当前蛋白身份：P03368
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1A9M G48H MUTANT OF HIV-1 PROTEASE IN COMPLEX WITH A PEPTIDIC INHIBITOR U-89360E 提交 1998-04-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
69–167（99 aa）
链 B
69–167（99 aa）
|
突变：G48H 突变：G48H | U0E N-[[1-[N-ACETAMIDYL]-[1-CYCLOHEXYLMETHYL-2-HYDROXY-4-ISOPROPYL]-BUT-4-YL]-CARBONYL]-GLUTAMINYL-ARGINYL-AMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.8；THE PROTEIN SOLUTION CONTAINED 6.5 MG/ML MUTANT HIV-1 PROTEASE IN 20 MM SODIUM ACETATE, 1 MM DITHIOTHREITOL, PH 5.5, WITH A 10-FOLD MOLAR EXCESS OF INHIBITOR. THE RESERVOIR SOLUTIONS FOR THE VAPOR DIFFUSION CONTAINED 10% DIMETHYLSULFOXIDE, 30 MM B-MERCAPTOETHANOL AND 4% 2-PROPANOL IN ADDITION TO THE PRECIPITANT. THE MOST FAVORABLE CRYSTALLIZATION CONDITIONS WERE 42% SATURATED AMMONIUM SULFATE, PH 6.8., vapor diffusion
|
分辨率 2.30 Å |
| 1G35 CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 PROTEASE IN COMPLEX WITH INHIBITOR, AHA024 提交 2000-10-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
69–167（99 aa）
链 B
69–167（99 aa）
|
未记录 | AHF 2-[4-(HYDROXY-METHOXY-METHYL)-BENZYL]-7-(4-HYDROXYMETHYL-BENZYL)-1,1-DIOXO-3,6-BIS-PHENOXYMETHYL-1LAMBDA6-[1,2,7]THIADIAZEPANE-4,5-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；50 mM MES, 0.4 M NaCl, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 1GNM HIV-1 PROTEASE MUTANT WITH VAL 82 REPLACED BY ASP (V82D) COMPLEXED WITH U89360E (INHIBITOR) 提交 1996-05-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
69–167（99 aa）
链 B
69–167（99 aa）
|
突变：V82D 突变：V82D | U0E N-[[1-[N-ACETAMIDYL]-[1-CYCLOHEXYLMETHYL-2-HYDROXY-4-ISOPROPYL]-BUT-4-YL]-CARBONYL]-GLUTAMINYL-ARGINYL-AMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å |
| 1GNN HIV-1 PROTEASE MUTANT WITH VAL 82 REPLACED BY ASN (V82N) COMPLEXED WITH U89360E (INHIBITOR) 提交 1996-05-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
69–167（99 aa）
链 B
69–167（99 aa）
|
突变：V82N 突变：V82N | U0E N-[[1-[N-ACETAMIDYL]-[1-CYCLOHEXYLMETHYL-2-HYDROXY-4-ISOPROPYL]-BUT-4-YL]-CARBONYL]-GLUTAMINYL-ARGINYL-AMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å |
| 1GNO HIV-1 PROTEASE (WILD TYPE) COMPLEXED WITH U89360E (INHIBITOR) 提交 1996-05-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
69–167（99 aa）
链 B
69–167（99 aa）
|
未记录 | U0E N-[[1-[N-ACETAMIDYL]-[1-CYCLOHEXYLMETHYL-2-HYDROXY-4-ISOPROPYL]-BUT-4-YL]-CARBONYL]-GLUTAMINYL-ARGINYL-AMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å |
| 1HVI INFLUENCE OF STEREOCHEMISTRY ON ACTIVITY AND BINDING MODES FOR C2 SYMMETRY-BASED DIOL INHIBITORS OF HIV-1 PROTEASE 提交 1994-01-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
69–167（99 aa）
链 B
69–167（99 aa）
|
未记录 | A77 N-{1-BENZYL-(2R,3S)-2,3-DIHYDROXY-4-[3-METHYL-2-(3-METHYL-3-PYRIDIN-2-YLMETHYL-UREIDO)-BUTYRYLAMINO]-5-PHENYL-PENTYL}-3-METHYL-2-(3-METHYL-3-PYRIDIN-2-YLMETHYL-UREIDO)-BUTYRAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1KJH SUBSTRATE SHAPE DETERMINES SPECIFICITY OF RECOGNITION RECOGNITION FOR HIV-1 PROTEASE: ANALYSIS OF CRYSTAL STRUCTURES OF SIX SUBSTRATE COMPLEXES 提交 2001-12-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
723–732（10 aa）
片段：RNASE H-INTEGRASE SUBSTRATE PEPTIDE, RESIDUES 723-732
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；AMMONIUM SULPHATE, SODIUM CITRATE, SODIUM PHOSPHATE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.227 |
| 1NPA crystal structure of HIV-1 protease-hup 提交 2003-01-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
69–167（99 aa）
片段：protease, residue 69-167
链 B
69–167（99 aa）
片段：protease, residue 69-167
|
未记录 | 3NH (3S)-TETRAHYDROFURAN-3-YL (1R,2S)-3-[4-((1R)-2-{[(S)-AMINO(HYDROXY)METHYL]OXY}-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL)-2-BENZYL-3-OXOPYRROLIDIN-2-YL]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；0.1 M NaAc, 0.5 M NaCl, 1mM DTT, 3mM NaN3, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å |
