当前蛋白身份：P01130
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AJJ LDL RECEPTOR LIGAND-BINDING MODULE 5, CALCIUM-COORDINATING 提交 1997-05-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
196–232（37 aa）
片段：LIGAND-BINDING DOMAIN, FIFTH REPEAT
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 2.1 M AMMONIUM SULFATE, PH 5.0, 25% SUCROSE
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.240 |
| 1D2J LDL RECEPTOR LIGAND-BINDING MODULE 6 提交 1999-09-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
233–272（40 aa）
片段：LIGAND-BINDING DOMAIN, SIXTH REPEAT
|
突变：M243L | CA CALCIUM ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 1
NMR测量条件
pH 5.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 1
NMR测量条件
pH 5.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 1
NMR测量条件
pH 5.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 1
NMR样品组成
1 MM LR6 U-15N; 10 MM CACL2
NMR样品组成
1 MM LR6 U-15N; 10 MM CACL2
NMR样品组成
1 MM LR6 UNLABELED; 10 MM CACL2
NMR样品组成
1 MM LR6 UNLABELED; 10 MM CACL2
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分辨率未提供 |
| 1F5Y NMR STRUCTURE OF A CONCATEMER OF THE FIRST AND SECOND LIGAND-BINDING MODULES OF THE HUMAN LDL RECEPTOR 提交 2000-06-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–104（83 aa）
片段：LIGAND-BINDING MODULES 1-2
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.045；压力 atmospheric
NMR样品组成
1 mM LB1-2, 15 mM CaCl2, pH 5.5 | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1 mM LB1-2, 15 mM CaCl2, pH 5.5 | 99% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1F8Z NMR STRUCTURE OF THE SIXTH LIGAND-BINDING MODULE OF THE LDL RECEPTOR 提交 2000-07-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
234–272（39 aa）
片段：SIXTH LIGAND-BINDING MODULE
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 1
NMR样品组成
3 mM LB6, 10 mM CaCl2, 1 mM 3,3,3-trimethylsilylpropionate | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
3 mM LB6, 10 mM CaCl2, 1 mM 3,3,3-trimethylsilylpropionate | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1HJ7 NMR study of a pair of LDL receptor Ca2+ binding epidermal growth factor-like domains, 20 structures 提交 2001-01-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
314–393（80 aa）
片段：CA2+ BINDING EPIDERMAL GROWTH FACTOR-LIKE DOMAIN PAIR, RESIDUES 293-372
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）SEE REFERENCES
NMR样品组成
SEE REFERENCES
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分辨率未提供 |
| 1HZ8 SOLUTION STRUCTURE AND BACKBONE DYNAMICS OF A CONCATEMER OF EGF-HOMOLOGY MODULES OF THE HUMAN LOW DENSITY LIPOPROTEIN RECEPTOR 提交 2001-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
314–395（82 aa）
片段：EGF-AB CONCATEMER (RESIDUES 314-395)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.060；压力 ambient
NMR测量条件
pH 5.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0.060；压力 ambient
NMR测量条件
pH 5.5；295 K；离子强度（mmCIF原始值）0.060；压力 ambient
NMR样品组成
1mM EGF-AB, 20mM CaCl2 | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1mM EGF-AB, 20mM CaCl2 | 99% D2O
NMR样品组成
1mM 15N-EGF-AB, 20mM CaCl2 | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1.5mM EGF-A, 20mM CaCl2 | 99% D2O
NMR样品组成
1.5mM EGF-A, 20mM CaCl2 | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1I0U SOLUTION STRUCTURE AND BACKBONE DYNAMICS OF A CONCATEMER OF EGF-HOMOLOGY MODULES OF THE HUMAN LOW DENSITY LIPOPROTEIN RECEPTOR 提交 2001-01-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
314–395（82 aa）
片段：EGF-AB CONCATEMER(RESIDUES 314-395)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.060；压力 ambient
NMR测量条件
pH 5.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0.060；压力 ambient
NMR测量条件
pH 5.5；295 K；离子强度（mmCIF原始值）0.060；压力 ambient
NMR样品组成
1mM EGF-AB, 20mM CaCl2 | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1mM EGF-AB, 20mM CaCl2 | 99% D2O
NMR样品组成
1mM 15N-EGF-AB, 20mM CaCl2 | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1.5mM EGF-A, 20mM CaCl2 | 99% D2O
NMR样品组成
1.5mM EGF-A, 20mM CaCl2 | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1IJQ Crystal Structure of the LDL Receptor YWTD-EGF Domain Pair 提交 2001-04-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
398–713（316 aa）
片段：YWTD-E3 DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG4000,2-propanol,HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.250 |
| 1IJQ Crystal Structure of the LDL Receptor YWTD-EGF Domain Pair 提交 2001-04-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
398–713（316 aa）
片段：YWTD-E3 DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG4000,2-propanol,HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.250 |
| 1LDL THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF A CYSTEINE-RICH REPEAT FROM THE LOW-DENSITY LIPOPROTEIN RECEPTOR 提交 1995-03-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
20–67（48 aa）
片段：LIGAND-BINDING DOMAIN, FIRST REPEAT
