当前蛋白身份:P00738 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4WJG Structure of T. brucei haptoglobin-hemoglobin receptor binding to human haptoglobin-hemoglobin 提交 2014-09-30 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:Decameric(10) 与蛋白数一致
链 C 92–406(315 aa)
链 H 92–406(315 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXY OXYGEN MOLECULE × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;277 K;15% Polyethylene glycol (PEG) 1500, 0.1M Bis-Tris
分辨率 3.10 Å R-free 0.271
4WJG Structure of T. brucei haptoglobin-hemoglobin receptor binding to human haptoglobin-hemoglobin 提交 2014-09-30 Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:Decameric(10) 与蛋白数一致
链 M 92–406(315 aa)
链 R 92–406(315 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXY OXYGEN MOLECULE × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;277 K;15% Polyethylene glycol (PEG) 1500, 0.1M Bis-Tris
分辨率 3.10 Å R-free 0.271
4WJG Structure of T. brucei haptoglobin-hemoglobin receptor binding to human haptoglobin-hemoglobin 提交 2014-09-30 Assembly 3 其他组合 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:Decameric(10) 与蛋白数一致
链 2 92–406(315 aa)
链 W 92–406(315 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 OXY OXYGEN MOLECULE × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;277 K;15% Polyethylene glycol (PEG) 1500, 0.1M Bis-Tris
分辨率 3.10 Å R-free 0.271
4X0L Human haptoglobin-haemoglobin complex 提交 2014-11-21 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 148–406(259 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 OXY OXYGEN MOLECULE × 2 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 CAC CACODYLATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M NaCl, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5 and 2 M ammonium sulphate
分辨率 2.05 Å R-free 0.224
5HU6 Structure of the T. brucei haptoglobin-haemoglobin receptor bound to human haptolgobin-haemoglobin 提交 2016-01-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 148–406(259 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 OXY OXYGEN MOLECULE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;12.5% v/v MPD, 0.03 M NaBr, 0.03M NaI, 0.03M NaF, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5, 12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.226
6TB2 Structure of human haptoglobin-hemoglobin bound to S. aureus IsdH 提交 2019-10-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 C 148–406(259 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M sodium citrate tribasic dihydrate, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
8XMP Structure of CD163 in complex with Hb-Hp 提交 2023-12-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 2 1–347(347 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 CA CALCIUM ION × 23 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
8XMQ Structure of dimeric CD163 in complex with Hb-Hp 提交 2023-12-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 2 1–347(347 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 CA CALCIUM ION × 12 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å
8XMW Local refinement of Hb-Hp bind to CD163 提交 2023-12-28 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 2 1–347(347 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 6 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
9FHB Cryo-EM structure of human CD163 SRCR2-4 in complex with haptoglobin-hemoglobin 提交 2024-05-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–406(406 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.87 Å
9FMU Cryo-EM structure of human CD163 SRCR1-9 in complex with haptoglobin-hemoglobin 提交 2024-06-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 C 1–347(347 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CA CALCIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.46 Å
9FNM Structure of human haptoglobin 提交 2024-06-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 19–101(83 aa)
链 B 162–406(245 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.5;277 K;6% 2-propanol 0.1 M sodium acetate trihydrate 26% PEG MME 550
分辨率 2.52 Å R-free 0.227
9FNO Cryo-EM structure of human CD163 SRCR1-9 in complex with haptoglobin-hemoglobin 提交 2024-06-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 C 19–101(83 aa)
链 D 162–406(245 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
9HEJ Dimeric CD163 bound to human haptoglobin-haemoglobin complex 提交 2024-11-14 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 F 1–347(347 aa)
链 G 1–347(347 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 9 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 OXY OXYGEN MOLECULE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9HEK Trimeric CD163 bound to human haptoglobin-haemoglobin complex 提交 2024-11-14 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 F 1–347(347 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 19 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 OXY OXYGEN MOLECULE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
9NB6 Cryo-EM structure of the CD163/Hp(1-1)Hb complex 提交 2025-02-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 F 1–347(347 aa)
链 G 1–347(347 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 CA CALCIUM ION × 23 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 OXY OXYGEN MOLECULE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9NB8 Cryo-EM structure of the CD163/HpSPHb complex 提交 2025-02-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 F 147–406(260 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 21 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 OXY OXYGEN MOLECULE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å