当前蛋白身份:P02461
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2V53 Crystal structure of a SPARC-collagen complex 提交 2008-10-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
564–584(21 aa)
片段:RESIDUES 564-584
链 C
564–584(21 aa)
片段:RESIDUES 564-584
链 D
564–584(21 aa)
片段:RESIDUES 564-584
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5;pH 5.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.320 |
| 3DMW Crystal structure of human type III collagen G982-G1023 containing C-terminal cystine knot 提交 2008-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1158–1199(42 aa)
片段:UNP residues 1158-1199
链 B
1158–1199(42 aa)
片段:UNP residues 1158-1199
链 C
1158–1199(42 aa)
片段:UNP residues 1158-1199
|
突变:Q1183M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:Q1183M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:Q1183M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;30% PEG 550, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.274 |
| 4AE2 Crystal structure of Human fibrillar procollagen type III C- propeptide trimer 提交 2012-01-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1222–1466(245 aa)
片段:CPROPEPTIDE OF PROCOLLAGEN III, RESIDUES 1222-1466
链 B
1222–1466(245 aa)
片段:CPROPEPTIDE OF PROCOLLAGEN III, RESIDUES 1222-1466
链 C
1222–1466(245 aa)
片段:CPROPEPTIDE OF PROCOLLAGEN III, RESIDUES 1222-1466
|
突变:YES 突变:YES 突变:YES | CA CALCIUM ION × 3 NO3 NITRATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5;20% PEG 3350, 0.1 M BIS TRIS PROPANE PH 6.5, POTASSIUM NITRATE 0.2 M
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.214 |
| 4AEJ Crystal structure of Human fibrillar procollagen type III C- propeptide trimer 提交 2012-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1222–1466(245 aa)
片段:CPROPEPTIDE OF PROCOLLAGEN III, RESIDUES 1222-1466
链 B
1222–1466(245 aa)
片段:CPROPEPTIDE OF PROCOLLAGEN III, RESIDUES 1222-1466
链 C
1222–1466(245 aa)
片段:CPROPEPTIDE OF PROCOLLAGEN III, RESIDUES 1222-1466
|
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 3 GOL GLYCEROL × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
20% PEG 3350, 0.2 M NACL
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.237 |
| 4AK3 Crystal structure of Human fibrillar procollagen type III C- propeptide trimer 提交 2012-02-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1222–1466(245 aa)
片段:CPROPEPTIDE, RESIDUES 1222-1466
|
突变:YES | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.50 Å R-free 0.337 |
| 6FZV Crystal structure of the metalloproteinase enhancer PCPE-1 bound to the procollagen C propeptide trimer (short) 提交 2018-03-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1222–1466(245 aa)
链 B
1222–1466(245 aa)
链 C
1222–1466(245 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 FLC CITRATE ANION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;20 mg/ml protein in 20 mM HEPES pH 7.5, 180 mM NaCl, 2.5 mM calcium chloride; 0.2 M potassium citrate, 16% PEG3350
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.258 |
| 6FZW Crystal structure of the metalloproteinase enhancer PCPE-1 bound to the procollagen C propeptide trimer (long) 提交 2018-03-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1185–1466(282 aa)
链 B
1185–1466(282 aa)
链 C
1185–1466(282 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 FLC CITRATE ANION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;20 mg/ml protein in 20 mM HEPES pH 7.5, 180 mM NaCl, 2.5 mM calcium chloride; 0.2 M ammonium citrate, 18% PEG3350
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.271 |
| 7WWR Structure of a triple-helix region of human collagen type III from Trautec 提交 2022-02-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
973–1002(30 aa)
链 B
973–1002(30 aa)
链 C
973–1002(30 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M MIB pH5.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.194 |
| 7WWS Structure of a triple-helix region of human collagen type III from Trautec 提交 2022-02-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
976–1002(27 aa)
链 B
976–1002(27 aa)
链 C
976–1002(27 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2M MgAc2, 0.1M Na cacodylate pH6.5, 20% PEG 8000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.158 |
| 7XAN Structure of a triple-helix region of human collagen type III from Trautec 提交 2022-03-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
922–948(27 aa)
链 B
922–948(27 aa)
链 C
922–948(27 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.04M K phosphate monobasic, 16% w/v PEG 8000, 20% v/v Glycerol
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.200 |