当前蛋白身份：P03313
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3CDU Crystal structure of coxsackievirus B3 RNA-dependent RNA polymerase (3Dpol) in complex with a pyrophosphate 提交 2008-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1724–2185（462 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 6 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 6 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 GOL GLYCEROL × 30 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；293 K；2M ammonium sulfate, 0.1M CAPS, 0.2M lithium sulfate, pH 10, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.220 |
| 3CDW Crystal structure of coxsackievirus B3 RNA-dependent RNA polymerase (3Dpol) in complex with protein primer VPg and a pyrophosphate 提交 2008-02-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1724–2185（462 aa）
链 H
1519–1540（22 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 7 ACT ACETATE ION × 6 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 GOL GLYCEROL × 27 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；293 K；2M ammonium sulfate, 0.1M CAPS, 0.2M lithium sulfate, pH 10, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.220 |
| 4WFX Coxsackievirus B3 Polymerase - F232L Mutant - NaCl Crystal Form 提交 2014-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1724–2185（462 aa）
片段：unp residues 1724-2185
|
突变：F232L | NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；289 K；0.085 M HEPES, 3.655 M NaCl, 15% Glycerol
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.233 |
| 4WFY Coxsackievirus B3 Polymerase - F232L Mutant - AmSO4 Crystal Form 提交 2014-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1724–2185（462 aa）
片段：unp residues 1724-2185
|
突变：F232L | GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；289 K；0.085 M Tris, 1.275 M Ammonium Sulfate , 25% Glycerol
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.220 |
| 4WFZ Coxsackievirus B3 3Dpol RNA Dependent RNA Polymerase - NaCl Crystal Form 提交 2014-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1724–2185（462 aa）
片段：unp residues 1724-2185
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；289 K；0.085 M HEPES, 3.6 M NaCl , 15% Glycerol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.231 |
| 4Y2A Crystal Structure of Coxsackie Virus B3 3D polymerase in complex with GPC-N114 inhibitor 提交 2015-02-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1724–2185（462 aa）
|
未记录 | 1FS 2,2'-[(4-chlorobenzene-1,2-diyl)bis(oxy)]bis(5-nitrobenzonitrile) × 1 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM Tris pH 7.5, 24.5% (w/v) glycerol, 1.29 M ammonium sulfate.
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.250 |
| 6GZV Identification of a druggable VP1-VP3 interprotomer pocket in the capsid of enteroviruses 提交 2018-07-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric（240） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | FHK 4-[[4-[1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-2-yl]phenyl]sulfonylamino]benzoic acid × 60 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6ZCL Coxsackievirus B3 in complex with capsid binder compound 17 提交 2020-06-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric（240） 与蛋白数一致 |
链 A
583–851（269 aa）
链 B
79–330（252 aa）
链 C
333–569（237 aa）
链 D
2–69（68 aa）
|
未记录 | FHK 4-[[4-[1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-2-yl]phenyl]sulfonylamino]benzoic acid × 60 MYR MYRISTIC ACID × 60 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 6ZCL Coxsackievirus B3 in complex with capsid binder compound 17 提交 2020-06-11 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
583–851（269 aa）
链 B
79–330（252 aa）
链 C
333–569（237 aa）
链 D
2–69（68 aa）
|
未记录 | FHK 4-[[4-[1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-2-yl]phenyl]sulfonylamino]benzoic acid × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 6ZCL Coxsackievirus B3 in complex with capsid binder compound 17 提交 2020-06-11 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 A
583–851（269 aa）
链 B
79–330（252 aa）
链 C
333–569（237 aa）
链 D
2–69（68 aa）
|
未记录 | FHK 4-[[4-[1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-2-yl]phenyl]sulfonylamino]benzoic acid × 5 MYR MYRISTIC ACID × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 6ZCL Coxsackievirus B3 in complex with capsid binder compound 17 提交 2020-06-11 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
583–851（269 aa）
链 B
79–330（252 aa）
链 C
333–569（237 aa）
链 D
2–69（68 aa）
|
未记录 | FHK 4-[[4-[1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-2-yl]phenyl]sulfonylamino]benzoic acid × 6 MYR MYRISTIC ACID × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 6ZCL Coxsackievirus B3 in complex with capsid binder compound 17 提交 2020-06-11 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
583–851（269 aa）
链 B
79–330（252 aa）
链 C
333–569（237 aa）
链 D
2–69（68 aa）
|
未记录 | FHK 4-[[4-[1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-2-yl]phenyl]sulfonylamino]benzoic acid × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7LMS Structure of human SetD3 methyl-transferase in complex with 2A protease from Coxsackievirus B3 提交 2021-02-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
855–1001（147 aa）
|
突变：C107A | ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7QUW CVB3-3Cpro in complex with inhibitor MG-78 提交 2022-01-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
1541–1720（180 aa）
|
未记录 | I70 (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.6；293 K；0.2 M MgCl2
0.1M Tris-HCl pH 8.6
25% PEG 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.279 |
| 7VXH Coxsackievirus B3 full particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric（240） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 60 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 7VXH Coxsackievirus B3 full particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 7VXH Coxsackievirus B3 full particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 7VXH Coxsackievirus B3 full particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 7VXH Coxsackievirus B3 full particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 7VXL Coxsackievirus B3 A-particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric（180） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7VXL Coxsackievirus B3 A-particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7VXL Coxsackievirus B3 A-particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7VXL Coxsackievirus B3 A-particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7VXL Coxsackievirus B3 A-particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7VXN Coxsackievirus B3 Empty particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric（180） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 7VXN Coxsackievirus B3 Empty particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 7VXN Coxsackievirus B3 Empty particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 7VXN Coxsackievirus B3 Empty particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 7VXN Coxsackievirus B3 Empty particle at pH7.4 (VP3-234Q) 提交 2021-11-12 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 7VXZ Coxsackievirus B3 at pH7.4 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 20min 提交 2021-11-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 300 PDB 声明：300-meric（300） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.19 Å |
