当前蛋白身份：O95400
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1GYF GYF DOMAIN FROM HUMAN CD2BP2 PROTEIN 提交 1999-04-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
280–341（62 aa）
片段：CD2-BINDING DOMAIN
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NAPO4
NMR样品组成
90% WATER/10%D2O
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分辨率未提供 |
| 1L2Z CD2BP2-GYF domain in complex with proline-rich CD2 tail segment peptide 提交 2002-02-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
280–341（62 aa）
片段：Residue 1-62
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaPo4；压力 1
NMR测量条件
pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaPo4；压力 1
NMR样品组成
1 mM GYF domain U-deuterated, U-15N, 1mM Peptide, 50 mM phosphate buffer, pH 6.3, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1 mM GYF domain, aromatic amino acids protonated only, 1 mM Peptide protonated | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 1SYX The crystal structure of a binary U5 snRNP complex 提交 2004-04-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
262–341（80 aa）
片段：86 amino acid C-terminal fragment
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 2000mme, MES, calcium acetate, 1,4-butanediol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.35 Å R-free 0.262 |
| 1SYX The crystal structure of a binary U5 snRNP complex 提交 2004-04-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
262–341（80 aa）
片段：86 amino acid C-terminal fragment
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 2000mme, MES, calcium acetate, 1,4-butanediol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.35 Å R-free 0.262 |
| 1SYX The crystal structure of a binary U5 snRNP complex 提交 2004-04-02 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
262–341（80 aa）
片段：86 amino acid C-terminal fragment
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 2000mme, MES, calcium acetate, 1,4-butanediol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.35 Å R-free 0.262 |
| 4BWS Crystal structure of the heterotrimer of PQBP1, U5-15kD and U5-52kD. 提交 2013-07-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
280–341（62 aa）
片段：RESIDUES 280-341
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.277 |
| 4BWS Crystal structure of the heterotrimer of PQBP1, U5-15kD and U5-52kD. 提交 2013-07-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
280–341（62 aa）
片段：RESIDUES 280-341
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.277 |
| 8Q7Q Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperones CD2BP2 and TSSC4 (State 2) 提交 2023-08-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric（15） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–341（341 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |
| 8Q7V Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperones CD2BP2 and TSSC4 (State 1) 提交 2023-08-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric（15） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–341（341 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8Q7W Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 3) 提交 2023-08-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric（15） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–341（341 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.90 Å |
| 8Q7X Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 4) 提交 2023-08-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric（15） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–341（341 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.60 Å |
| 8Q91 Structure of the human 20S U5 snRNP core 提交 2023-08-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–341（341 aa）
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未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å |
| 8RC0 Structure of the human 20S U5 snRNP 提交 2023-12-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric（15） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–341（341 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |