当前蛋白身份:P00736 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1APQ STRUCTURE OF THE EGF-LIKE MODULE OF HUMAN C1R, NMR, 19 STRUCTURES 提交 1997-07-22 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 140–192(53 aa) 片段:EGF-LIKE MODULE
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.7;288 K
分辨率未提供
1GPZ THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE ZYMOGEN CATALYTIC DOMAIN OF COMPLEMENT PROTEASE C1R 提交 2001-11-15 Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 307–705(399 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN C1R, RESIDUES 307-705
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;293 K;1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1M TAPS, PH 8.5, AT 20 DEG C.
分辨率 2.90 Å R-free 0.290
1GPZ THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE ZYMOGEN CATALYTIC DOMAIN OF COMPLEMENT PROTEASE C1R 提交 2001-11-15 Assembly 2 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 307–705(399 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN C1R, RESIDUES 307-705
突变:YES NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;293 K;1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1M TAPS, PH 8.5, AT 20 DEG C.
分辨率 2.90 Å R-free 0.290
1MD7 Monomeric structure of the zymogen of complement protease C1r 提交 2002-08-07 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 375–702(328 aa) 片段:C-terminal CCP-SP domain
突变:S637A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.4;293 K;ammonium sulfate, TAPS, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.285
1MD8 Monomeric structure of the active catalytic domain of complement protease C1r 提交 2002-08-07 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 375–703(329 aa) 片段:C-terminal CCP-SP domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.4;293 K;ammonium sulfate, TAPS, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.269
2QY0 Active dimeric structure of the catalytic domain of C1r reveals enzyme-product like contacts 提交 2007-08-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 309–463(155 aa) 片段:Sushi-1 and Sushi-2 domains, CCP1-CCP2
链 B 464–705(242 aa) 片段:Peptidase S1 domain
链 C 309–463(155 aa) 片段:Sushi-1 and Sushi-2 domains, CCP1-CCP2
链 D 464–705(242 aa) 片段:Peptidase S1 domain
未记录 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;288 K;14% (w/v) PEG 6000, 0.2 M NaCl, 10% (v/v) glycerol, 0.1 M Tris HCl, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.60 Å R-free 0.259
6F1C C1rC1s complex 提交 2017-11-21 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 18–308(291 aa)
链 C 18–308(291 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 12 NA SODIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;12-18% PEG 8000, 100 mM Imidazole at pH 8.0
分辨率 4.20 Å R-free 0.305
6F1D CUB2 domain of C1r 提交 2017-11-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 191–307(117 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;298 K;50 mM Tris-HCl at pH 8.5 containing 25% PEG-8K, 2 mM CaCl2 and 3% 1,6-diaminohexane
分辨率 1.95 Å R-free 0.202
6F1H C1rC1s complex 提交 2017-11-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 18–308(291 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;12-18% PEG 8000, 100 mM Imidazole at pH 8.0
分辨率 4.50 Å R-free 0.340
6F1H C1rC1s complex 提交 2017-11-22 Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 18–308(291 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 3 LYS LYSINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;12-18% PEG 8000, 100 mM Imidazole at pH 8.0
分辨率 4.50 Å R-free 0.340
6F39 C1r homodimer CUB1-EGF-CUB2 提交 2017-11-28 Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 22–306(285 aa)
链 B 22–306(285 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;12-18% PEG 8000, 100 mM Imidazole at pH 8.0
分辨率 5.80 Å R-free 0.338
7MZT Borrelia burgdorferi BBK32-C in complex with an autolytic fragment of human C1r at 4.1A 提交 2021-05-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 300–463(164 aa)
链 B 464–705(242 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Sodium formate, 27.5% Polyethylene glycol 3,350
分辨率 4.07 Å R-free 0.372
9EKD Structure of a C1r Zymogen Fragment Bound to SALO 提交 2024-12-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 308–705(398 aa) 片段:residues 308-705
突变:S654A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M BIS-TRIS (pH 5.6), 0.2 M ammonium sulfate, 20% (w/v) PEG-3350
分辨率 3.28 Å R-free 0.286
9EKD Structure of a C1r Zymogen Fragment Bound to SALO 提交 2024-12-02 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 308–705(398 aa) 片段:residues 308-705
突变:S654A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M BIS-TRIS (pH 5.6), 0.2 M ammonium sulfate, 20% (w/v) PEG-3350
分辨率 3.28 Å R-free 0.286
9EKE Structure of a C1r Zymogen Fragment Bound to SALO, Y51F Mutant 提交 2024-12-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 308–705(398 aa)
突变:S654A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2 M ammonium citrate tribasic (pH 7.0), 20% (w/v) PEG-3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.278
9EKE Structure of a C1r Zymogen Fragment Bound to SALO, Y51F Mutant 提交 2024-12-02 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 308–705(398 aa)
突变:S654A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2 M ammonium citrate tribasic (pH 7.0), 20% (w/v) PEG-3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.278