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1LDR SECOND REPEAT OF THE LDL RECEPTOR LIGAND-BINDING DOMAIN 提交 1995-08-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
55–104（50 aa）
片段：LIGAND-BINDING DOMAIN, SECOND REPEAT
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1N7D Extracellular domain of the LDL receptor 提交 2002-11-13 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–720（699 aa）
片段：extracellular domain, RESIDUES 1-699
|
突变：N494Q, N636Q | CA CALCIUM ION × 8 KEG 12-TUNGSTOPHOSPHATE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；298 K；acetate buffer pH 5.3, 1,2-hexanediol, 0.5 mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.382 |
| 1XFE Solution structure of the LA7-EGFA pair from the LDL receptor 提交 2004-09-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
272–353（82 aa）
片段：sequence database residues 272-353: includes LDL-receptor class A 7 (residues 274-313), EGF-like 1 (314-353)
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未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）1:6 molar protein/CaCl2；压力 ambient
NMR样品组成
0.3 mM LA7-EGFA U-15N,13C
2 mM CaCl2; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.5 mM LA7-EGFA U-15N
10 mM CaCl2; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mMM LA7-EGFA U-15N, 10% 13C
4 mM CaCl2; 99% D2O | 99% D2O
NMR样品组成
1 mM LA7-EGFA
6 mM CaCl2; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2FCW Structure of a Complex Between the Pair of the LDL Receptor Ligand-Binding Modules 3-4 and the Receptor Associated Protein (RAP). 提交 2005-12-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
107–186（80 aa）
片段：A Pair of Ligand-Binding Modules 3 and 4
|
未记录 | NA SODIUM ION × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；40% MPD, 100 mM HEPES, 75 mM NaCl, 1.25 mM CaCl2, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.200 |
| 2FCW Structure of a Complex Between the Pair of the LDL Receptor Ligand-Binding Modules 3-4 and the Receptor Associated Protein (RAP). 提交 2005-12-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
107–186（80 aa）
片段：A Pair of Ligand-Binding Modules 3 and 4
|
未记录 | NA SODIUM ION × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 10 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；40% MPD, 100 mM HEPES, 75 mM NaCl, 1.25 mM CaCl2, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.200 |
| 2KRI Structure of a complex between domain V of beta2-glycoprotein I and the fourth ligand-binding module from LDLR determined with Haddock 提交 2009-12-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
147–186（40 aa）
片段：LDL-receptor class A 4 domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_2-1, 100 uM [U-100% 15N] entity_2-2, 300 uM [U-100% 15N] entity_2-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
600 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-4, 300 uM [U-100% 15N] entity_1-5, 515 uM [U-100% 15N] entity_1-6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LGP Solution structure of LA45 from LDLR 提交 2011-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
144–235（92 aa）
片段：LDL-receptor class A 4 and A5 domain residues 144-235
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.45；306 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR样品组成
0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 5 mM CALCIUM ION, 0.02 % sodium azide, 20 mM [U-99% 2H] HEPES, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 5 mM CALCIUM ION, 0.02 % sodium azide, 150 mM sodium chloride, 20 mM [U-99% 2H] HEPES, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2M7P RXFP1 utilises hydrophobic moieties on a signalling surface of the LDLa module to mediate receptor activation 提交 2013-04-29 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
66–68（3 aa）
链 A
82–104（23 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.01；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] LDLA-1, 50 mM Immidazole-2, 10 mM CaCl2-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MG9 Truncated EGF-A 提交 2013-10-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
314–339（26 aa）
片段：EGF-A domain, UNP RESIDUES 314-339
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.3；283 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM egfa-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2W2M WT PCSK9-DELTAC BOUND TO WT EGF-A OF LDLR 提交 2008-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
314–393（80 aa）
片段：EGF-A DOMAIN, RESIDUES 314-393
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M HEPES PH 7.5, 10% (V/V) 2-PROPANOL, 20% (W/V) PEG 4000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.254 |
| 2W2N WT PCSK9-deltaC bound to EGF-A H306Y mutant of LDLR 提交 2008-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
314–393（80 aa）
片段：EGF-A DOMAIN, RESIDUES 314-393
|
突变：YES | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M HEPES PH 7.5, 10% (W/V) PEG 8000, 8% (V/V) ETHYLENE GLYCOL.
