当前蛋白身份:O75822 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2KRB Solution structure of EIF3B-RRM bound to EIF3J peptide 提交 2009-12-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 45–55(11 aa) 片段:UNP residues 45-55
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1;压力 AMBIENT
NMR样品组成 0.7 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] eIF3b-RRM, 0.85 mM eIF3j peptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.7 mM eIF3b-RRM, 0.85 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] eIF3j peptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.7 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] eIF3b-RRM, 0.85 mM eIF3j peptide, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
3BPJ Crystal structure of human translation initiation factor 3, subunit 1 alpha 提交 2007-12-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 141–220(80 aa) 片段:Proteolytic fragment: Residues 141-220
链 C 141–220(80 aa) 片段:Proteolytic fragment: Residues 141-220
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;291 K;25% PEG 3350, 0.1M Sodium acetate. Chymotrypsin was added to the crystallization sample at a molar ratio of approx. 1:100, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.85 Å R-free 0.263
3BPJ Crystal structure of human translation initiation factor 3, subunit 1 alpha 提交 2007-12-18 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 141–220(80 aa) 片段:Proteolytic fragment: Residues 141-220
链 D 141–220(80 aa) 片段:Proteolytic fragment: Residues 141-220
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;291 K;25% PEG 3350, 0.1M Sodium acetate. Chymotrypsin was added to the crystallization sample at a molar ratio of approx. 1:100, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.85 Å R-free 0.263
6YBW Structure of a human 48S translational initiation complex - 40S body 提交 2020-03-18 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:26-meric(26) 与全部聚合物一致
链 z 1–258(258 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 60 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6ZMW Structure of a human 48S translational initiation complex 提交 2020-07-04 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致
链 z 1–258(258 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 89 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6ZVJ Structure of a human ABCE1-bound 43S pre-initiation complex - State II 提交 2020-07-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:51-meric(51) 与全部聚合物一致
链 G 1–258(258 aa)
链 J 1–258(258 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å