| 1NPV Crystal structure of HIV-1 protease complexed with LDC271 提交 2003-01-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
69–167（99 aa）
片段：HIV protease
链 B
69–167（99 aa）
片段：HIV protease
|
未记录 | L27 {1-BENZYL-3-[2-BENZYL-3-OXO-4-(1-OXO-1,2,3,4-TETRAHYDRO- ISOQUINOLIN-4-YL)-2,3-DIHYDRO-1H-PYRROL-2-YL]-2- HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；298 K；600mM NaCl, 100mM Sodium Acetate buffer at pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.260 |
| 1NPW Crystal structure of HIV protease complexed with LGZ479 提交 2003-01-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
69–167（99 aa）
片段：HIV-1 PROTEASE
链 B
69–167（99 aa）
片段：HIV-1 PROTEASE
|
未记录 | LGZ CARBAMIC ACID 1-{5-BENZYL-5-[2-HYDROXY-4-PHENYL-3-(TETRAHYDRO-FURAN- 3-YLOXYCARBONYLAMINO)-BUTYL]-4-OXO-4,5-DIHYDRO-1H-PYRROL-3-YL}- INDAN-2-YL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；298 K；600mM NaCl, 100mM Sodium Acetate buffer, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å |
| 1T7K Crystal Structure of HIV Protease complexed with Arylsulfonamide azacyclic urea 提交 2004-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
69–167（99 aa）
片段：HIV Protease
链 B
69–167（99 aa）
片段：HIV Protease
|
未记录 | BH0 3-({5-BENZYL-6-HYDROXY-2,4-BIS-(4-HYDROXY-BENZYL)-3-OXO-[1,2,4]-TRIAZEPANE-1-SULFONYL)-BENZONITRILE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.7；293 K；0.1M sodium acetate, 0.6M NaCl, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.277 |
| 1YT9 HIV Protease with oximinoarylsulfonamide bound 提交 2005-02-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
69–167（99 aa）
片段：HIV protease
链 B
69–167（99 aa）
片段：HIV protease
|
未记录 | OIS (S)-N-((2S,3R)-3-HYDROXY-4-(4-((E)-(HYDROXYIMINO)METHYL)-N-ISOBUTYLPHENYLSULFONAMIDO)-1-PHENYLBUTAN-2-YL)-3-METHYL-2-(3 -((2-METHYLTHIAZOL-4-YL)METHYL)-2-OXOIMIDAZOLIDIN-1-YL)BUTANAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；294 K；nacl, acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.338 |
| 1ZP8 HIV Protease with inhibitor AB-2 提交 2005-05-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
69–167（99 aa）
片段：HIV Protease
|
未记录 | AB2 [1-((1S,2R)-1-BENZYL-2-HYDROXY-3-{ISOBUTYL[(4-METHOXYPHENYL)SULFONYL]AMINO}PROPYL)-1H-1,2,3-TRIAZOL-4-YL]METHYL (1R,2R)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YLCARBAMATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；1.34 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Na Acetate, pH 4.8-5.4, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.326 |
| 1ZPA HIV Protease with Scripps AB-3 Inhibitor 提交 2005-05-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
69–167（99 aa）
片段：HIV Protease
|
未记录 | A83 TERT-BUTYL 4-[({[1-((1S,2R)-1-BENZYL-2-HYDROXY-3-{ISOBUTYL[(4-METHOXYPHENYL)SULFONYL]AMINO}PROPYL)-1H-1,2,3-TRIAZOL-4-YL]METHYL}AMINO)CARBONYL]BENZYLCARBAMATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；1.34 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Na Acetate, pH 4.8-5.4, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.02 Å |
| 2EXF Solution structure of the HIV-1 nucleocapsid (NCp7(12-55)) complexed with the DNA (-) Primer Binding Site 提交 2005-11-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
389–431（43 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）1mM protein, 1mM oligonucleotide；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）1mM protein, 1mM oligonucleotide, 30mM NaCl, 0.2mM MgCl2；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）1mM protein, 1mM oligonucleotide；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）1mM protein, 1mM oligonucleotide, 30mM NaCl, 0.2mM MgCl2；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）1mM protein, 1mM oligonucleotide；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）1mM protein, 1mM oligonucleotide, 30mM NaCl, 0.2mM MgCl2；压力 ambient
