当前蛋白身份：O75762
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3J9P Structure of the TRPA1 ion channel determined by electron cryo-microscopy 提交 2015-02-14 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1119（1118 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
2–1119（1118 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 C
2–1119（1118 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 D
2–1119（1118 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM HEPES, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 1 mM IP6；pH 8；20 mM HEPES, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 1 mM IP6
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 7 seconds before plunging.；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 7 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
|
分辨率 4.24 Å |
| 6HC8 Factor Inhibiting HIF (FIH) in complex with zinc, NOG and TRPA1 (313-339) 提交 2018-08-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
313–339（27 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 OGA N-OXALYLGLYCINE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH = 7.5,
1.6 M ammonium
sulfate, 6% PEG400
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.189 |
| 6PQO Cryo-EM structure of the human TRPA1 ion channel in complex with the covalent agonist JT010 提交 2019-07-09 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1119（1118 aa）
链 B
2–1119（1118 aa）
链 C
2–1119（1118 aa）
链 D
2–1119（1118 aa）
|
未记录 | JT0 2-chloro-N-[4-(4-methoxyphenyl)-1,3-thiazol-2-yl]-N-(3-methoxypropyl)acetamide × 4 LBN 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine × 8 6OU [(2~{R})-1-[2-azanylethoxy(oxidanyl)phosphoryl]oxy-3-hexadecanoyloxy-propan-2-yl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 16 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.88 Å |
| 6PQP Cryo-EM structure of the human TRPA1 ion channel in complex with the covalent agonist BITC 提交 2019-07-09 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1119（1118 aa）
链 B
2–1119（1118 aa）
链 C
2–1119（1118 aa）
链 D
2–1119（1118 aa）
|
未记录 | 9BE N-benzylthioformamide × 4 6OU [(2~{R})-1-[2-azanylethoxy(oxidanyl)phosphoryl]oxy-3-hexadecanoyloxy-propan-2-yl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 20 LBN 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.06 Å |
| 6PQQ Cryo-EM structure of human TRPA1 C621S mutant in the apo state 提交 2019-07-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1119（1118 aa）
链 B
2–1119（1118 aa）
链 C
2–1119（1118 aa）
链 D
2–1119（1118 aa）
|
突变：C621S 突变：C621S 突变：C621S 突变：C621S | LBN 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine × 8 6OU [(2~{R})-1-[2-azanylethoxy(oxidanyl)phosphoryl]oxy-3-hexadecanoyloxy-propan-2-yl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 20 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å |
| 6V9V Structure of TRPA1 modified by Bodipy-iodoacetamide with bound calcium, LMNG 提交 2019-12-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1119（1119 aa）
链 B
1–1119（1119 aa）
链 C
1–1119（1119 aa）
链 D
1–1119（1119 aa）
|
突变：D966E 突变：D966E 突变：D966E 突变：D966E | QT4 ~{N}-[[2,2-bis(fluoranyl)-10,12-dimethyl-1,3-diaza-2$l^{4}-boratricyclo[7.3.0.0^{3,7}]dodeca-4,6,9,11-tetraen-4-yl]methyl]ethanamide × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 6V9W Structure of TRPA1 (ligand-free) with bound calcium, LMNG 提交 2019-12-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1119（1119 aa）
链 B
1–1119（1119 aa）
链 C
1–1119（1119 aa）
链 D
1–1119（1119 aa）
|
突变：D966E 突变：D966E 突变：D966E 突变：D966E | CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 6V9X Structure of TRPA1 modified by iodoacetamide, PMAL-C8 提交 2019-12-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1119（1119 aa）
链 B
1–1119（1119 aa）
链 C
1–1119（1119 aa）
链 D
1–1119（1119 aa）
|
突变：D966E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D966E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D966E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D966E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6V9Y Structure of TRPA1 bound with A-967079, PMAL-C8 提交 2019-12-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1119（1119 aa）
链 B
1–1119（1119 aa）
链 C
1–1119（1119 aa）
链 D
1–1119（1119 aa）
|
突变：D966E 突变：D966E 突变：D966E 突变：D966E | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6WJ5 Structure of human TRPA1 in complex with inhibitor GDC-0334 提交 2020-04-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
448–1078（631 aa）
链 B
448–1078（631 aa）
链 C
448–1078（631 aa）
链 D
448–1078（631 aa）
|
未记录 | LXY (4R,5S)-4-fluoro-1-[(4-fluorophenyl)sulfonyl]-5-methyl-N-({5-(trifluoromethyl)-2-[2-(trifluoromethyl)pyrimidin-5-yl]pyridin-4-yl}methyl)-L-prolinamide × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；2 x 4s blot time
|
分辨率 3.60 Å |
| 6X2J Structure of human TRPA1 in complex with agonist GNE551 提交 2020-05-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
448–1078（631 aa）
链 B
448–1078（631 aa）
链 C
448–1078（631 aa）
链 D
448–1078（631 aa）
|
未记录 | ULJ 5-amino-1-[(4-bromo-2-fluorophenyl)methyl]-N-(2,5-dimethoxyphenyl)-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Triple blot.
