当前蛋白身份:P02417
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CQU SOLUTION STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF RIBOSOMAL PROTEIN L9 提交 1999-08-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–56(56 aa)
片段:N-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5;298 K;压力 AMBIENT
|
分辨率未提供 |
| 1DIV RIBOSOMAL PROTEIN L9 提交 1996-07-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–149(149 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å R-free 0.276 |
| 2HBA Crystal Structure of N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9) K12M 提交 2006-06-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–52(52 aa)
片段:N-terminal domain
|
突变:K12M | ZN ZINC ION × 3 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 200 mM Zn Acetate, 2.5 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.164 |
| 2HBA Crystal Structure of N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9) K12M 提交 2006-06-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–52(52 aa)
片段:N-terminal domain
|
突变:K12M | ZN ZINC ION × 5 CL CHLORIDE ION × 6 IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 200 mM Zn Acetate, 2.5 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.164 |
| 2HBA Crystal Structure of N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9) K12M 提交 2006-06-14 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–52(52 aa)
片段:N-terminal domain
链 B
1–52(52 aa)
片段:N-terminal domain
|
突变:K12M 突变:K12M | ZN ZINC ION × 16 CL CHLORIDE ION × 20 IMD IMIDAZOLE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 200 mM Zn Acetate, 2.5 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.164 |
| 2HBA Crystal Structure of N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9) K12M 提交 2006-06-14 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–52(52 aa)
片段:N-terminal domain
链 B
1–52(52 aa)
片段:N-terminal domain
|
突变:K12M 突变:K12M | ZN ZINC ION × 16 CL CHLORIDE ION × 20 IMD IMIDAZOLE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 200 mM Zn Acetate, 2.5 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.164 |
| 2HBB Crystal Structure of the N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9) 提交 2006-06-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–51(51 aa)
片段:N-terminal domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 200 mM Zn Acetate, 2.5 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.236 |
| 2HBB Crystal Structure of the N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9) 提交 2006-06-14 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–51(51 aa)
片段:N-terminal domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 200 mM Zn Acetate, 2.5 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.236 |
| 2HBB Crystal Structure of the N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9) 提交 2006-06-14 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–51(51 aa)
片段:N-terminal domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 200 mM Zn Acetate, 2.5 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.236 |
| 2HVF Crystal Structure of N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9), G34dA 提交 2006-07-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–52(52 aa)
片段:N-terminal domain
|
突变:G34(DAL) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 4 IMD IMIDAZOLE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 300 mM Zn Acetate, 3 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.208 |
| 2HVF Crystal Structure of N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9), G34dA 提交 2006-07-28 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–52(52 aa)
片段:N-terminal domain
|
突变:G34(DAL) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ZN ZINC ION × 8 CL CHLORIDE ION × 8 IMD IMIDAZOLE × 2 ACY ACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 300 mM Zn Acetate, 3 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.208 |
| 487D SEVEN RIBOSOMAL PROTEINS FITTED TO A CRYO-ELECTRON MICROSCOPIC MAP OF THE LARGE 50S SUBUNIT AT 7.5 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 2000-02-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致 |
链 K
1–149(149 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 7.50 Å |
| 4V42 Crystal structure of the ribosome at 5.5 A resolution. 提交 2001-03-30 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 42 PDB 声明:49-meric(49) 与全部聚合物一致 |
链 BK
1–149(149 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 5.50 Å |