当前蛋白身份:P04271 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1MQ1 Ca2+-S100B-TRTK-12 complex 提交 2002-09-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–91(91 aa)
链 B 1–91(91 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.05;308 K;离子强度(mmCIF原始值)35 mM KCl;压力 ambient
NMR样品组成 U-13C, U-15N S100B (1.0 mM) unlabelled TRTK-12 (1.2 mM) 3 mM CaCl2 | 90% H20, 10% D20
NMR样品组成 U-2H, U-15N S100B (0.35 mM) unlabelled TRTK-12 (0.80 mM) 1 mM CaCl2 | 90% H20, 10% D20
NMR样品组成 U-13C, U-15N S100B (1.0 mM) 13C-acetyl, 13C-Ile TRTK-12 (1.2 mM) 3 mM CaCl2 | 90% H20, 10% D20
NMR样品组成 U-13C/U-12C S100B heterodimer (1.0mM) Unlabelled TRTK-12 (1.2 mM) 3 mM CaCl2 | 90% H20, 10% D20
分辨率未提供
1UWO CALCIUM FORM OF HUMAN S100B, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-12-05 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–91(91 aa)
链 B 1–91(91 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.05;308 K
分辨率未提供
2H61 X-ray structure of human Ca2+-loaded S100B 提交 2006-05-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 0–91(92 aa)
链 B 0–91(92 aa)
链 C 0–91(92 aa)
链 D 0–91(92 aa)
链 E 0–91(92 aa)
链 F 0–91(92 aa)
链 G 0–91(92 aa)
链 H 0–91(92 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CA CALCIUM ION × 18 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.2;289 K;0.1 M HEPES, 18-20%PEG400, 0.2 M CaCl2, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
分辨率 1.90 Å R-free 0.241
2M49 Structural Insights into Human S100B and Basic Fibroblast Growth Factor (FGF2) Interaction 提交 2013-02-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 2–92(91 aa)
链 D 2–92(91 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.050;压力 ambient
NMR样品组成 1.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] S100B-1, 20 mM TRIS-2, 50 mM ammonium sulfate-3, 5 mM calcium chloride-4, 5 mM DTT-5, 0.01 % sodium azide-6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2PRU NMR Structure of Human apoS100B at 10C 提交 2007-05-04 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2–92(91 aa)
链 B 2–92(91 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2;283 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM;压力 ambient
NMR样品组成 1-2 mM U-13C,U-15N S100B, 50 mM KCl, 90%H2O/10%D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.7 mM U-15N S100B, 50 mM KCl, 12 mg/ml PF1 Phage, 90%H2O/10%D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3CZT Crystal Structure of S100B in the Calcium and Zinc Loaded State at pH 9 提交 2008-04-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 X 1–92(92 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;291 K;0.02 M TAPS, pH 9.0, 30% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.40 Å R-free 0.222
3D0Y Crystal Structure of S100B in the Calcium and Zinc Loaded State at pH 6.5 提交 2008-05-02 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–92(92 aa)
链 B 1–92(92 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289 K;0.1 M MES pH 6.5 21% PEG5000MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
分辨率 1.50 Å R-free 0.261
3D10 Crystal Structure of S100B in the Calcium and Zinc Loaded State at pH 10.0 提交 2008-05-02 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–92(92 aa)
链 B 1–92(92 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 10;291 K;0.02 M CAPS pH 10.0, 23% PEG5000MME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.65 Å R-free 0.275
3HCM Crystal structure of human S100B in complex with S45 提交 2009-05-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–92(92 aa)
链 B 1–92(92 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 S45 (3R)-3-[3-(4-chlorophenyl)-1,2,4-oxadiazol-5-yl]piperidine × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;298 K;0.1M sodium acetate, 0.02M calcium chloride, 45% methylpenthanediol, pH4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.311
4XYN X-ray structure of Ca(2+)-S100B with human RAGE-derived W61 peptide 提交 2015-02-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–92(92 aa)
链 B 1–92(92 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.8;293 K;0.1M Na cacodylate, pH 6.8, 25% w/v PEG 3350, 9mM CaCl2
分辨率 2.55 Å R-free 0.254
4XYN X-ray structure of Ca(2+)-S100B with human RAGE-derived W61 peptide 提交 2015-02-02 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–92(92 aa)
链 D 1–92(92 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.8;293 K;0.1M Na cacodylate, pH 6.8, 25% w/v PEG 3350, 9mM CaCl2
分辨率 2.55 Å R-free 0.254
5CSF S100B-RSK1 crystal structure A 提交 2015-07-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–92(92 aa)
链 B 1–92(92 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;0.1 M Hepes 7, 150 mM NaCl, 20% PEG6000
分辨率 2.40 Å R-free 0.291
5CSI S100B-RSK1 crystal structure A' 提交 2015-07-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–92(92 aa)
链 B 1–92(92 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;0.1 M Hepes 7, 150 mM NaCl, 20% PEG6000
分辨率 2.13 Å R-free 0.250
5CSJ S100B-RSK1 crystal structure B 提交 2015-07-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–92(92 aa)
链 B 1–92(92 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;0.1 M Hepes 7, 150 mM NaCl, 20% PEG6000
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
5CSN S100B-RSK1 crystal structure C 提交 2015-07-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–92(92 aa)
链 B 1–92(92 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;0.1 M Hepes 7, 150 mM NaCl, 20% PEG6000
分辨率 2.95 Å R-free 0.279
5D7F X-ray structure of Ca(2+)-S100B with human RAGE-derived W72 peptide 提交 2015-08-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–92(92 aa)
链 B 1–92(92 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.8;293 K;100mM Na cacodylate pH 6.8, 22% w/v PEG 3350, 5mM CaCl2
分辨率 1.30 Å R-free 0.183