当前蛋白身份：P03956
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AYK INHIBITOR-FREE CATALYTIC FRAGMENT OF HUMAN FIBROBLAST COLLAGENASE, NMR, 30 STRUCTURES 提交 1997-11-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
101–269（169 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；308 K；压力 1
|
分辨率未提供 |
| 1CGE CRYSTAL STRUCTURES OF RECOMBINANT 19-KDA HUMAN FIBROBLAST COLLAGENASE COMPLEXED TO ITSELF 提交 1994-02-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
102–269（168 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å |
| 1CGF CRYSTAL STRUCTURES OF RECOMBINANT 19-KDA HUMAN FIBROBLAST COLLAGENASE COMPLEXED TO ITSELF 提交 1994-02-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
102–263（162 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å |
| 1CGF CRYSTAL STRUCTURES OF RECOMBINANT 19-KDA HUMAN FIBROBLAST COLLAGENASE COMPLEXED TO ITSELF 提交 1994-02-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
102–263（162 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å |
| 1HFC 1.56 ANGSTROM STRUCTURE OF MATURE TRUNCATED HUMAN FIBROBLAST COLLAGENASE 提交 1994-09-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
101–269（169 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 PLH METHYLAMINO-PHENYLALANYL-LEUCYL-HYDROXAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.50 Å |
| 1SU3 X-ray structure of human proMMP-1: New insights into collagenase action 提交 2004-03-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
20–469（450 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；1.5M Li2SO4, 0.1M Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.252 |
| 1SU3 X-ray structure of human proMMP-1: New insights into collagenase action 提交 2004-03-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
20–469（450 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；1.5M Li2SO4, 0.1M Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.252 |
| 1SU3 X-ray structure of human proMMP-1: New insights into collagenase action 提交 2004-03-26 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
20–469（450 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 32 CL CHLORIDE ION × 8 NA SODIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 16 SO4 SULFATE ION × 32 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；1.5M Li2SO4, 0.1M Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.252 |
| 2AYK INHIBITOR-FREE CATALYTIC FRAGMENT OF HUMAN FIBROBLAST COLLAGENASE, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1997-11-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
101–269（169 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM TRIS BASE, 100 mM NACL, 5 mM CACL2, 0.1 mM ZNCL2, 2mM NAN3, 10 mM DEUTERATED DTT, 90% H2O/10%D2O OR 100% D2O；压力 1
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分辨率未提供 |
| 2CLT Crystal structure of the active form (full-length) of human fibroblast collagenase. 提交 2006-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
100–466（367 aa）
|
突变：YES | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M TRIS (7.5); 10% PEG 8000; 1.5M AMMONIUM FORMATE, pH 7.50
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.259 |
| 2CLT Crystal structure of the active form (full-length) of human fibroblast collagenase. 提交 2006-04-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
100–466（367 aa）
|
突变：YES | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M TRIS (7.5); 10% PEG 8000; 1.5M AMMONIUM FORMATE, pH 7.50
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.259 |
| 2J0T Crystal Structure of the Catalytic Domain of MMP-1 in Complex with the Inhibitory Domain of TIMP-1 提交 2006-08-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
101–269（169 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 101-269
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；10% PEG 8000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.1M HEPES (PH 7.5).
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.275 |
| 2J0T Crystal Structure of the Catalytic Domain of MMP-1 in Complex with the Inhibitory Domain of TIMP-1 提交 2006-08-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
101–269（169 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 101-269
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；10% PEG 8000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.1M HEPES (PH 7.5).
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.275 |
| 2J0T Crystal Structure of the Catalytic Domain of MMP-1 in Complex with the Inhibitory Domain of TIMP-1 提交 2006-08-04 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
101–269（169 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 101-269
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；10% PEG 8000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.1M HEPES (PH 7.5).
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.275 |
| 2TCL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST COLLAGENASE COMPLEXED WITH AN INHIBITOR 提交 1994-09-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
101–269（169 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 SM SAMARIUM (III) ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 RO4 [[1-[N-HYDROXY-ACETAMIDYL]-3-METHYL-BUTYL]-CARBONYL-LEUCINYL]-ALANINE ETHYL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 3AYK CATALYTIC FRAGMENT OF HUMAN FIBROBLAST COLLAGENASE COMPLEXED WITH CGS-27023A, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1999-02-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
101–269（169 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 CGS N-HYDROXY-2(R)-[[(4-METHOXYPHENYL)SULFONYL](3-PICOLYL)AMINO]-3-METHYLBUTANAMIDE HYDROCHLORIDE × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；308 K；压力 1
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分辨率未提供 |
| 3SHI Crystal structure of human MMP1 catalytic domain at 2.2 A resolution 提交 2011-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
106–261（156 aa）
片段：UNP residues 106-261
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；30% PEG8000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5
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分辨率 2.20 Å R-free 0.278 |
| 3SHI Crystal structure of human MMP1 catalytic domain at 2.2 A resolution 提交 2011-06-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
106–261（156 aa）
片段：UNP residues 106-261
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；30% PEG8000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.278 |
| 3SHI Crystal structure of human MMP1 catalytic domain at 2.2 A resolution 提交 2011-06-16 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 M
106–261（156 aa）
片段：UNP residues 106-261
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；30% PEG8000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.278 |
| 4AUO Crystal structure of MMP-1(E200A) in complex with a triple-helical collagen peptide 提交 2012-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
100–466（367 aa）
|
突变：YES | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.273 |
| 4AUO Crystal structure of MMP-1(E200A) in complex with a triple-helical collagen peptide 提交 2012-05-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
100–466（367 aa）
|
突变：YES | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.273 |
| 4AYK CATALYTIC FRAGMENT OF HUMAN FIBROBLAST COLLAGENASE COMPLEXED WITH CGS-27023A, NMR, 30 STRUCTURES 提交 1999-02-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
101–269（169 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 CGS N-HYDROXY-2(R)-[[(4-METHOXYPHENYL)SULFONYL](3-PICOLYL)AMINO]-3-METHYLBUTANAMIDE HYDROCHLORIDE × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；308 K；压力 1
|
分辨率未提供 |
| 966C CRYSTAL STRUCTURE OF FIBROBLAST COLLAGENASE-1 COMPLEXED TO A DIPHENYL-ETHER SULPHONE BASED HYDROXAMIC ACID 提交 1998-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
108–264（157 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 RS2 N-HYDROXY-2-[4-(4-PHENOXY-BENZENESULFONYL)-TETRAHYDRO-PYRAN-4-YL]-ACETAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.330 |