当前蛋白身份：P01732
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AKJ COMPLEX OF THE HUMAN MHC CLASS I GLYCOPROTEIN HLA-A2 AND THE T CELL CORECEPTOR CD8 提交 1997-05-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
22–141（120 aa）
片段：EXTRACELLULAR IGSF DOMAIN, RESIDUES 1 - 120, ALPHA CHAIN
链 E
22–141（120 aa）
片段：EXTRACELLULAR IGSF DOMAIN, RESIDUES 1 - 120, ALPHA CHAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 12% PEG 20000, 100 MM MES, PH 6.5
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分辨率 2.65 Å R-free 0.276 |
| 1CD8 CRYSTAL STRUCTURE OF A SOLUBLE FORM OF THE HUMAN T CELL CO-RECEPTOR CD8 AT 2.6 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-01-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
22–135（114 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å |
| 1Q69 Solution structure of T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain and Proto-oncogene tyrosine-protein kinase LCK fragments 提交 2003-08-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
209–227（19 aa）
片段：Human CD8 alpha
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.1；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM CD8a-Lck-Zn2+, U-15N,13C; 20 mM acetate, 20 mM NaCl, 0.15% beta-mercaptoethanol | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5 mM CD8a-Lck-Zn2+, U-15N; 20 mM acetate, 20 mM NaCl, 0.15% beta-mercaptoethanol | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5 mM CD8a-Lck-Zn2+; 20 mM acetate, 20 mM NaCl, 0.15% beta-mercaptoethanol | 100% D2O
NMR样品组成
1.0 mM CD8a-Lck-Cd2+; 20 mM acetate, 20 mM NaCl, 0.15% beta-mercaptoethanol | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 2HP4 Computational design and crystal structure of an enhanced affinity mutant human CD8-alpha-alpha co-receptor 提交 2006-07-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
22–135（114 aa）
片段：HLA Co-receptor, Ig-like V-type
链 B
22–135（114 aa）
片段：HLA Co-receptor, Ig-like V-type
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突变：C33A/S53N 突变：C33A/S53N | SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；25.5% PEG 8000, 0.085M Sodium Cacodylate, 0.17M Ammonium Sulphate, 15% Glycerol, 3% Ethylene Glycol, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.233 |
| 2HP4 Computational design and crystal structure of an enhanced affinity mutant human CD8-alpha-alpha co-receptor 提交 2006-07-17 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
22–135（114 aa）
片段：HLA Co-receptor, Ig-like V-type
链 B
22–135（114 aa）
片段：HLA Co-receptor, Ig-like V-type
|
突变：C33A/S53N 突变：C33A/S53N | SO4 SULFATE ION × 10 GOL GLYCEROL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；25.5% PEG 8000, 0.085M Sodium Cacodylate, 0.17M Ammonium Sulphate, 15% Glycerol, 3% Ethylene Glycol, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.233 |
| 3QZW Plasticity of human CD8 binding to peptide-HLA-A*2402 提交 2011-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 G
22–135（114 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 22-135)
链 H
22–135（114 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 22-135)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；0.1M MES monohydrate, pH 6.5, 12% w/v PEG 20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.260 |
| 3QZW Plasticity of human CD8 binding to peptide-HLA-A*2402 提交 2011-03-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
22–135（114 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 22-135)
链 J
22–135（114 aa）
片段：ectodomain (UNP residues 22-135)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；0.1M MES monohydrate, pH 6.5, 12% w/v PEG 20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.260 |
| 7UMG Crystal structure of human CD8aa-MR1-Ac-6-FP complex 提交 2022-04-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
22–141（120 aa）
链 D
22–141（120 aa）
|
未记录 | 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；298 K；Na K Phosphate, PEG 1K and NaCl
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分辨率 2.40 Å R-free 0.218 |
| 7UVF Crystal structure of ZED8 Fab complex with CD8 alpha 提交 2022-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
22–141（120 aa）
链 B
22–141（120 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；292 K；0.1M ammonium acetate
0.1M Bis-Tris pH6.0
17% PEG 10K
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分辨率 2.60 Å R-free 0.259 |
| 8EW6 Anti-human CD8 VHH complex with CD8 alpha 提交 2022-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 W
22–141（120 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；291 K；15% PEG 3350 and 0.1M succinic acid pH 7.0
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分辨率 1.90 Å R-free 0.245 |