS HCL AT PH7.0, 10%(W/V) GLYCEROL,
150MM NACL, 10MM DTT, AND 0.1MM EDTA AGAINST 20MM IMIDAZOLE AT PH 6.5, 80MM
NACL, AND 10MM DTT. DIALYSIS DONE AT ROOM TEMPERATURE.(ALL CONCENTRATIONS ARE IN
MILLI-MOLAR)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.262 |
| 1QCK SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR BAF, NMR, REGULARIZED MEAN STRUCTURE PLUS 20 INDIVIDUAL SIMULATED ANNEALING STRUCTURES 提交 1999-05-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5;313 K
|
分辨率未提供 |
| 2BZF Structural basis for DNA bridging by barrier-to-autointegration factor (BAF) 提交 2005-08-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4;pH 7.40
|
分辨率 2.87 Å R-free 0.268 |
| 2EZX SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR BAF, NMR, REGULARIZED MEAN STRUCTURE 提交 1998-07-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5;313 K
|
分辨率未提供 |
| 2EZY SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR BAF, NMR, ENSEMBLE OF 20 SIMULATED ANNEALING STRUCTURES 提交 1998-07-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5;313 K
|
分辨率未提供 |
| 2EZZ SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN BARRIER-TO-AUTOINTEGRATION FACTOR BAF NMR, ENSEMBLE OF 20 SIMULATED ANNEALING STRUCTURES 提交 1998-07-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5;313 K
|
分辨率未提供 |
| 2ODG Complex of barrier-to-autointegration factor and LEM-domain of emerin 提交 2006-12-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
片段:RESIDUES 1-89
链 B
1–89(89 aa)
片段:RESIDUES 1-89
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5;303 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM POTASSIUM PHOSPHATE 200 mM NACL
|
分辨率未提供 |
| 6GHD Structural analysis of the ternary complex between lamin A/C, BAF and emerin identifies an interface disrupted in autosomal recessive progeroid diseases 提交 2018-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 D
2–89(88 aa)
链 E
2–89(88 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;25% PEG3.350, 20mM Tris-BispH5.5, 30mM NaCl, 0.2M NH4SO4
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.247 |
| 6GHD Structural analysis of the ternary complex between lamin A/C, BAF and emerin identifies an interface disrupted in autosomal recessive progeroid diseases 提交 2018-05-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
2–89(88 aa)
链 C
2–89(88 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;25% PEG3.350, 20mM Tris-BispH5.5, 30mM NaCl, 0.2M NH4SO4
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.247 |
| 6UNT Barrier-to-autointegration factor soaked in DMSO: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | EOH ETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.223 |
| 6URE Barrier-to-autointegration factor Aqueous: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | EOH ETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.202 |
| 6URJ Barrier-to-autointegration factor soaked in Acetone: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | EOH ETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.192 |
| 6URK Barrier-to-autointegration factor soaked in Glycerol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | EOH ETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.226 |
| 6URL Barrier-to-autointegration factor soaked in isopropanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | EOH ETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.201 |
| 6URN Barrier-to-autointegration factor t-butanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | EOH ETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.204 |
| 6URR Barrier-to-autointegration factor soaked in Dioxane: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | EOH ETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 6URZ Barrier-to-autointegration factor soaked in methanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | EOH ETHANOL × 2 MOH METHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.201 |
| 6US0 Barrier-to-autointegration factor soaked in R,S,R-bisfuranol (RSR): 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | EOH ETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.201 |
| 6US1 Barrier-to-autointegration factor soaked in isobutanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | EOH ETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.199 |
| 6US7 Barrier-to-autointegration factor soaked in TMAO: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | EOH ETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.198 |
| 6USB Barrier-to-autointegration factor soaked in urea: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | EOH ETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.210 |
| 6USD Barrier-to-autointegration factor soaked in ethanol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | EOH ETHANOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.202 |
| 6USI Barrier-to-autointegration factor soaked in 1,6-hexanediol: 1 of 14 in MSCS set 提交 2019-10-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–89(89 aa)
链 B
1–89(89 aa)
|
未记录 | EOH ETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277.15 K;80 mM Tris pH 8.5, 16% Ethanol, 10% PEG-1450
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.208 |
| 7ABM X-ray structure of phosphorylated Barrier-to-autointegration factor (BAF) 提交 2020-09-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
3–88(86 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CS CESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;pBAF was crystallized by the hanging drop method against 0.2 M sodium fluoride, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.326 |
| 7NDY Di-phosphorylated Barrier-to-Autointegration Factor (BAF) in complex with LEM domain of Emerin 提交 2021-02-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
2–89(88 aa)
链 B
2–89(88 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;Hepes Sodium salt 0.1 M pH 7.5
PEG 600 25% W/V
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.225 |
| 7Z21 BAF A12T bound to the lamin A/C Ig-fold domain 提交 2022-02-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
2–89(88 aa)
链 C
2–89(88 aa)
|
突变:A12T 突变:A12T | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;3 M ammonium sulfate
0.1 M bicine pH 9
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.300 |
| 7Z21 BAF A12T bound to the lamin A/C Ig-fold domain 提交 2022-02-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
2–89(88 aa)
链 D
2–89(88 aa)
|
突变:A12T 突变:A12T | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;3 M ammonium sulfate
0.1 M bicine pH 9
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.300 |
| 9J8M Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (High mobility complex) 提交 2024-08-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–89(89 aa)
链 L
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.82 Å |
| 9J8N Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (Low mobility complex) 提交 2024-08-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–89(89 aa)
链 L
1–89(89 aa)
链 N
1–89(89 aa)
链 O
1–89(89 aa)
链 k
1–89(89 aa)
链 l
1–89(89 aa)
链 n
1–89(89 aa)
链 o
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.14 Å |
| 9J8O Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-H1-nucleosome complex 提交 2024-08-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–89(89 aa)
链 L
1–89(89 aa)
链 k
1–89(89 aa)
链 l
1–89(89 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.05 Å |