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.254 |
| 2W2O PCSK9-deltaC D374Y mutant bound to WT EGF-A of LDLR 提交 2008-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
314–393（80 aa）
片段：EGF-A DOMAIN, RESIDUES 314-393
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M HEPES PH 7.5, 10% (W/V) PEG 8000 AND 8% (V/V) ETHYLENE GLYCOL
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.263 |
| 2W2P PCSK9-deltaC D374A mutant bound to WT EGF-A of LDLR 提交 2008-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
314–393（80 aa）
片段：EGF-A DOMAIN, RESIDUES 314-393
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M HEPES PH 7.5, 10% (W/V) PEG 8000 AND 8% (V/V) ETHYLENE GLYCOL
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.270 |
| 2W2Q PCSK9-deltaC D374H mutant bound to WT EGF-A of LDLR 提交 2008-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
314–393（80 aa）
片段：EGF-A DOMAIN, RESIDUES 314-393
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M HEPES PH 7.5, 10% (W/V) PEG 8000 AND 8% (V/V) ETHYLENE GLYCOL
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.253 |
| 3BPS PCSK9:EGF-A complex 提交 2007-12-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
314–393（80 aa）
片段：EGF-like 1, EGF-like 2 domains, UNP residues 314-393
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.8；294 K；0.3M (NH4)H2PO4, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K, pH 4.80
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.240 |
| 3GCW PCSK9:EGFA(H306Y) 提交 2009-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
314–393（80 aa）
|
突变：H306Y | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；294 K；0.3M (NH4)H2PO4, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.278 |
| 3GCX PCSK9:EGFA (pH 7.4) 提交 2009-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
314–393（80 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；294 K；0.3M (NH4)H2PO4, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.261 |
| 3M0C The X-ray Crystal Structure of PCSK9 in Complex with the LDL receptor 提交 2010-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
4–788（785 aa）
片段：LDLR
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；297 K；1.4 M Ammonium phosphate, 0.2M sodium chloride in 0.1M Imidazole buffer, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
|
分辨率 7.01 Å R-free 0.362 |
| 3SO6 Crystal structure of the LDL receptor tail in complex with autosomal recessive hypercholesterolemia PTB domain 提交 2011-06-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Q
819–832（14 aa）
片段：UNP residues 817-832
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1 M HEPES, 30% PEG6000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.206 |
| 4NE9 PCSK9 in complex with LDLR peptide 提交 2013-10-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
314–339（26 aa）
片段：UNP residues 314-339
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；299 K；pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 299K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.211 |
| 5OY9 VSV G CR3 提交 2017-09-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
108–144（37 aa）
片段：UNP residues 108-144
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；30% PEG 400, 50 mM Tris-HCl pH 8.5, 200 mM CaCl2, 0.2% dodecylmaltoside
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.268 |
| 5OYL VSV G CR2 提交 2017-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
65–106（42 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；29% PEG 3000, 100 mM Tris-HCl pH 8.5, 200 mM LiSO4
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分辨率 2.25 Å R-free 0.224 |
| 9BD8 ApoB 100 beta barrel bound to LDLR beta propeller 提交 2024-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–860（860 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.80 Å |
| 9BDE Middle Region of Apolipoprotein B 100 bound to Low Density Lipoprotein Receptor 提交 2024-04-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
1–860（860 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CA CALCIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.18 Å |
| 9BDT Apolipoprotein B 100 bound to LDL receptor and legobody 提交 2024-04-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 I
1–860（860 aa）
链 R
1–860（860 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 5.40 Å |
| 9COO Nanobody 4 bound to Apolipoprotein B 100 提交 2024-07-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
66–860（795 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.73 Å |