当前蛋白身份:P02417 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1CQU SOLUTION STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF RIBOSOMAL PROTEIN L9 提交 1999-08-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–56(56 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5;298 K;压力 AMBIENT
分辨率未提供
1DIV RIBOSOMAL PROTEIN L9 提交 1996-07-02 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–149(149 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2HBA Crystal Structure of N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9) K12M 提交 2006-06-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–52(52 aa) 片段:N-terminal domain
突变:K12M ZN ZINC ION × 3 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 200 mM Zn Acetate, 2.5 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.25 Å R-free 0.164
2HBA Crystal Structure of N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9) K12M 提交 2006-06-14 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–52(52 aa) 片段:N-terminal domain
突变:K12M ZN ZINC ION × 5 CL CHLORIDE ION × 6 IMD IMIDAZOLE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 200 mM Zn Acetate, 2.5 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.25 Å R-free 0.164
2HBA Crystal Structure of N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9) K12M 提交 2006-06-14 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–52(52 aa) 片段:N-terminal domain
链 B 1–52(52 aa) 片段:N-terminal domain
突变:K12M 突变:K12M ZN ZINC ION × 16 CL CHLORIDE ION × 20 IMD IMIDAZOLE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 200 mM Zn Acetate, 2.5 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.25 Å R-free 0.164
2HBA Crystal Structure of N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9) K12M 提交 2006-06-14 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–52(52 aa) 片段:N-terminal domain
链 B 1–52(52 aa) 片段:N-terminal domain
突变:K12M 突变:K12M ZN ZINC ION × 16 CL CHLORIDE ION × 20 IMD IMIDAZOLE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 200 mM Zn Acetate, 2.5 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.25 Å R-free 0.164
2HBB Crystal Structure of the N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9) 提交 2006-06-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–51(51 aa) 片段:N-terminal domain
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 200 mM Zn Acetate, 2.5 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.90 Å R-free 0.236
2HBB Crystal Structure of the N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9) 提交 2006-06-14 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–51(51 aa) 片段:N-terminal domain
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 200 mM Zn Acetate, 2.5 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.90 Å R-free 0.236
2HBB Crystal Structure of the N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9) 提交 2006-06-14 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–51(51 aa) 片段:N-terminal domain
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 200 mM Zn Acetate, 2.5 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.90 Å R-free 0.236
2HVF Crystal Structure of N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9), G34dA 提交 2006-07-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–52(52 aa) 片段:N-terminal domain
突变:G34(DAL) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 4 IMD IMIDAZOLE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 300 mM Zn Acetate, 3 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.57 Å R-free 0.208
2HVF Crystal Structure of N-terminal Domain of Ribosomal Protein L9 (NTL9), G34dA 提交 2006-07-28 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–52(52 aa) 片段:N-terminal domain
突变:G34(DAL) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ZN ZINC ION × 8 CL CHLORIDE ION × 8 IMD IMIDAZOLE × 2 ACY ACETIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;10 mM Imidazole (pH 8.0), 300 mM Zn Acetate, 3 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.57 Å R-free 0.208
487D SEVEN RIBOSOMAL PROTEINS FITTED TO A CRYO-ELECTRON MICROSCOPIC MAP OF THE LARGE 50S SUBUNIT AT 7.5 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 2000-02-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 K 1–149(149 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 7.50 Å
4V42 Crystal structure of the ribosome at 5.5 A resolution. 提交 2001-03-30 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 42 PDB 声明:49-meric(49) 与全部聚合物一致
链 BK 1–149(149 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 5.50 Å