NMR样品组成
1mM NCp7(12-55), 1mM DP(-)PBS, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM NCp7(12-55), 1mM DP(-)PBS, 90% H2O, 10% D2O, 30mM NaCl, 0.2mM MgCl2 | 90% H2O, 10% D2O, 30mM NaCl, 0.2mM MgCl2
NMR样品组成
2mM NCp7(12-55), 1mM DP(-)PBS, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2mM NCp7(12-55), 1mM DP(-)PBS, 90% H2O, 10% D2O, 30mM NaCl, 0.2mM MgCl2 | 90% H2O, 10% D2O, 30mM NaCl, 0.2mM MgCl2
|
分辨率未提供 |
| 2FDE Wild type HIV protease bound with GW0385 提交 2005-12-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
500–598（99 aa）
片段：protease
链 B
500–598（99 aa）
片段：protease
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 385 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL [(1S,2R)-3-[(1,3-BENZODIOXOL-5-YLSULFONYL)(ISOBUTYL)AMINO]-2-HYDROXY-1-{4-[(2-METHYL-1,3-THIAZOL-4-YL)METHOXY]BENZYL}PROPYL]CARBAMATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.280 |
| 2G69 Structure of Unliganded HIV-1 Protease F53L Mutant 提交 2006-02-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
片段：HIV-1 protease monomer
|
突变：Q7K, L33I, F53L, L63I, C67A, C95A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；The reservoir contained 0.2 M sodium citrate, phosphate buffer (pH = 6.0-6.4), 10% DMSO, and 20-30% saturated ammonium sulfate as a precipitant., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.234 |
| 2HNZ Crystal Structure of E138K Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with PETT-2 提交 2006-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
605–1026（422 aa）
片段：P51
|
突变：E138K | PO4 PHOSPHATE ION × 2 PC0 1-[2-(4-ETHOXY-3-FLUOROPYRIDIN-2-YL)ETHYL]-3-(5-METHYLPYRIDIN-2-YL)THIOUREA × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.277 |
| 2HS1 Ultra-high resolution X-ray crystal structure of HIV-1 protease V32I mutant with TMC114 (darunavir) inhibitor 提交 2006-07-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
500–598（99 aa）
片段：HIV-1 protease (residues 500-598)
链 B
500–598（99 aa）
片段：HIV-1 protease (residues 500-598)
|
突变：Q7K, V32I, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, V32I, L33I, L63I, C67A, C95A | CL CHLORIDE ION × 3 017 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295 K；1-1.5 M NaCl;
Molar Protein:Inhibitor ratio = 1:20, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 0.84 Å R-free 0.149 |
| 2HS2 Crystal structure of M46L mutant of HIV-1 protease complexed with TMC114 (darunavir) 提交 2006-07-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
500–598（99 aa）
片段：HIV-1 protease (residues 500-598)
链 B
500–598（99 aa）
片段：HIV-1 protease (residues 500-598)
|
突变：Q7K, L33I, M46L, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, M46L, L63I, C67A, C95A | CL CHLORIDE ION × 2 017 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.8；295 K；25% NaCl; Molar protein:inhibitor ratio 1:2., pH 3.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.195 |
| 2I4D Crystal structure of WT HIV-1 protease with GS-8373 提交 2006-08-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
500–598（99 aa）
链 B
500–598（99 aa）
|
未记录 | QFI ({4-[(2S,3R)-2-({[(3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YLOXY]CARBONYL}AMINO)-3-HYDROXY-4-{ISOBUTYL[(4-METHOXYPHENYL)SULFONYL]AMINO}BUTYL]PHENOXY}METHYL)PHOSPHONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Mg Acetate, 0.1M Na cacodylate, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.274 |
| 2I4U HIV-1 protease with TMC-126 提交 2006-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
500–598（99 aa）
链 B
500–598（99 aa）
|
未记录 | DJR (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL [(1S,2R)-1-BENZYL-2-HYDROXY-3-{ISOBUTYL[(4-METHOXYPHENYL)SULFONYL]AMINO}PROPYL]CARBAMATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；0.4 M Sodium Potassium Tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.250 |
