当前蛋白身份：P02746
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1PK6 Globular Head of the Complement System Protein C1q 提交 2003-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
117–248（132 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 4000, CaCl2, B-mercaptoethanol, agarose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.239 |
| 2JG8 Crystallographic structure of human C1q globular heads complexed to phosphatidyl-serine 提交 2007-02-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
118–253（136 aa）
片段：C TERMINAL GLOBULAR DOMAIN, RESIDUES 116-251
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.05 Å R-free 0.241 |
| 2JG8 Crystallographic structure of human C1q globular heads complexed to phosphatidyl-serine 提交 2007-02-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
118–253（136 aa）
片段：C TERMINAL GLOBULAR DOMAIN, RESIDUES 116-251
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 SEP PHOSPHOSERINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.05 Å R-free 0.241 |
| 2JG9 Crystallographic structure of human C1q globular heads (P1) 提交 2007-02-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
118–253（136 aa）
片段：C TERMINAL GLOBULAR DOMAIN, RESIDUES 116-251
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å R-free 0.260 |
| 2JG9 Crystallographic structure of human C1q globular heads (P1) 提交 2007-02-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
118–253（136 aa）
片段：C TERMINAL GLOBULAR DOMAIN, RESIDUES 116-251
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å R-free 0.260 |
| 2WNU Complex between c1q globular heads and heparan sulfate 提交 2009-07-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
116–251（136 aa）
片段：C TERMINAL GLOBULAR DOMAIN, RESIDUES 116-251
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å R-free 0.256 |
| 2WNU Complex between c1q globular heads and heparan sulfate 提交 2009-07-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
116–251（136 aa）
片段：C TERMINAL GLOBULAR DOMAIN, RESIDUES 116-251
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å R-free 0.256 |
| 2WNV Complex between C1q globular heads and deoxyribose 提交 2009-07-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
116–251（136 aa）
片段：C TERMINAL GLOBULAR DOMAIN, RESIDUES 116-251
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 2DR 2-deoxy-beta-D-erythro-pentofuranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.25 Å R-free 0.202 |
| 2WNV Complex between C1q globular heads and deoxyribose 提交 2009-07-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
116–251（136 aa）
片段：C TERMINAL GLOBULAR DOMAIN, RESIDUES 116-251
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.25 Å R-free 0.202 |
| 5HKJ Single Chain Recombinant Globular Head of the Complement System Protein C1q 提交 2016-01-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
117–253（137 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；23% PEG 3350, 0.1 M Tris, 0.2 M NaCl, 50 mM CaCl2
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.200 |
| 5HZF Single Chain Recombinant Globular Head of the Complement System Protein C1q in complex with magnesium 提交 2016-02-02 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
117–253（137 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；30% PEG 8000, 0.1M HEPES, pH 7.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.186 |
| 6FCZ Model of gC1q-Fc complex based on 7A EM map 提交 2017-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
119–250（132 aa）
片段：UNP Residues 119-250
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.00 Å |
| 6Z6V Globular head of C1q in complex with the nanobody C1qNb75 提交 2020-05-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
119–253（135 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；292 K；0.1 M BIS-Tris pH 5.5, 25 % w/v PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.227 |
| 6Z6V Globular head of C1q in complex with the nanobody C1qNb75 提交 2020-05-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
119–253（135 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；292 K；0.1 M BIS-Tris pH 5.5, 25 % w/v PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.227 |
| 9C9L Cryo-EM structure of the C1q A, B-crt, C peptide assembly narrow region 提交 2024-06-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
34–46（13 aa）
链 D
34–46（13 aa）
链 E
34–46（13 aa）
链 F
34–46（13 aa）
链 G
34–46（13 aa）
链 H
34–46（13 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM PBS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9C9U Cryo-EM structure of the C1q A, B-crt, C peptide full assembly 提交 2024-06-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：18-meric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
28–71（44 aa）
链 D
28–71（44 aa）
链 E
28–71（44 aa）
链 F
28–71（44 aa）
链 G
28–71（44 aa）
链 H
28–71（44 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |