当前蛋白身份:P01133 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1IVO Crystal Structure of the Complex of Human Epidermal Growth Factor and Receptor Extracellular Domains. 提交 2002-03-28 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 971–1023(53 aa) 片段:RESIDUES 1-53
链 D 971–1023(53 aa) 片段:RESIDUES 1-53
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.4;293 K;PEG4000, PEG6000, sodium acetate, sodium chloride, TRIS, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.326
1JL9 Crystal Structure of Human Epidermal Growth Factor 提交 2001-07-16 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 971–1021(51 aa) 片段:RESIDUES 1-51
链 B 971–1021(51 aa) 片段:RESIDUES 1-51
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.1;293 K;magnesium chloride, Bicine, CYMAL-3, sodium azide, pH 8.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.283
1NQL Structure of the extracellular domain of human epidermal growth factor (EGF) receptor in an inactive (low pH) complex with EGF. 提交 2003-01-21 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 971–1023(53 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;297 K;PEG3400,ammonium sulfate, magnesium sulfate, sodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
分辨率 2.80 Å R-free 0.310
1P9J Solution structure and dynamics of the EGF/TGF-alpha chimera T1E 提交 2003-05-12 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 976–1022(47 aa) 片段:TGF-alpha (residues 1-7), EGF (residues 8-54)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR样品组成 0.8mM T1E, 15N-labelled, 50mM phosphate buffer, 95% H20, 5%D20, pH 6.3, 20ug/mL pefabloc | 95% H20, 5%D20, pH 6.3
分辨率未提供
7OM4 Nanobody EgB4 bound to the full extracellular EGFR-EGF complex 提交 2021-05-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 971–1023(53 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M LiSO4, 0.1 M glycine pH 10.5, 1.1 M sodium dihydrogen phosphate and 0.72 M dipotassium hydrogen phosphate
分辨率 6.05 Å R-free 0.327
7SYD Cryo-EM structure of the extracellular module of the full-length EGFR bound to EGF "tips-juxtaposed" conformation 提交 2021-11-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 971–1023(53 aa)
链 D 971–1023(53 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7SYE Cryo-EM structure of the extracellular module of the full-length EGFR bound to EGF. "tips-separated" conformation 提交 2021-11-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 971–1023(53 aa)
链 D 971–1023(53 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7SZ0 Cryo-EM structure of the extracellular module of the full-length EGFR L834R bound to EGF. "tips-juxtaposed" conformation 提交 2021-11-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 971–1023(53 aa)
链 D 971–1023(53 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7SZ1 Cryo-EM structure of the extracellular module of the full-length EGFR L834R bound to EGF. "tips-separated" conformation 提交 2021-11-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 971–1023(53 aa)
链 D 971–1023(53 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8HGO The EGF-bound EGFR/HER2 ectodomain complex 提交 2022-11-15 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 971–1023(53 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;25mM Hepes, 150mM NaCl, 0.02%DDM-0.002%CHS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
8HGS The EGF-bound EGFR ectodomain homodimer 提交 2022-11-15 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 971–1023(53 aa)
链 D 971–1023(53 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.81 Å