| 2I4V HIV-1 protease I84V, L90M with TMC126 提交 2006-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
500–598（99 aa）
链 B
500–598（99 aa）
|
突变：I84V, L90M 突变：I84V, L90M | DJR (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL [(1S,2R)-1-BENZYL-2-HYDROXY-3-{ISOBUTYL[(4-METHOXYPHENYL)SULFONYL]AMINO}PROPYL]CARBAMATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；0.4 M Sodium Potassium Tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.256 |
| 2I4W HIV-1 protease WT with GS-8374 提交 2006-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
500–598（99 aa）
链 B
500–598（99 aa）
|
未记录 | KGQ DIETHYL ({4-[(2S,3R)-2-({[(3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YLOXY]CARBONYL}AMINO)-3-HYDROXY-4-{ISOBUTYL[(4-METHOXYPHENYL)SULFONYL]AMINO}BUTYL]PHENOXY}METHYL)PHOSPHONATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；0.2M Mg Acetate, 0.1M Na Cacodylate, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.252 |
| 2I4X HIV-1 Protease I84V, L90M with GS-8374 提交 2006-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
500–598（99 aa）
链 B
500–598（99 aa）
|
突变：I84V, L90M 突变：I84V, L90M | KGQ DIETHYL ({4-[(2S,3R)-2-({[(3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YLOXY]CARBONYL}AMINO)-3-HYDROXY-4-{ISOBUTYL[(4-METHOXYPHENYL)SULFONYL]AMINO}BUTYL]PHENOXY}METHYL)PHOSPHONATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；0.4 M Sodium Potassium Tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.272 |
| 2IDW Crystal structure analysis of HIV-1 protease mutant V82A with a potent non-peptide inhibitor (UIC-94017) 提交 2006-09-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
500–598（99 aa）
片段：residues 500-598
链 B
500–598（99 aa）
片段：residues 500-598
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突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, V82A, C95A, Q107K, L133I, L163I, C167A, V182A, C195A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, V82A, C95A, Q107K, L133I, L163I, C167A, V182A, C195A | CL CHLORIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 ACY ACETIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 1 017 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；AMMONIUM SULFATE, CITRIC PHOSPHATE, DMSO, pH 5.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.10 Å R-free 0.145 |
| 2IEN Crystal structure analysis of HIV-1 protease with a potent non-peptide inhibitor (UIC-94017) 提交 2006-09-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
500–598（99 aa）
片段：residues 500-598
链 B
500–598（99 aa）
片段：residues 500-598
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突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A, Q107K, L133I, L163I, C167A, C195A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A, Q107K, L133I, L163I, C167A, C195A | NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 ACY ACETIC ACID × 2 017 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；sodium chloride, sodium acetate, DMSO, dioxane, pH 4.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.30 Å R-free 0.205 |
| 2IEO Crystal structure analysis of HIV-1 protease mutant I84V with a potent non-peptide inhibitor (UIC-94017) 提交 2006-09-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
500–598（99 aa）
片段：residues 500-598
链 B
500–598（99 aa）
片段：residues 500-598
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突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, I84V, C95A, Q107K, L133I, L163I, C167A, C195A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, I84V, C95A, Q107K, L133I, L163I, C167A, C195A | CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 017 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；SODIUM CHLORIDE, CITRATE PHOSPHATE, DMSO, pH 5.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.53 Å R-free 0.196 |