Put blot in vitroblot
Apply 3.5ul to grid, wait 30sec, blot manually
Apply 3.5ul to grid, wait 30sec, blot manually,
apply final 3.5ul, final blot by vitrobot (3.5s)
|
分辨率 3.00 Å |
| 7JUP Structure of human TRPA1 in complex with antagonist compound 21 提交 2020-08-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
448–1078（631 aa）
链 B
448–1078（631 aa）
链 C
448–1078（631 aa）
链 D
448–1078（631 aa）
|
未记录 | VKM 1-({3-[(3R,5R)-5-(4-fluorophenyl)oxolan-3-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl}methyl)-7-methyl-1,7-dihydro-6H-purin-6-one × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Triple blot.
Put blot in vitroblot
Apply 3.5ul to grid, wait 30sec, blot manually
Apply 3.5ul to grid, wait 30sec, blot manually,
apply final 3.5ul, final blot by vitrobot (3.5s)
|
分辨率 3.05 Å |
| 7OR0 Cryo-EM structure of the human TRPA1 ion channel in complex with the antagonist 3-60, conformation 2 提交 2021-06-04 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1119（1119 aa）
链 B
1–1119（1119 aa）
链 C
1–1119（1119 aa）
链 D
1–1119（1119 aa）
|
未记录 | 0IG ~{N}-[4-[4-[(azanylidene-$l^{4}-azanylidene)amino]phenyl]-1,3-thiazol-2-yl]-2-[1,3-dimethyl-2,6-bis(oxidanylidene)purin-7-yl]ethanamide × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 8 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.64 Å |
| 7OR1 Cryo-EM structure of the human TRPA1 ion channel in complex with the antagonist 3-60, conformation 1 提交 2021-06-04 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1119（1119 aa）
链 B
1–1119（1119 aa）
链 C
1–1119（1119 aa）
链 D
1–1119（1119 aa）
|
未记录 | 0IG ~{N}-[4-[4-[(azanylidene-$l^{4}-azanylidene)amino]phenyl]-1,3-thiazol-2-yl]-2-[1,3-dimethyl-2,6-bis(oxidanylidene)purin-7-yl]ethanamide × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 8 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.64 Å |
| 9M8N Cryo-EM structure of the human TRPA1 ion channel in complex with crotalphine. 提交 2025-03-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1119（1119 aa）
链 B
1–1119（1119 aa）
链 C
1–1119（1119 aa）
链 D
1–1119（1119 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.81 Å |
| 9M8S Cryo-EM structure of the human TRPA1 ion channel in ligand-free state. 提交 2025-03-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1119（1119 aa）
链 B
1–1119（1119 aa）
链 C
1–1119（1119 aa）
链 D
1–1119（1119 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9MOE Preclinical and clinical evaluation of a novel TRPA1 antagonist LY3526318 提交 2024-12-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1119（1118 aa）
链 B
2–1119（1118 aa）
链 D
2–1119（1118 aa）
链 E
2–1119（1118 aa）
|
未记录 | A1BNO (2S)-2-{3-methyl-1-[(3-methyl-1,2,4-oxadiazol-5-yl)methyl]-2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydro-7H-purin-7-yl}-N-{6-[2-(trifluoromethyl)pyrimidin-5-yl]pyridin-2-yl}propanamide × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM HEPES, pH 8, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP and 0.01% LMNG
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |