当前蛋白身份:P04271
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1MQ1 Ca2+-S100B-TRTK-12 complex 提交 2002-09-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–91(91 aa)
链 B
1–91(91 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.05;308 K;离子强度(mmCIF原始值)35 mM KCl;压力 ambient
NMR样品组成
U-13C, U-15N S100B (1.0 mM)
unlabelled TRTK-12 (1.2 mM)
3 mM CaCl2 | 90% H20, 10% D20
NMR样品组成
U-2H, U-15N S100B (0.35 mM)
unlabelled TRTK-12 (0.80 mM)
1 mM CaCl2 | 90% H20, 10% D20
NMR样品组成
U-13C, U-15N S100B (1.0 mM)
13C-acetyl, 13C-Ile TRTK-12 (1.2 mM)
3 mM CaCl2 | 90% H20, 10% D20
NMR样品组成
U-13C/U-12C S100B heterodimer (1.0mM)
Unlabelled TRTK-12 (1.2 mM)
3 mM CaCl2 | 90% H20, 10% D20
|
分辨率未提供 |
| 1UWO CALCIUM FORM OF HUMAN S100B, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-12-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–91(91 aa)
链 B
1–91(91 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.05;308 K
|
分辨率未提供 |
| 2H61 X-ray structure of human Ca2+-loaded S100B 提交 2006-05-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 A
0–91(92 aa)
链 B
0–91(92 aa)
链 C
0–91(92 aa)
链 D
0–91(92 aa)
链 E
0–91(92 aa)
链 F
0–91(92 aa)
链 G
0–91(92 aa)
链 H
0–91(92 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 18 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.2;289 K;0.1 M HEPES, 18-20%PEG400, 0.2 M CaCl2, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.241 |
| 2M49 Structural Insights into Human S100B and Basic Fibroblast Growth Factor (FGF2) Interaction 提交 2013-02-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
2–92(91 aa)
链 D
2–92(91 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.050;压力 ambient
NMR样品组成
1.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] S100B-1, 20 mM TRIS-2, 50 mM ammonium sulfate-3, 5 mM calcium chloride-4, 5 mM DTT-5, 0.01 % sodium azide-6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2PRU NMR Structure of Human apoS100B at 10C 提交 2007-05-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
2–92(91 aa)
链 B
2–92(91 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2;283 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM;压力 ambient
NMR样品组成
1-2 mM U-13C,U-15N S100B, 50 mM KCl, 90%H2O/10%D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.7 mM U-15N S100B, 50 mM KCl, 12 mg/ml PF1 Phage, 90%H2O/10%D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3CZT Crystal Structure of S100B in the Calcium and Zinc Loaded State at pH 9 提交 2008-04-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 X
1–92(92 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;291 K;0.02 M TAPS, pH 9.0, 30% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.222 |
| 3D0Y Crystal Structure of S100B in the Calcium and Zinc Loaded State at pH 6.5 提交 2008-05-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–92(92 aa)
链 B
1–92(92 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289 K;0.1 M MES pH 6.5 21% PEG5000MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.261 |
| 3D10 Crystal Structure of S100B in the Calcium and Zinc Loaded State at pH 10.0 提交 2008-05-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–92(92 aa)
链 B
1–92(92 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 10;291 K;0.02 M CAPS pH 10.0, 23% PEG5000MME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.275 |
| 3HCM Crystal structure of human S100B in complex with S45 提交 2009-05-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–92(92 aa)
链 B
1–92(92 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 S45 (3R)-3-[3-(4-chlorophenyl)-1,2,4-oxadiazol-5-yl]piperidine × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;298 K;0.1M sodium acetate, 0.02M calcium chloride, 45% methylpenthanediol, pH4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.311 |
| 4XYN X-ray structure of Ca(2+)-S100B with human RAGE-derived W61 peptide 提交 2015-02-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–92(92 aa)
链 B
1–92(92 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.8;293 K;0.1M Na cacodylate, pH 6.8, 25% w/v PEG 3350, 9mM CaCl2
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.254 |
| 4XYN X-ray structure of Ca(2+)-S100B with human RAGE-derived W61 peptide 提交 2015-02-02 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
1–92(92 aa)
链 D
1–92(92 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.8;293 K;0.1M Na cacodylate, pH 6.8, 25% w/v PEG 3350, 9mM CaCl2
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.254 |
| 5CSF S100B-RSK1 crystal structure A 提交 2015-07-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–92(92 aa)
链 B
1–92(92 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;0.1 M Hepes 7, 150 mM NaCl, 20% PEG6000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.291 |
| 5CSI S100B-RSK1 crystal structure A' 提交 2015-07-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–92(92 aa)
链 B
1–92(92 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;0.1 M Hepes 7, 150 mM NaCl, 20% PEG6000
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.250 |
| 5CSJ S100B-RSK1 crystal structure B 提交 2015-07-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–92(92 aa)
链 B
1–92(92 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;0.1 M Hepes 7, 150 mM NaCl, 20% PEG6000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.276 |
| 5CSN S100B-RSK1 crystal structure C 提交 2015-07-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–92(92 aa)
链 B
1–92(92 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;0.1 M Hepes 7, 150 mM NaCl, 20% PEG6000
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.279 |
| 5D7F X-ray structure of Ca(2+)-S100B with human RAGE-derived W72 peptide 提交 2015-08-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–92(92 aa)
链 B
1–92(92 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.8;293 K;100mM Na cacodylate pH 6.8, 22% w/v PEG 3350, 5mM CaCl2
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.183 |