当前蛋白身份:P02461 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2V53 Crystal structure of a SPARC-collagen complex 提交 2008-10-01 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 564–584(21 aa) 片段:RESIDUES 564-584
链 C 564–584(21 aa) 片段:RESIDUES 564-584
链 D 564–584(21 aa) 片段:RESIDUES 564-584
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5;pH 5.5
分辨率 3.20 Å R-free 0.320
3DMW Crystal structure of human type III collagen G982-G1023 containing C-terminal cystine knot 提交 2008-07-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1158–1199(42 aa) 片段:UNP residues 1158-1199
链 B 1158–1199(42 aa) 片段:UNP residues 1158-1199
链 C 1158–1199(42 aa) 片段:UNP residues 1158-1199
突变:Q1183M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:Q1183M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:Q1183M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;30% PEG 550, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.274
4AE2 Crystal structure of Human fibrillar procollagen type III C- propeptide trimer 提交 2012-01-05 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1222–1466(245 aa) 片段:CPROPEPTIDE OF PROCOLLAGEN III, RESIDUES 1222-1466
链 B 1222–1466(245 aa) 片段:CPROPEPTIDE OF PROCOLLAGEN III, RESIDUES 1222-1466
链 C 1222–1466(245 aa) 片段:CPROPEPTIDE OF PROCOLLAGEN III, RESIDUES 1222-1466
突变:YES 突变:YES 突变:YES CA CALCIUM ION × 3 NO3 NITRATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;20% PEG 3350, 0.1 M BIS TRIS PROPANE PH 6.5, POTASSIUM NITRATE 0.2 M
分辨率 1.68 Å R-free 0.214
4AEJ Crystal structure of Human fibrillar procollagen type III C- propeptide trimer 提交 2012-01-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1222–1466(245 aa) 片段:CPROPEPTIDE OF PROCOLLAGEN III, RESIDUES 1222-1466
链 B 1222–1466(245 aa) 片段:CPROPEPTIDE OF PROCOLLAGEN III, RESIDUES 1222-1466
链 C 1222–1466(245 aa) 片段:CPROPEPTIDE OF PROCOLLAGEN III, RESIDUES 1222-1466
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CA CALCIUM ION × 3 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 20% PEG 3350, 0.2 M NACL
分辨率 2.21 Å R-free 0.237
4AK3 Crystal structure of Human fibrillar procollagen type III C- propeptide trimer 提交 2012-02-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1222–1466(245 aa) 片段:CPROPEPTIDE, RESIDUES 1222-1466
突变:YES CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.50 Å R-free 0.337
6FZV Crystal structure of the metalloproteinase enhancer PCPE-1 bound to the procollagen C propeptide trimer (short) 提交 2018-03-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1222–1466(245 aa)
链 B 1222–1466(245 aa)
链 C 1222–1466(245 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 5 FLC CITRATE ANION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;20 mg/ml protein in 20 mM HEPES pH 7.5, 180 mM NaCl, 2.5 mM calcium chloride; 0.2 M potassium citrate, 16% PEG3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6FZW Crystal structure of the metalloproteinase enhancer PCPE-1 bound to the procollagen C propeptide trimer (long) 提交 2018-03-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1185–1466(282 aa)
链 B 1185–1466(282 aa)
链 C 1185–1466(282 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 5 FLC CITRATE ANION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;20 mg/ml protein in 20 mM HEPES pH 7.5, 180 mM NaCl, 2.5 mM calcium chloride; 0.2 M ammonium citrate, 18% PEG3350
分辨率 2.78 Å R-free 0.271
7WWR Structure of a triple-helix region of human collagen type III from Trautec 提交 2022-02-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 973–1002(30 aa)
链 B 973–1002(30 aa)
链 C 973–1002(30 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M MIB pH5.0, 25% PEG 1500
分辨率 1.30 Å R-free 0.194
7WWS Structure of a triple-helix region of human collagen type III from Trautec 提交 2022-02-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 976–1002(27 aa)
链 B 976–1002(27 aa)
链 C 976–1002(27 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2M MgAc2, 0.1M Na cacodylate pH6.5, 20% PEG 8000
分辨率 1.30 Å R-free 0.158
7XAN Structure of a triple-helix region of human collagen type III from Trautec 提交 2022-03-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 922–948(27 aa)
链 B 922–948(27 aa)
链 C 922–948(27 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.04M K phosphate monobasic, 16% w/v PEG 8000, 20% v/v Glycerol
分辨率 1.50 Å R-free 0.200