当前蛋白身份：O95931
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2K1B Solution NMR structure of the chromo domain of the chromobox protein homolog 7 提交 2008-02-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
7–62（56 aa）
片段：Chromo domain: Residues 7-62
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300；压力 ambient
NMR样品组成
10 mM phosphate, 300 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2L1B Solution NMR structure of the chromobox protein Cbx7 with H3K27me3 提交 2010-07-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
8–62（55 aa）
片段：UNP Residues 7-62
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-13C; U-15N] protein, 2.7 mM peptide, 10 mM sodium phosphate, 300 mM sodium chloride, 0.5 mM PMSF, 0.5 mM TCEP, 1 mM Benzamidine, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 3GS2 Ring1B C-terminal domain/Cbx7 Cbox Complex 提交 2009-03-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
219–248（30 aa）
片段：Cbox domain, residues 219-248
链 D
219–248（30 aa）
片段：Cbox domain, residues 219-248
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；25% PEG MME 550, 0.1 M MES, 0.01 M zinc sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.243 |
| 3GS2 Ring1B C-terminal domain/Cbx7 Cbox Complex 提交 2009-03-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
219–248（30 aa）
片段：Cbox domain, residues 219-248
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；25% PEG MME 550, 0.1 M MES, 0.01 M zinc sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.243 |
| 3GS2 Ring1B C-terminal domain/Cbx7 Cbox Complex 提交 2009-03-26 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
219–248（30 aa）
片段：Cbox domain, residues 219-248
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；25% PEG MME 550, 0.1 M MES, 0.01 M zinc sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.243 |
| 4MN3 Chromodomain antagonists that target the polycomb-group methyllysine reader protein Chromobox homolog 7 (CBX7) 提交 2013-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
7–62（56 aa）
片段：protein
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；40% ethylene glycol, 0.1M HEPES pH 7.5, 5% PEG 3000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.54 Å R-free 0.213 |
| 5EPJ Crystal Structure of chromodomain of CBX7 in complex with inhibitor UNC3866 提交 2015-11-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
7–62（56 aa）
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 13 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M ammonium formate
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分辨率 1.60 Å R-free 0.260 |
| 6V2R Crystal Structure of chromodomain of CBX7 mutant V13A in complex with inhibitor UNC3866 提交 2019-11-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
7–62（56 aa）
片段：Chromodomain
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突变：V13A | UNX UNKNOWN LIGAND × 17 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris propane, pH 7
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.235 |
| 8SII Crystal Structure of CBX7 with compound UNC4976 提交 2023-04-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
7–62（56 aa）
片段：chromodomain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；2.5 M Ammonium Sulfate, 0.1 M BIS-Tris propane PH7.0
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.223 |
| 8SII Crystal Structure of CBX7 with compound UNC4976 提交 2023-04-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
7–62（56 aa）
片段：chromodomain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；2.5 M Ammonium Sulfate, 0.1 M BIS-Tris propane PH7.0
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分辨率 1.37 Å R-free 0.223 |
| 9V9P Cryo-EM structure of the cPRC1-di-nucleosome (CBX7) complex 提交 2025-06-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 S
1–251（251 aa）
链 Y
1–251（251 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.40 Å |