当前蛋白身份：P02259
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1HST CRYSTAL STRUCTURE OF GLOBULAR DOMAIN OF HISTONE H5 AND ITS IMPLICATIONS FOR NUCLEOSOME BINDING 提交 1993-03-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
19–108（90 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å |
| 1HST CRYSTAL STRUCTURE OF GLOBULAR DOMAIN OF HISTONE H5 AND ITS IMPLICATIONS FOR NUCLEOSOME BINDING 提交 1993-03-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
19–108（90 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å |
| 4QLC Crystal structure of chromatosome at 3.5 angstrom resolution 提交 2014-06-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 U
23–99（77 aa）
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未记录 | CIT CITRIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.75；291 K；0.1 mM Citric acid, 0.1mM potassium chloride, and 10% MPD, pH 3.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.243 |
| 5WCU Crystal structure of 167 bp nucleosome bound to the globular domain of linker histone H5 提交 2017-07-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 U
23–98（76 aa）
片段：UNP residues 23-98
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；291 K；0.1 M NH4NO3, 10% MPD (v/v)
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分辨率 5.53 Å R-free 0.238 |
| 5WCU Crystal structure of 167 bp nucleosome bound to the globular domain of linker histone H5 提交 2017-07-02 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 V
23–98（76 aa）
片段：UNP residues 23-98
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；291 K；0.1 M NH4NO3, 10% MPD (v/v)
|
分辨率 5.53 Å R-free 0.238 |
| 7C0J Crystal structure of chimeric mutant of GH5 in complex with Z-DNA 提交 2020-05-01 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
25–64（40 aa）
链 A
76–88（13 aa）
链 A
92–93（2 aa）
链 A
95–98（4 aa）
链 B
25–64（40 aa）
链 B
76–88（13 aa）
链 B
92–93（2 aa）
链 B
95–98（4 aa）
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突变：K41G,S42E,R43G,K53A,R95A 突变：K41G,S42E,R43G,K53A,R95A 突变：K41G,S42E,R43G,K53A,R95A 突变：K41G,S42E,R43G,K53A,R95A 突变：K41G,S42E,R43G,K53A,R95A 突变：K41G,S42E,R43G,K53A,R95A 突变：K41G,S42E,R43G,K53A,R95A 突变：K41G,S42E,R43G,K53A,R95A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；MES pH 6.0, PEG 4000, ethylene glycol
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分辨率 2.75 Å R-free 0.248 |
| 7XVM Crystal Structure of Nucleosome-H5 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 U
2–190（189 aa）
链 V
2–190（189 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 18 CL CHLORIDE ION × 3 K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
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分辨率 2.84 Å R-free 0.259 |
| 8XJV Structural basis for the linker histone H5-nucleosome binding and chromatin compaction 提交 2023-12-22 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 108 PDB 声明：110-meric（110） 与全部聚合物一致 |
链 Ah
1–190（190 aa）
链 Ai
1–190（190 aa）
链 Aj
1–190（190 aa）
链 Ak
1–190（190 aa）
链 Al
1–190（190 aa）
链 Am
1–190（190 aa）
链 An
1–190（190 aa）
链 Ao
1–190（190 aa）
链 Ap
1–190（190 aa）
链 Aq
1–190（190 aa）
链 Ar
1–190（190 aa）
链 As
1–190（190 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
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分辨率 3.60 Å |