当前蛋白身份：P03406
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AVV HIV-1 NEF PROTEIN, UNLIGANDED CORE DOMAIN 提交 1997-09-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
58–206（149 aa）
片段：CORE DOMAIN
|
突变：DEL(2-57), N-TERMINAL RESIDUES GS (PART OF A THROMBIN CLEAVAGE SITE) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.280 |
| 1AVZ V-1 NEF PROTEIN IN COMPLEX WITH WILD TYPE FYN SH3 DOMAIN 提交 1997-09-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
58–206（149 aa）
片段：CONSERVED CORE DOMAIN
链 B
58–206（149 aa）
片段：CONSERVED CORE DOMAIN
|
突变：N-TERMINAL RESIDUES GS (PART OF A THROMBIN CLEAVAGE SITE) 突变：N-TERMINAL RESIDUES GS (PART OF A THROMBIN CLEAVAGE SITE) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.9；pH 8.9
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.270 |
| 1EFN HIV-1 NEF PROTEIN IN COMPLEX WITH R96I MUTANT FYN SH3 DOMAIN 提交 1996-06-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
54–205（152 aa）
片段：CONSERVED CORE DOMAIN OF NEF, RESIDUES 71-203
链 D
54–205（152 aa）
片段：CONSERVED CORE DOMAIN OF NEF, RESIDUES 71-203
|
突变：T71R 突变：T71R | PBM TRIMETHYL LEAD ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.282 |
| 4D8D Crystal structure of HIV-1 NEF Fyn-SH3 R96W variant 提交 2012-01-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
58–204（147 aa）
片段：CONSERVED CORE DOMAIN (UNP Residues 58-204)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293 K；0.3 M sodium potassium tartrate, 0.5 M bicine buffer , 1cmc D-octylglucopyranoside, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.238 |
| 4D8D Crystal structure of HIV-1 NEF Fyn-SH3 R96W variant 提交 2012-01-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
58–204（147 aa）
片段：CONSERVED CORE DOMAIN (UNP Residues 58-204)
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293 K；0.3 M sodium potassium tartrate, 0.5 M bicine buffer , 1cmc D-octylglucopyranoside, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.52 Å R-free 0.238 |