当前蛋白身份：P03212
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 T
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 V
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 X
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 13 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Z
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 14 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 2
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 15 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 4
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 16 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 6
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 N
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 3PHF Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex 提交 2010-11-04 | Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
24–131（108 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (unp residues 24-131)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；24% PEG 1000, 0.1M
Sodium Citrate, 0.2M NDSB256-4T , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.313 |
| 5T1D Crystal structure of EBV gHgL/gp42/E1D1 complex 提交 2016-08-18 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
24–135（112 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；0.1 M Tris pH 8.0, 0.18 M Potassium Citrate, 12 % PEG 6000
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.265 |
| 5W0K Crystal structure of EBV gHgL/CL40/gp42 N-domain 提交 2017-05-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
24–137（114 aa）
片段：UNP residues 24-137
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.25 M sodium sulfate, 0.1 M Bis-tris propane pH 8.5, 20 % (w/v) PEG 4000
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.299 |
| 5W0K Crystal structure of EBV gHgL/CL40/gp42 N-domain 提交 2017-05-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
24–137（114 aa）
片段：UNP residues 24-137
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.25 M sodium sulfate, 0.1 M Bis-tris propane pH 8.5, 20 % (w/v) PEG 4000
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.299 |
| 7CZE Crystal structure of Epstein-Barr virus (EBV) gHgL and in complex with the ligand binding domian (LBD) of EphA2 提交 2020-09-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
24–132（109 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1% w/v Tryptone, 0.001 M Sodium azide, 0.05 M HEPES sodium pH 7.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.285 |
| 7CZE Crystal structure of Epstein-Barr virus (EBV) gHgL and in complex with the ligand binding domian (LBD) of EphA2 提交 2020-09-08 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
24–132（109 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1% w/v Tryptone, 0.001 M Sodium azide, 0.05 M HEPES sodium pH 7.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.285 |
| 7CZE Crystal structure of Epstein-Barr virus (EBV) gHgL and in complex with the ligand binding domian (LBD) of EphA2 提交 2020-09-08 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
24–132（109 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1% w/v Tryptone, 0.001 M Sodium azide, 0.05 M HEPES sodium pH 7.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.285 |
| 7CZE Crystal structure of Epstein-Barr virus (EBV) gHgL and in complex with the ligand binding domian (LBD) of EphA2 提交 2020-09-08 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
24–132（109 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1% w/v Tryptone, 0.001 M Sodium azide, 0.05 M HEPES sodium pH 7.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.285 |
| 7S07 Crystal structure of Epstein-Barr virus glycoprotein gH/gL/gp42-peptide in complex with human neutralizing antibodies 769B10 and 769C2 提交 2021-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 B
27–124（98 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris pH6.5, 20% PEG3350, 7.5% Glycerol,
0.7% Dioxane
|
分辨率 3.29 Å R-free 0.291 |
| 7S1B Crystal structure of Epstein-Barr virus glycoproteins gH/gL/gp42-peptide in complex with human neutralizing antibodies 769C2 and 770F7 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 B
24–137（114 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES pH7.4,
24% PEG3350,
7.5% Glycerol
|
分辨率 3.03 Å R-free 0.288 |
| 8TNN Crystal structure of Epstein-Barr virus gH/gL/gp42 in complex with gp42 antibody A10 提交 2023-08-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
24–135（112 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；20mM Tris pH7.5, 150mM NaCl, 0.1M citric-acid-BIS-TRIS propane, and 10% PEG 3,350
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.281 |
| 8TNN Crystal structure of Epstein-Barr virus gH/gL/gp42 in complex with gp42 antibody A10 提交 2023-08-02 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
24–135（112 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；20mM Tris pH7.5, 150mM NaCl, 0.1M citric-acid-BIS-TRIS propane, and 10% PEG 3,350
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.281 |
| 8TNT Crystal structure of Epstein-Barr virus gH/gL/gp42 in complex with antibodies F-2-1 and 769C2 提交 2023-08-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 B
24–135（112 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；280 K；20mM Tris pH7.5, 150mM NaCl, 4% Tacsimate pH 7.0, and 10% PEG 3,350
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.287 |