当前蛋白身份:P02974
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AY2 STRUCTURE OF THE FIBER-FORMING PROTEIN PILIN AT 2.6 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1997-11-13 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
8–165(158 aa)
|
未记录 | PT PLATINUM (II) ION × 2 HTO HEPTANE-1,2,3-TRIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 60% PEG400, 50 MM CHESS, PH 8.0, 1% BETA-OCTYL GLUCOSIDE, 0.6% 1,2,3-HEPTANETRIOL.
|
分辨率 2.60 Å |
| 2HI2 Crystal structure of native Neisseria gonorrhoeae Type IV pilin at 2.3 Angstroms Resolution 提交 2006-06-28 | Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
8–165(158 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | HTO HEPTANE-1,2,3-TRIOL × 1 OPE PHOSPHORIC ACID MONO-(2-AMINO-ETHYL) ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8;298 K;22% PEG 400 5% HEPTANE TRIOL 50 mM CHES, PH 8.0, VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 298K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.282 |
| 2HIL Structure of the Neisseria gonorrhoeae Type IV pilus filament from x-ray crystallography and electron cryomicroscopy 提交 2006-06-29 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致 |
链 A
8–165(158 aa)
链 B
8–165(158 aa)
链 C
8–165(158 aa)
链 D
8–165(158 aa)
链 E
8–165(158 aa)
链 F
8–165(158 aa)
链 G
8–165(158 aa)
链 H
8–165(158 aa)
链 I
8–165(158 aa)
链 J
8–165(158 aa)
链 K
8–165(158 aa)
链 L
8–165(158 aa)
链 M
8–165(158 aa)
链 N
8–165(158 aa)
链 O
8–165(158 aa)
链 P
8–165(158 aa)
链 Q
8–165(158 aa)
链 R
8–165(158 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | OPE PHOSPHORIC ACID MONO-(2-AMINO-ETHYL) ESTER × 18 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
50 mM CHES;pH 9.5;50 mM CHES
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;5 ul of sample were applied to grids for 1 minute, blotted for 2.5 seconds then plunge-frozen in liquid ethane using an FEI Vitrobot
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分辨率 12.50 Å |
| 2PIL Crystallographic Structure of Phosphorylated Pilin from Neisseria: Phosphoserine Sites Modify Type IV Pilus Surface Chemistry 提交 1998-03-02 | Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
8–165(158 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PT PLATINUM (II) ION × 1 HTO HEPTANE-1,2,3-TRIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 60% PEG400, 50 MM CHESS, PH 8.0, 1% BETA-OCTYL GLUCOSIDE, 0.6% 1,2,3-HEPTANETRIOL.
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分辨率 2.60 Å |
| 5VXX Cryo-EM reconstruction of Neisseria gonorrhoeae Type IV pilus 提交 2017-05-24 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致 |
链 A
8–165(158 aa)
链 B
8–165(158 aa)
链 C
8–165(158 aa)
链 D
8–165(158 aa)
链 E
8–165(158 aa)
链 F
8–165(158 aa)
链 G
8–165(158 aa)
链 H
8–165(158 aa)
链 I
8–165(158 aa)
链 J
8–165(158 aa)
链 K
8–165(158 aa)
链 L
8–165(158 aa)
链 M
8–165(158 aa)
链 N
8–165(158 aa)
链 O
8–165(158 aa)
链 P
8–165(158 aa)
链 Q
8–165(158 aa)
链 R
8–165(158 aa)
链 S
8–165(158 aa)
链 T
8–165(158 aa)
链 U
8–165(158 aa)
|
突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T 突变:P69S, S71T | OPE PHOSPHORIC ACID MONO-(2-AMINO-ETHYL) ESTER × 21 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 5.10 Å |