| 7VXZ Coxsackievirus B3 at pH7.4 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 20min 提交 2021-11-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.19 Å |
| 7VXZ Coxsackievirus B3 at pH7.4 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 20min 提交 2021-11-13 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric（25） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.19 Å |
| 7VXZ Coxsackievirus B3 at pH7.4 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 20min 提交 2021-11-13 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.19 Å |
| 7VXZ Coxsackievirus B3 at pH7.4 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 20min 提交 2021-11-13 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
571–854（284 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.19 Å |
| 7VY5 Coxsackievirus B3 (VP3-234Q) incubation with CD55 at pH7.4 提交 2021-11-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 300 PDB 声明：300-meric（300） 与蛋白数一致 |
链 A
583–850（268 aa）
链 B
77–332（256 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
2–69（68 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 60 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 7VY5 Coxsackievirus B3 (VP3-234Q) incubation with CD55 at pH7.4 提交 2021-11-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
583–850（268 aa）
链 B
77–332（256 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
2–69（68 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 7VY5 Coxsackievirus B3 (VP3-234Q) incubation with CD55 at pH7.4 提交 2021-11-13 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric（25） 与蛋白数一致 |
链 A
583–850（268 aa）
链 B
77–332（256 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
2–69（68 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 7VY5 Coxsackievirus B3 (VP3-234Q) incubation with CD55 at pH7.4 提交 2021-11-13 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 A
583–850（268 aa）
链 B
77–332（256 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
2–69（68 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 7VY5 Coxsackievirus B3 (VP3-234Q) incubation with CD55 at pH7.4 提交 2021-11-13 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
583–850（268 aa）
链 B
77–332（256 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
2–69（68 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 7VYK Coxsackievirus B3 at pH7.4 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 10min 提交 2021-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 300 PDB 声明：300-meric（300） 与蛋白数一致 |
链 A
583–849（267 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 60 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 7VYK Coxsackievirus B3 at pH7.4 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 10min 提交 2021-11-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
583–849（267 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 7VYK Coxsackievirus B3 at pH7.4 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 10min 提交 2021-11-14 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric（25） 与蛋白数一致 |
链 A
583–849（267 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 7VYK Coxsackievirus B3 at pH7.4 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 10min 提交 2021-11-14 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 A
583–849（267 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 7VYK Coxsackievirus B3 at pH7.4 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 10min 提交 2021-11-14 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
583–849（267 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 7VYL Coxsackievirus B3 at pH5.5 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 20min 提交 2021-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 300 PDB 声明：300-meric（300） 与蛋白数一致 |
链 A
571–851（281 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 7VYL Coxsackievirus B3 at pH5.5 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 20min 提交 2021-11-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
571–851（281 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 7VYL Coxsackievirus B3 at pH5.5 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 20min 提交 2021-11-14 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric（25） 与蛋白数一致 |
链 A
571–851（281 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 7VYL Coxsackievirus B3 at pH5.5 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 20min 提交 2021-11-14 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 A
571–851（281 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 7VYL Coxsackievirus B3 at pH5.5 (VP3-234Q) incubation with coxsackievirus and adenovirus receptor for 20min 提交 2021-11-14 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
571–851（281 aa）
链 B
70–332（263 aa）
链 C
333–570（238 aa）
链 D
1–69（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 8S6F A Structural Investigation of the Interaction between a GC-376-Based Peptidomimetic PROTAC and Its Precursor with the Viral Main Protease of Coxsackievirus B3 提交 2024-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1541–1720（180 aa）
|
未记录 | VQR methyl (4~{S})-4-[[(2~{S})-4-methyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoyl]amino]-5-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pentanoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 0.2 M MgCl2, 26% PEG4000
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.264 |
| 9D9O Crystal structure of CVB3 replication-linked RNA stem-loop D in complex with 3C protein 提交 2024-08-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1541–1723（183 aa）
链 B
1541–1723（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；291.15 K；DL-Malic Acid, PEG 3350
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.238 |
| 9D9P Crystal structure of CVB3 replication-linked RNA in complex with 3C protein 提交 2024-08-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1541–1723（183 aa）
链 B
1541–1723（183 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；291.15 K；Glycerol, Bis-Tris, Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.232 |
| 9DCF Structure of Coxsackievirus B3 cloverleaf RNA in complex with 3Cpro dimer 提交 2024-08-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1541–1723（183 aa）
片段：UNP residues 1541-1723
链 B
1541–1723（183 aa）
片段：UNP residues 1541-1723
|
突变：C147A,G55A,D58A,V63A 突变：C147A,G55A,D58A,V63A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.15 K；8% v/v Tacsimate, pH 6.0, 25% w/v PEG3350
|
分辨率 2.87 Å R-free 0.273 |