当前蛋白身份：P01801
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1SM3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE TUMOR SPECIFIC ANTIBODY SM3 COMPLEX WITH ITS PEPTIDE EPITOPE 提交 1997-12-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
2–220（219 aa）
片段：FAB FRAGMENT
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未记录 | CD CADMIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6.0
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分辨率 1.95 Å R-free 0.283 |
| 2DLF HIGH RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF THE FV FRAGMENT FROM AN ANTI-DANSYL SWITCH VARIANT ANTIBODY IGG2A(S) CRYSTALLIZED AT PH 6.75 提交 1998-12-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1–115（115 aa）
片段：FV FRAGMENT (VH DOMAIN) SYNONYM: ANTI-DANSYL FV FRAGMENT
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.75；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: TEMPERATURE AT 20C. PRECIPITANT SOLUTION CONTAINED
1 AMMONIUM SULFATE AND 0.025 M SODIUM CACODYLATE (PH 6.75). 5 MG/ML OF FV
FRAGMENT., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 1.55 Å R-free 0.233 |
| 5A2I Crystal structure of scFv-SM3 in complex with APD-SGalNAc-RP 提交 2015-05-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
6–115（110 aa）
片段：RESIDUES 6-115,20-129
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.88 Å R-free 0.261 |
| 5A2J Crystal structure of scFv-SM3 in complex with the naked peptide APDTRP 提交 2015-05-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
6–115（110 aa）
片段：RESIDUES 6-115,20-129
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.65 Å R-free 0.197 |
| 5A2K Crystal structure of scFv-SM3 in complex with APD-TGalNAc-RP 提交 2015-05-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
6–115（110 aa）
片段：RESIDUES 6-115,20-129
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å R-free 0.216 |
| 5A2L Crystal structure of scFv-SM3 in complex with APD-CGalNAc-RP 提交 2015-05-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
6–115（110 aa）
片段：RESIDUES 6-115,20-129
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.79 Å R-free 0.204 |
| 5N7B Understanding the singular conformational landscape of the Tn antigens: Sulfur-for- oxygen substitution in the glycosidic linkage provides new insights into molecular recognition by an antibody 提交 2017-02-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1–114（114 aa）
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M disodium hydrogen phosphate
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分辨率 1.70 Å R-free 0.211 |
| 5OWP Crystal structure of glycopeptide "GVTSAfPDT*RPAP" in complex with scFv-SM3 提交 2017-09-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
6–111（106 aa）
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PEG 3350, disodium hydrogen phosphate
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分辨率 1.85 Å R-free 0.256 |